Journal
/
Biologia
/
Burada: Silico Konakçı-Patojen Etkileşimleri Sırasında SirkRNA'ların Tanımlanması ve Karakterizasyonu
JoVE Journal
Biologia
Author Produced
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Biologia
In Silico Identification and Characterization of circRNAs During Host-Pathogen Interactions
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Burada: Silico Konakçı-Patojen Etkileşimleri Sırasında SirkRNA'ların Tanımlanması ve Karakterizasyonu

DOI:
10.3791/64565-v

•

10:27 min

•

October 21, 2022

•

, , ,
1Institute of Biological Sciences, Faculty of Science,Universiti Malaya, 2Centre for Research in Biotechnology for Agriculture (CEBAR),Universiti Malaya

Capítulos

  • 00:04Introduction
  • 01:02CircRNA Predictions
  • 01:46Differential Expression Analysis and Filtering of DE circRNAs
  • 03:26Predicting the circRNA-miRNA Interaction Using Circr
  • 05:05Construction of the ceRNA Network
  • 06:34Functional Enrichment Analysis
  • 07:49Results: Functional Analysis of DE circRNAs Parental Genes Using GO and KEGG Enrichment
  • 09:43Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Burada sunulan protokol, konakçı-patojen etkileşimlerini inceleyen RNA dizileme transkriptom verilerinden sirkRNA'ları tahmin etmek ve işlevsel olarak karakterize etmek için gereken in silico boru hattının tamamını açıklamaktadır.

Tags

Keywords: CircRNAHost-pathogen InteractionsIn Silico IdentificationCharacterizationBioinformaticsRNA-seq AnalysisDifferential Expression AnalysisCiriquantPrepDE.pyCiri DE ReplicateLinuxProgrammingProtocolWorkflow

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/64565?article_type=v

Spesifik endo-ve exoglycosidases kullanarak protein glikozilasyon tanımlanması ve karakterizasyonu
check_url/pt/64565?article_type=v

Saç Rejenerasyon sırasında epitelyal-mezenkimal Sinyal Rapid Genetik Analizi
check_url/pt/64565?article_type=v

Apoptotik hücresi Temizliği görüntülenmesi sırasında Canlı<em> Drosophila</em> Embriyo
check_url/pt/64565?article_type=v

EMBL de MultiBac Protein Complex Üretim Platformu
check_url/pt/64565?article_type=v

Mikrobiyal Tanımlama ve Karakterizasyonu için Pyrosequencing
check_url/pt/64565?article_type=v

Protein AKIL: A Tezgahı<em> Siliko olarak</em><em> De novo</emBiyomoleküllerin> Tasarım
check_url/pt/64565?article_type=v

Kimyasal Genetik Etkileşimleri Hızlı Kimlik<em> Saccharomyces cerevisiae</em
check_url/pt/64565?article_type=v

Arabidopsis Protein-DNA Etkileşimleri Tespiti için Kromatin Immunoprecipitation Deneyi<em> İn Vivo</em
check_url/pt/64565?article_type=v

Bitki organizatörü analizleri: Kimlik ve kök nodül belirli organizatörü ortak fasulye içinde karakterizasyonu
check_url/pt/64565?article_type=v

Helianthus Annuus'ta Büyük Ölçekli Termal Görüntüleme Taraması ile Bitki Transpirasyonunun Yeni Regülatörlerinin Belirlenmesi

Read Article