Количественный анализ Synaptic пополнение бассейна пузырьков в культуре нейронов мозжечка гранул использованием FM Красители

Summary

Жить флуоресценции метод визуализации количественного пополнения и мобилизации конкретных синаптических везикул (SV) бассейны в центральных нервных окончаний описано. Два раунда С. В. переработки контролируются в той же нервных окончаний обеспечения внутреннего контроля.

Abstract

After neurotransmitter release in central nerve terminals, SVs are rapidly retrieved by endocytosis. Retrieved SVs are then refilled with neurotransmitter and rejoin the recycling pool, defined as SVs that are available for exocytosis^1,2. The recycling pool can generally be subdivided into two distinct pools – the readily releasable pool (RRP) and the reserve pool (RP). As their names imply, the RRP consists of SVs that are immediately available for fusion while RP SVs are released only during intense stimulation^1,2. It is important to have a reliable assay that reports the differential replenishment of these SV pools in order to understand 1) how SVs traffic after different modes of endocytosis (such as clathrin-dependent endocytosis and activity-dependent bulk endocytosis) and 2) the mechanisms controlling the mobilisation of both the RRP and RP in response to different stimuli.

FM dyes are routinely employed to quantitatively report SV turnover in central nerve terminals^3-8. They have a hydrophobic hydrocarbon tail that allows reversible partitioning in the lipid bilayer, and a hydrophilic head group that blocks passage across membranes. The dyes have little fluorescence in aqueous solution, but their quantum yield increases dramatically when partitioned in membrane⁹. Thus FM dyes are ideal fluorescent probes for tracking actively recycling SVs. The standard protocol for use of FM dye is as follows. First they are applied to neurons and are taken up during endocytosis (Figure 1). After non-internalised dye is washed away from the plasma membrane, recycled SVs redistribute within the recycling pool. These SVs are then depleted using unloading stimuli (Figure 1). Since FM dye labelling of SVs is quantal¹⁰, the resulting fluorescence drop is proportional to the amount of vesicles released. Thus, the recycling and fusion of SVs generated from the previous round of endocytosis can be reliably quantified.

Here, we present a protocol that has been modified to obtain two additional elements of information. Firstly, sequential unloading stimuli are used to differentially unload the RRP and the RP, to allow quantification of the replenishment of specific SV pools. Secondly, each nerve terminal undergoes the protocol twice. Thus, the response of the same nerve terminal at S1 can be compared against the presence of a test substance at phase S2 (Figure 2), providing an internal control. This is important, since the extent of SV recycling across different nerve terminals is highly variable¹¹.

Any adherent primary neuronal cultures may be used for this protocol, however the plating density, solutions and stimulation conditions are optimised for cerebellar granule neurons (CGNs)^12,13.

Protocol

1. Мозжечка Подготовка Нейрон гранул Автоклав около 100 диаметром 25 мм покровные (табл. 1). Место покровные в 50 мл стерильной пробирку, содержащую стерильный поли-D-лизина раствор (табл. 2). Место на вращающейся платформе в течение 2 ч, чтобы покрыть покровные. Сухие покровные покрытием на стерильной салфеткой в ​​ламинарном боксе (табл. 1). Место в стерильные покровные 6-луночных планшетах и тепло в CO 2 инкубаторе (табл. 1). Покровные стекла могут храниться в течение 1 месяца при температуре 4 ° С до использования. Эвтаназии на 7 дней старые Sprague Dawley крысят в соответствии с местными этическими принципами Комитета. Мы эвтаназии щенков использованием шейки дислокации. Рассеките мозжечка и поместить его в стерильную чашку Петри, содержащую фосфатный буферный раствор соли (раствор Б, таблица 3). Повторите шаги 1,5 и 1,6 для 4-6 крысят. Cerebella затем помещают на стерильную стадию тканей McIlwain Чоpper (табл. 1). Ткань рубится в 375 мкм, интервалы перед поворотом этапе на 90 ° и повторяя процесс. Нарезанного cerebella передаются в раствор трипсина (решение Т, Таблица 4), которые ранее были нагревают до 37 ° C. Инкубируйте cerebella при температуре 37 ° С в течение 20 мин при легком помешивании примерно каждые 5 мин. Во время триптического пищеварения, пламя польский три стерильные пипетки стеклянные (табл. 1) с помощью пламени Бунзена. Использование пламени для создания тонких ствола, средний диаметр и широким отверстием в устье из пипетки. После 20 мин инкубации в растворе Т, добавить 20 мл трипсин / ингибитор ДНКазы решение (решение W, таблица 5), чтобы мозжечка подвески и гранул клеток в 1000 г в течение 1 мин в настольной центрифуге (табл. 1). Декантируйте супернатант и ресуспендируют осадок клеток в 1,5 мл концентрированного трипсин / ингибитор ДНКазы (раствор C, таблица 6), используя широкие отверстия пипетки. <li> Растирают клетки, используя первый широкий пипетки отверстия, то средний диаметр цилиндра и, наконец, малого диаметра, пока клеточная суспензия однородна. Это ключевой шаг, подвески должна быть однородной на данном этапе. Слой клеточной суспензии на вершине 10 мл предварительно нагретого (37 ° С), бычий сывороточный альбумин дополнен Earles сбалансированное решение солей (табл. 7) в 15 мл стерильной трубки. Центрифуга подвески в течение 5 мин при 1500 г и ресуспендируют осадок клеток в 2 мл предварительно нагретого (37 ° С) питательной среды (табл. 8). Оценка числа клеток использованием гемоцитометра (табл. 1) и разбавленных клеточной суспензии до конечной плотностью 3,3 • 10 6 клеток на мл. Клетки высевают путем добавления 75 мкл суспензии клеток в центре поли-D-лизина покрытием покровные (конечная плотность 2,5 х 10 5). Культуры чашки, содержащие покровные помещаются в CO 2 инкубаторе в течение 60 минут, чтобы позволить клеткамДере. Добавить 1,5 мл культуральной среды в каждую лунку, стараясь не беспокоить покрытием клеток и возвращение культуры пластины CO 2 инкубатора. На следующий день заменить культуральной среде со свежей питательной среды дополнены митотических ингибиторов цитозинарабинозид (табл. 8). Арестами пролиферация глиальных клеток в культуре. 2. Экспериментальная установка Основные экспериментальные установки должны состоять из следующих (см. таблицы 1 и 9 для конкретного оборудования и программного обеспечения): Перевернутый эпи-флуоресцентного микроскопа Охлаждением ПЗС-камеры Флуоресцентные источника света (монохроматор или фильтр колесо) Гравитация аппарата перфузии Изображения камеры с параллельными электродами платины Электростимуляторы Компьютер Программное обеспечение Image Acquisition Эксперименты должны быть выполнены в темноте или под красными дирижер светitions с минимальным флуоресцентного освещения образца, чтобы избежать FM красителя отбеливания. Эксперименты проводились при комнатной температуре. Если физиологической температуре не требуется, с регулируемой температурой перфузии система может быть использована. 3. Подготовка образцов Культуры должны быть использованы через 8-12 дней в лабораторных условиях. Передача одного покровное к физиологическим раствором (табл. 10) в течение 10 мин при комнатной температуре, чтобы стабилизация в новой среде. Удалить покровное, сухой его нижней и окрестностях прилагается клеток с небольшой кусочек бумажной салфеткой или фильтровальной бумагой. Использование силиконовой смазки (табл. 2), клей покровное к нижней стороне камеры изображений. Клетки должны быть между двух параллельных проводов. Достаточное силиконовой смазкой должна быть использована для уплотнения полностью камере, но без какого-либо жира ввода центре ванной камеру. Аккуратно заполните ванну камера с ~ 260 мкл саРешение линии, а затем заполнить входной трубки этим же раствором. Клей чистой покровное силиконовой смазкой для верхней части камеры, чтобы запечатать его. Входные и выходные трубы могут быть использованы для удаления пузырьков воздуха в ловушке камеры. Важно, что электрическая цепь не прерывается пузырьками воздуха. Зафиксируйте изображения камеры из нержавеющей стали платформой и проверить на наличие утечек, осторожно перфузии физиологического раствора через входную трубу. Горы собраны камеры на сцене инвертированного микроскопа, и подключить камеру к системе перфузии тяжести, предварительно загрунтовать входе с физиологическим раствором. Прикрепить соединительных проводов камеры к электрической стимулятора. Добавить каплю иммерсионного масла, чтобы цели, если нефть объектива. Сосредоточьтесь на клетки в середине камеры использованием яркого освещения поля. 4. S1 фазы Заливать нейронов с 1,5 млФ. М. красителя (табл. 2) разводят в физиологическом растворе. Стимулировать нейроны вызывают поглощение красителя по приложенному стимулятора. После стимуляции нейронов заливать свежей солевой раствор в течение 2 мин, чтобы смыть избыток FM красителем (расход 7 мл / мин). Глиальные загрязнения в системе культуры CGN составляет менее 5% 14, поэтому этот период времени достаточно, чтобы удалить краситель . Оставьте нейронов, чтобы отдохнуть в течение 8 мин. В течение этого интервала, найдите аксонального сетей, в которых отдельные FM красителя клеммами нерва видны использованием флуоресцеина длин волн (возбуждение, 480 нм, эмиссия,> 550 нм). Избегайте мест с группами клеток. Держите освещения до минимума на этот шаг, так как интенсивное возбуждение может привести к красителя фототоксичности. Очевидные признаки этого в настоящее blebbing аксонов и отсутствие красителя разгрузки (из-за фиксации красителя). Re фокусировки изображения непосредственно до получения изображения с небольшой дрейф, возможно, произошли в течение периода отдыха. </LI> Начните покадровой получения изображений со скоростью 1 кадр каждые 4 сек После приобретения 5 – 10 изображений базовой линии, вызывает экзоцитоз РРП, поставляя 30 Гц стимуляции в течение 2 с (60 потенциалы действия) 8 Приступить к стимуляции вручную сразу же после захвата кадров.. После приобретения еще 10 изображений, вызывают С. В. экзоцитоз RP с помощью трех стимуляции 40 Гц в течение 10 с (400 потенциалов действия), каждый 30 секунд друг от друга 8. Приобретать еще 5 – 10 изображений, а затем приобретение паузу изображение. 5. Восстановление фазы (см. рис 2) Разрешить нейронов для восстановления в течение не менее 20 мин. По желанию – Если влияние препарата на эндоцитоз для которого требуется проверить, заливать нейронов с наркотиками решение в течение этого периода (рис. 2, б) 3,8. 6. S2 фазы Повторите S1 протокол фазы (раздел 4) для контрольного эксперимента с использованием того же поля зрения, какв S1. По желанию – Если влияние препарата на эндоцитоз для которого требуется проверить, заливать нейронов с наркотиками решение дополнить FM красителя (рис. 2, б) 3,8. По желанию – Либо, если препарат влияние на экзоцитоза представляют интерес, заливать нейронов с наркотиками решение как до, так и во время ОРП и РП разгрузки раздражителей (рис. 2в) 3. 7. Анализ данных Используйте ImageJ и Microsoft Excel или подобное программное обеспечение для анализа данных. Для анализа последовательности изображений в формат стека не требуется. Некоторые изображения программное обеспечение может экспортировать последовательности, как одиночных изображений. Если это так, конвертировать изображения в стек с помощью ImageJ встроенной функцией Image> Стеки> изображений в стеке. Отрегулируйте яркость и контрастность стек максимального динамического диапазона. Image> Adjust> Brightness / Contrast (рис. 3а). Если значительное горизонтального дрейфа произошло во время тОн эксперимента, запустить StackReg ( http://bigwww.epfl.ch/thevenaz/stackreg/ ) и TurboReg ( http://bigwww.epfl.ch/thevenaz/turboreg/ ) плагинов на ImageJ для выравнивания изображения стека (рис. 3б) . Время выполнения серии анализатор плагин ( http://rsbweb.nih.gov/ij/plugins/time-series.html ) (рис. 3в). Определить регионы интерес (трансформирования) по меньшей мере, 90 нервных окончаний. Они должны быть идентичными (круговой трансформирования с 1,5 мкм в диаметре) Это полезно для переключения между изображениями до и после разгрузки красителя выявить активных нервных окончаний (или предварительной стимуляции изображение может быть вычтен из пост-стимуляции изображения). Идеальной ROI размер тот, который немного больше, чем типичный терминал нерва (рис. 3в). Получить общего числа / интегрированные интенсивности флуоресценции каждого ROI над Тимомэлектронной и экспорта в Microsoft Excel (рис. 3 и 4, а). Нормализовать ROI следы к тому же произвольное значение, совместив следы в плоскости Y-ось для первой выгрузки стимулом в обеих S1 и S2 фаз (рис. 4, б-в). Это необходимо для контроля за небольшие вариации в интенсивности фона флуоресценции. Измерить абсолютное снижение флуоресценции вызванные каждой разгрузки стимулом в произвольной флуоресценции агрегатов для S1 и S2 следующим образом (рис. 4, г): RRP = Изменение флуоресценции (ΔF) вызваны 30 Гц 2 с РП = Сумма ΔF вызваны 3 х 40 Гц 10 с Всего бассейн переработки = РРП + RP Для каждого соответствующего параметра в 7,9, вычислить среднее значение над всеми нервными окончаниями в одном эксперименте. Для статистического анализа, средние значения, полученные из нескольких независимых экспериментов могут быть усреднены. Число покровные, а не количество нервных терминалов должны использоваться в качестве STATISTICAЛ. Н. 8. Представитель Результаты: Контрольный эксперимент, где КСГН прошли два раунда идентичные шаги погрузки и разгрузки представлена ​​на рисунке 5. Когда начинается серия экспериментов, важно, чтобы контрольный эксперимент, такие как это выполняется каждый день, чтобы подтвердить, что S1 и S2 сопоставимы до различных экспериментальных условиях в течение S2. В этом примере, КСГН были загружены с 10 мкМ FM1-43 использованием 80 Гц 10 с стимуляции (рис. 5а). На рисунке 5б показывает FM1-43-загружалась нервных окончаний представлены флуоресцентные puncta. Трансформирования были определены более 90 нервных окончаний, как показано на рисунке 5c. Тот же набор трансформирования был использован как для S1 и S2. Во время обеих разгружает, РРП была впервые выгружены с 30 Гц (2 с) стимулирование последующей RP разгрузки с 3 последовательных 40 Гц (10 с) раздражителей (рис. 5а). Флуоресценции падения во время каждого раздражителя можно ясно наблюдать и количественно (рис. 5, г-е). Когда рассмотрели, флуоресценции капель соответствующие оправы, RP и общий бассейн переработки были сопоставимы в обеих S1 и S2. Кроме того, 20% переработанного спутников проживал в РРП в то время как 80% проживали в РП и в S1 и S2. Рисунок 1 Принципиальная схема типичной FM эксперимента. А) С. В. эндоцитоза срабатывает при наличии FM-красителя (представлены зеленым цветом). Красителя занимают инвагинирующий мембрана (один КА или оптовых эндосомы). Б) не внутренним красителя на мембране плазмы смыты перфузии. C) По заявлению разгрузки стимула, обозначенные спутников, которые становятся доступными для выпуска сливаются с плазматической мембраны в результате чего потери флуоресценции. D) изменение флуоресценции (ΔF), которая пропорциональна количеству выпускаемых меченых спутников может быть определена количественно. _upload/3143/3143fig2.jpg "/> Рисунок 2 Схемы возможных экспериментальных протоколов. А) Блок-схема контроля эксперимент, в котором клетки подвергаются два раунда FM красителя погрузки и разгрузки (S1 и S2). Клетки могут быть загружены с помощью ряда различных раздражителей. Разгрузка шаги идентичны тем, что RRP выгружается с 30 Гц в течение 2 с последующей RP выгрузить с использованием 3 раза 40 Гц в течение 10 с РРП и резервный пул разгрузки стимулы были разделены на 40 секунд, все другие раздражители на 30 сек. Клетки остаются восстановить в течение 20 минут между S1 и S2. Технологические схемы возможных модификаций для проверки эффекта какого-либо вещества по обе B) эндоцитоза или С) экзоцитоза также показаны. Корреспондент допинг-контроль может быть перфузии в камеру в течение указанного периода. Рисунок 3 Скриншоты из анализа данных в изображение J. Скриншоты приведеныза) настройка яркости и контраста, В) цикловой синхронизации, С) трансформирования выбор и D) значения интенсивности экстракции с использованием изображения J. Рисунок 4 Скриншоты из анализа данных в Microsoft Excel. Скриншоты приведены для) импорт исходных данных из изображений J (1-й столбец = номер кадра, остальные столбцы = данные от отдельных нервных окончаний) Б) корректировка S1 значений исходных данных (кадр 10) для произвольного значения (200) в начале первого стимула, С) корректировка S2 значения базовой в кадре 55 использованием идентичных протокола к S1, и D) измерение флуоресценции капель использованием Microsoft Excel. Обратите внимание, что усредненный след показано на D используется для определения момента времени до и после каждой капли. Размер капель флуоресценции для каждого ROI должны быть определены из значений таблицы показано на C. <img alt="Рисунок 5" srс = "/ files/ftp_upload/3143/3143fig5.jpg" /> Рисунок 5. Представитель контрольного эксперимента. А) Блок-схема контроля эксперимент, в котором КСГН были загружены 10 мкм FM1-43 с использованием 80 Гц (10 с) стимуляции. S1 и S2 фаз одинаковы. РРП и резервный пул разгрузки стимулы были разделены на 40 секунд, все другие раздражители на 30 сек. Б) изображение, показывающее нервных окончаний загружены FM1-43. С) и то же изображение, как показывает B 90 пронумерованных трансформирования, отобранных для анализа. D) Изображения области изображен красный прямоугольник в B в выбранных точках времени. Базальные = до раздражения, 30 Гц = 30 Гц после 2 сек стимуляция, 40 Гц = 1,2,3 после каждой стимуляции 40 Гц 10 с. Эти изображения представлены в псевдо-для иллюстрации изменений флуоресценции (спектр бар отображается в правой). Е) Среднее ± SEM следа получены от 90 нервных окончаний изображен в С. Индивидуальные стимулы представлены турники. Шкала баров = 10 мкм.

Discussion

FM красители широко используются для исследования функции нервов терминала во многих нейронов препаратов. Они были использованы главным образом для контроля степени либо эндоцитоза С. В., С. В. оборота или кинетики экзоцитоза ^6. Описанные протокол расширяет эти исследования для изучения дифференциальных разгрузке конкретных С. В. бассейнов. Это дает дополнительную информацию о пополнении С. В. бассейнов, а также их степень мобилизации.

FM-красители могут быть использованы для обозначения нескольких раундов С. В. переработки в пределах одного нервных окончаний. Мы использовали это свойство и предназначен протоколы, в которых С. В. оборот каждого терминала можно контролировать два раза в том же нервных окончаний. Это обеспечивает точный внутренний контроль, который необходим из-за неоднородного характера утилизации SV параллельно нервных окончаний ^11. Через использование S1 фазы внутреннего контроля, заправки РРП, РП и общегоС. В. бассейн в наличии препараты могут быть надежно и напрямую сравнивать.

В дополнение к предоставлению информации абсолютный размер утилизации, РРП и RP бассейны в различных условиях стимуляции, этот протокол также может предоставить данные в следующих – 1) Разделение спутников между РРП и РП в зависимости от переработки бассейн S1 и S2, 2) относительный размер S2 бассейнов (RRP и RP) в зависимости от общего числа S1 бассейн утилизации и 3) относительный размер какой-либо определенной С. В. бассейн в S2 в зависимости от одного пула в S1. Данный протокол не будет предоставлять информацию о разгрузке кинетики однако, так как время сбора данных слишком медленная (для кинетических измерений приобретения раз должно быть как можно быстрее и разгрузки автоматически синхронизированы с захвата изображения).

Наш 30 Гц 2 с стимулами вызывает идентичные степени RRP разгрузки гипертонической сахарозы ^8. Поскольку размер оправыопределяется гипертонической сахарозы разгрузки ^15, мы можем констатировать, что этот протокол выгружает все RRP спутников, в согласии с исследованиями в нейронах гиппокампа ^16. Резервного пула почти полностью истощены три поезда из 400 стимулов (40 Гц 10 с каждого), так как это стимуляция выгружает одинаковое количество красителя парадигмы (2 стимулы с 50 мМ KCl), которые истощают 95% всех красителей меченных спутников ^8,17. Точная количественная оценка размера и РРП и резервный пул также зависит от получения информации в линейный динамический диапазон ПЗС-камерой.

Это простой протокол также может быть изменена в дальнейшем. Сила загрузки стимулы также могут быть разнообразны, чтобы определить, каким образом активность нейронов и различные режимы эндоцитоза влияют С. В. бассейн пополнения. Кроме того, более двух циклов погрузки и разгрузки могут быть выполнены, если потребуется. Этот протокол также может быть использован в клетках, трансфицированных либо гиперэкспрессия илиshRNA векторов. Из-за низкой эффективности трансфекции первичных нейронов культур, выраженная белки должны быть помечены флуоресцентным белкам. Важно, чтобы эти флуоресцентные метки не мешали FM сигнала красителя (использование голубого или красного белков, например). В этом случае, нервные окончания от трансфицированных и не трансфекции клеток в одном поле зрения, можно также сопоставить в качестве дополнительного контроля ^8. В таких экспериментах сравнение степени загрузки между S1 и S2 нагрузки не имеет большого значения, так как возмущения присутствует как во время нагрузок. Разбиение красителя между бассейнами С. В. все еще ​​может быть визуализированы Однако ^8.

Генетические журналистам называется pHluorins также может быть использован для контроля С. В. экзоцитоз и эндоцитоз в первичных нейронов культуры. Эти зонды использование рН-чувствительных зеленого флуоресцентного белка рН среды просвета области С. В. меченых белков, таких как VAMP, synaptophysin и VGLUT1 ¹⁸ </suр>. При использовании в сочетании с ингибиторами везикулярного АТФазы, pHluorins могут сообщать как на кинетику и степень мобилизации С. В. бассейн ^19. FM-чернила на основе красителя Описанный здесь подход имеет некоторые преимущества по сравнению с техникой pHluorin, во-первых, FM красителей предоставить информацию о которых С. В. эндоцитоза режиме пополняется РРП и резервные бассейны ^8. Во-вторых конкретные С. В. бассейны могут быть помечены FM красителей, которые имеют различные спектральные свойства ²⁰ и, наконец, не существует никаких требований для трансфекции. FM красители не могут предоставить информацию о С. В. трафика между отдыха и переработки С. В. бассейны однако (в отличие от pHluorins ^19), так как по определению спутников должны быть загружены с красителем во время эндоцитоза, чтобы быть видимыми. Таким образом, оба FM красителей и pHluorins имеют сильные и слабые стороны и наиболее эффективны, когда используются в независимых экспериментах на адрес тот же вопрос.

Изображения высокого качества имеют важное значение для анализа и действительным reproducibле результаты. Хотя горизонтального дрейфа может быть легко исправлена, экспериментов, где есть дрейф в Z-оси, не могут быть восстановлены. По этой причине важно, чтобы переориентировать изображений до начала S1 и S2 разгружается. В случаях, когда значительная флуоресцентные распад произошел, распад поправки могут быть применены (как правило, путем вычитания ранее записанный след от FM-загруженных клеток в отсутствие стимуляции). Тем не менее, предполагается, что распад коррекция выполняется только для графического представления и не должны использоваться для любого количественного анализа.

Materials

Name	Company	Catalogue no.
AxioCam MRm Rev. 3 Digital Camera	Carl Zeiss	4265099901000
Axio Observer.A1 Microscope	Carl Zeiss	4310040000000
Cell culture plates (6 wells)	Greiner bio-one	657160
Centrifuge (Universal 32R)	Hettich Zentrifugen	1610
CO2 incubator	Heraeus Instruments	51014042
Falcon tubes (15/50 ml)	Greiner bio-one	188271/210261
Fluar 20X /0.75 ∞/0.17 Objective	Carl Zeiss	4401459901000
Glass coverslips (Ø25mm)	VWR international	631-1584
Glass pasteur pipettes (230 nm)	Greiner bio-one	612-1799
Haemocytometer	VWR	15170-170
Imaging chamber	Warner	RC-21 BRFS
Laminar flow hood	BIOHIT	VLF BHS 1200
McIlwain Tissue Chopper	Mickle Laboratory Engineering Co. Ltd.	MTC/2
Mercury lamp	Carl Zeiss	HBO 103
MultiStim System Electrical Stimulator (100mV, 1ms pluse width)	Digitimer Ltd.	D330
Perfusion pump	Watson-Marlow	313S
Serological Pipettes (5/10/25 ml)	Greiner bio-one	606180/607180/760180
Shutter controller	Carl Zeiss	MAC5000
Syringe (20 ml)	BD Plastipak	ST01-B002
Syringe Filters (Minisart – 0.20 μm)	Sartorius Stedim	16532
VC-6 Six Channel valve controller	Warner	64-0135
YFP Filter set (Set 46)	Carl Zeiss	1196-681

Table 1. Specific equipment and apparatus used

Name	Company	Catalogue no.	Concentration
FM1-43	Cambridge BioScience	BT70021	10 μM
FM2-10	Cambridge BioScience	BT70044	100 μM
Poly-D-lysine	Sigma	P7886	15 μg/ml
Silicone grease	Sigma	85403	–

Table 2. Specific reagents used

Name	Company	Catalogue no.	Concentration
Bovine Serum Albumin (BSA)	Sigma	A4503	0.3%
D-Glucose	Sigma	G5767	0.25%
MgSO4·7H2O	Sigma	M2773	1.5 mM
D-PBS	Gibco	21300	960 mg/100 ml

-make 100ml fresh for each preparation
-sterile filter before use

Table 3. Solution B for CGN preparation

Name	Company	Catalogue no.	Concentration
Solution B	–	–	19 ml
Trypsin (5 mg/ml stock, -20°C)	Sigma	T9201	1 ml

Table 4. Solution T for CGN preparation

Name	Company	Catalogue no.	Concentration
Solution C	–	–	3.2 ml
Solution B	–	–	16.8 ml

Table 5. Solution W for CGN preparation

Name	Company	Catalogue no.	Concentration
Deoxyribonuclease (DNase, 500 U per 0.5 ml stock, -20°C)	Sigma	D5025	0.5 ml
MgSO4· 7H2O	Sigma	M2773	1.5 mM
Solution B	–	–	10 ml
Soybean trypsin inhibitor (SBTI, 0.5 mg per 0.5 ml stock, -20°C)	Sigma	T9003	0.5 ml

Table 6. Solution C for CGN preparation

Name	Company	Catalogue no.	Concentration
Bovine Serum Albumin (BSA)	Sigma	A4503	4%
Earle’s Balanced Salt Solution (EBSS)	Gibco	24010	10 ml
MgSO4· 7H2O	Sigma	M2773	3 mM

Table 7. EBSS Solution for CGN preparation

Name	Company	Catalogue no.	Concentration
Cytosine β-D-arabinofuranoside (Ara-C) *	Sigma	C1768	10 μM
Foetal Bovine Serum	Gibco	10106	10 %
D-Glucose	Sigma	G5767	30 mM
L-Glutamine	Sigma	G3126	2 mM
KCl	Sigma	P5405	25 mM
Minimal Essential Medium (MEM)	Gibco	21090	500 ml
Penicillin (P)/Streptomycin (S)	Gibco	15140	100 U/ml (P), 100 μg/ml (S)

*Ara-C should be added to medium from 1 DIV onwards

Table 8. Culture Media for CGN preparation

Name	Version	Company
AxioVision Rel.	4.8	Carl Zeiss
ImageJ	1.42q	National Institutes of Health
Microsoft Excel	2003	Microsoft

Table 9. Specific computer software used

Name	Company	Catalogue no.	Concentration
CaCl2 · 2H2O	Sigma	C7902	1.3 mM
Glucose	Sigma	G5767	5 mM
KCl	Sigma	P5405	3.5 mM
KH2PO4	Sigma	P9791	0.4 mM
MgCl2·6H2O	Sigma	M0250	1.2 mM
NaCl	Fluka	71378	170 mM
NaHCO3	Fluka	71627	5 mM
Na2SO4	BDH Laboratory Supplies	10264	1.2 mM
TES	Sigma	T1375	20 mM

Table 10. Saline Solution (pH 7.4)