タンパク質 - タンパク質相互作用を研究するために磁気ビーズを用いて液相アフィニティキャプチャーアッセイ：ポリオ-nanobodyの例
Summary
この記事では、単純な、定量、液相の親和性捕捉アッセイが提示されています。それは一方では、磁気ビーズとタグ融合タンパク質（例えば、ナノボディ）との間の相互作用や他のタグ付きタンパク質と第二、標識タンパク質（例えば、ポリオウイルス）との間の親和性に基づく信頼性の高い手法である。
Abstract
この記事では、単純な、定量、液相の親和性捕捉アッセイが提示されています。一つのタンパク質をタグ付けすることができます提供され、別のタンパク質が標識され、このメソッドは、タンパク質 – タンパク質相互作用の調査のために実装することができます。これは、コバルト被覆磁性ビーズによるタグ付きタンパク質の認識に、タグ付きタンパク質と標識された第2の特異的なタンパク質間の相互作用で一方一方に基づいています。最初に、ラベルとタグ融合タンパク質を混合し、室温でインキュベートされています。タグを認識した磁性ビーズは、追加され、標識タンパク質の結合画分は、磁石を使用して非結合画分から分離されています。キャプチャされた標識タンパク質の量は、非結合画分に残った標識タンパク質の信号を測定することにより、間接的な方法で決定することができます。コンフォメーションの変換に敏感なタンパク質が尻である場合に記載の液相親和性アッセイは、非常に便利です。ayed。アッセイの開発とアプリケーションがポリオウイルスとナノボディ1を認識してポリオウイルスの間の相互作用を実証しています。ポリオウイルスは、固体表面（未発表データ）に接続されたコンフォメーションの変換2〜敏感であるため、ELISAの使用が制限されており、液相ベースのシステムは、したがって、優先されるべきである。しばしばpolioresearch 3,4で使用されている液相ベースのシステムの例としては、マイクロタンパク質免疫沈降テスト5です。このテストは、その適用性を実証しているにもかかわらず、それが6,7ナノボディで不在であるFcの構造を必要とします。ただし、別の機会として、これらの興味深いかつ安定した単一ドメイン抗体8は簡単に別のタグを使用して設計することができます。広く（彼の）6-tagはそのような自分の順番で簡単に磁気ビーズ上にコーティングすることができ、ニッケルやコバルトなどの二価イオンに対する親和性を示しています使用されます。したがって、我々はこの単純な定量を開発しましたコバルト被覆磁性ビーズに基づく親和性捕捉アッセイ。ポリオウイルスは、ナノボディで妨害さの相互作用を有効にして定量的な検出が可能にする35 Sで標識した。メソッドは、実行が容易で、さらに効果的に再生磁気ビーズの可能性によってサポートされている、低コストで確立できます。
Protocol
Discussion
プロトコルでは、nanobodyのと相互作用する抗原の放射能を上清からの放射標識されたウイルスの損失として定義されています。したがって、沈殿した放射能（= 100 – ％）の量は、（磁気ビーズに結合した）上清中の放射能（=％）で間接的な方法で推定することができます。その一方で、それは500 mMのイミダゾールを用いた磁気ビーズから免疫複合体を溶出することにより直接的な方法で?…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
著者らは、放射性標識されたウイルスを調製するための医薬バイオテクノロジーと分子生物学の部門、特にモニーク·デ·Pelsmackerのスタッフに感謝します。私たちは、エレン·メルクスとその興味深い発言や議論のためにHadewych Halewyckに、ラボで彼の助けのためのヘリット·デ·Bleeserに感謝しています。この作品は、財政的にブリュッセル自由大学（OZR1807）、フォンvoor Wetenschappelijk Onderzoekブラーンデレン（G.0168.10N）と世界保健機関（TSA 200410791）のOZRの助成金によって支えられている。リセSchotteはフォンvoor Wetenschappelijk Onderzoekブラーンデレン（FWO）の博士号を取得する前の仲間です。
Materials
| Name of the reagent | Company | Catalogue number | Comments |
| Dynabeads His-Tag Isolation and Pulldown | Invitrogen | 101.03D | Magnetic beads |
| Optiphase ‘HiSafe’ 2 | Perkin Elmer | 1200 – 436 | Scintillation fluid |
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