Summary

Whole-body Espectrometria de Massa de imagem por infravermelhos matriz assistida por laser de Dessorção Ionização por Electrospray (IR-MALDESI)

Published: March 24, 2016
doi:

Summary

A mass spectrometry imaging (MSI) source operated at atmospheric pressure was developed by coupling mid-infrared laser desorption and electrospray post-ionization. Exogenous ice matrix was used as the energy-absorbing matrix to facilitate resonant desorption of tissue-related material. This manuscript provides a step-by-step protocol for performing IR-MALDESI MSI of whole-body neonatal mouse.

Abstract

fontes de ionização ambiente para a espectrometria de massa (MS) foram objecto de muito interesse nos últimos dez anos. Laser assistida por matriz desorção com ionização por electrospray (MALDESI) é um exemplo de tais métodos, onde as características de laser assistida por matriz dessorção / ionização (MALDI) (por exemplo, a natureza de impulsos de dessorção) e ionização por electrospray (ESI) (por exemplo, macio-ionização ) são combinados. Uma das principais vantagens da MALDESI é a sua versatilidade inerente. Em experiências MALDESI, uma luz ultravioleta (UV) ou um laser de infravermelhos (IR) pode ser usado para excitar um ressonantemente matriz endógena ou exógena. A escolha da matriz não é analito dependente, e depende unicamente do comprimento de onda do laser usado para a excitação. Em experiências de RI-MALDESI, uma fina camada de gelo é depositado na superfície da amostra, tal como uma matriz de absorção de energia. A geometria da fonte de IV-MALDESI foi optimizado utilizando a concepção estatística de experiências (DOE) para análise de amostras líquidas, bem como Biolespécimes de tecidos ogical. Além disso, uma fonte de imagem robusta IR-MALDESI foi desenvolvido, em que um laser sintonizável mid-IV é sincronizado com um estágio de translação XY controlado por computador e um espectrómetro de massa de alta resolução de energia. A interface de usuário personalizada gráfica (GUI) permite ao usuário selecionar a taxa de repetição do laser, número de tiros por voxel, etapa do tamanho do estágio da amostra, e o atraso entre a dessorção e digitalizar eventos para a fonte. IR-MALDESI tem sido utilizado em várias aplicações, tais como a análise forense de fibras e corantes e MSI de secções de tecidos biológicos. Distribuição dos diferentes analitos que variam de metabolitos endógenos aos xenobióticos exógenos dentro de secções de tecido podem ser medidos e quantificados usando esta técnica. O protocolo apresentado neste manuscrito descreve os principais passos necessários para IR-MALDESI MSI de secções de tecido de corpo inteiro.

Introduction

Massa imagiologia espectrometria (MSI) no modo de desorção de microssonda envolve a amostra a partir de uma superfície por um feixe (laser ou iões) em localizações discretas sobre a superfície de uma amostra. Em cada ponto de quadriculação, um espectro de massa é gerado e os espectros adquiridos, juntamente com a localização espacial a partir do qual eles foram recolhidos, pode ser utilizado para mapear simultaneamente vários analitos numa amostra. Esta forma livre de rótulo de imagens acoplado à sensibilidade e especificidade de espectrometria de massa ajudaram a MSI tornou um dos campos mais rápida evolução em espectrometria de massa 1,2.

assistida por matriz de dessorção / ionização por laser (MALDI) é o método de ionização mais comum utilizado para análises de MSI. No entanto, a necessidade de uma matriz orgânica e os requisitos de vácuo de MALDI representam limitações significativas na reprodutibilidade, o manuseamento das amostras, e os tipos de amostras que podem ser analisadas utilizando o método. Uma série de pressão atmosférica (AP) iométodos nização têm sido desenvolvidos nos últimos anos para contornar essas restrições 3. Estes métodos de ionização ambiente permitir a análise de amostras biológicas em um ambiente que é muito mais perto de seu estado natural e simplificar amostra etapas de preparação antes da análise. Assistida de laser-dessorção matriz de ionização por electropulverização (MALDESI) é um exemplo de um tal método de ionização de 4,5.

Em experiências de RI-MALDESI, uma fina camada de gelo é depositado sobre a superfície do tecido como a matriz de absorção de energia. Um pulso de laser meados de IR é absorvida pela matriz de gelo, e facilita a dessorção de materiais neutros a partir da superfície por ressonantemente excitar o modo de OH de água alongamento. A partição neutros dessorvida nas gotículas carregadas de um electrospray ortogonal e são pós-ionizado de forma ESI-like 4-6. A adição de gelo matriz exógena é preferível a confiar apenas na água endógeno nos tecidos, uma vez que ajuda a ACcontam para variações de teor de água em diferentes compartimentos de tecidos, e tem sido mostrado para melhorar dessorção 6 e melhorar a abundância de iões por ~ 15 vezes 7,8 em experiências de imagiologia de tecidos.

Neste trabalho, nós utilizamos IR-MALDESI MSI para provocar a distribuição de metabólitos em diferentes órgãos de todo o corpo do rato neonatal. Uma visão geral dos parâmetros ajustáveis ​​de fonte IR-MALDESI é dado, e as medidas necessárias para a imagem latente bem sucedida de cortes de tecido são demonstrados.

Protocol

Nota: O protocolo a seguir descreve todos os passos necessários para a realização de experimentos IR-MALDESI MSI. Em profundidade detalhes sobre a geometria otimizada da fonte de IR-MALDESI e sua sincronização com o laser, palco, e espectrômetro de massa pode ser encontrada em outros lugares 5,6. amostras de tecido animal utilizados neste protocolo foram obtidos de acordo com a Institutional Animal Care e Use Committee (IACUC) e regulamentos North Carolina State University. 1….

Representative Results

As imagens apresentadas na Figura 4 mostram a distribuição espacial dos metabolitos em diferentes órgãos na secção de tecido do corpo inteiro. Valores exclusivos m / z para regiões específicas do corpo foram encontrados usando MSiReader PeakFinder, seguido de processamento em lote para a geração de imagem. A ferramenta de imagem de sobreposição (Figura 3-4) foi utilizado para alinhar a imagem óptica tomadas antes de deposição de m…

Discussion

O protocolo acima descreve as principais etapas para a realização de um experimento IR-MALDESI MSI. O processo de aplicação de matriz (secção 3) leva aproximadamente 20 minutos, o que é semelhante a um processo de aplicação de matriz típico para experiências MALDI MSI por sublimação ou de revestimento por pulverização usando um pulverizador robótico. Além disso, IR-MALDESI não depende de particionamento de analitos para os cristais de matriz 6, e a matriz de gelo pode ser usado universalment…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

The authors thank Professor H. Troy Ghashghaei from NCSU Department of Molecular Biomedical Sciences for providing the whole mouse tissue. The authors also gratefully acknowledge the financial assistance received from National Institutes of Health (R01GM087964), the W.M. Keck foundation, and North Carolina State University.

Materials

IR-MALDESI Source Custom-made N/A Please refer to references 4 and 12 for an in-depth discussion of IR-MALDESI source development.
Q Exactive Plus  Thermo Scientific Q Exactive Plus Hybrid Quadrupole-Orbitrap Mass Spectrometer
Water, HPLC Grade Burdick & Jackson  AH365-4
Methanol, HPLC Grade Burdick & Jackson  AH230-4
Formic Acid Sigma Aldrich  56302
Tunable mid-IR Laser Opotek Inc. IR Opolette Tunable 2700-3100 nm IR OPO laser
Nitrogen Gas Arc3 Gases AG S-NI300-5.0 Grade 5.0 high purity nitrogen gas cylinder (300)
Cryostat Leica Biosystems CM 1950 Cryomicrotome
High Profile Microtome Blades Leica Biosystems 3802123 Leica DB80HS
Mounting Medium (OCT) Leica Biosystems 3801480 Surgipath FSC 22 mounting medium
Cryostat Specimen Disc Leica Biosystems 14047740045 40 mm diameter
Glass Microscope Slides VWR 48312-003 Frosted, selected, pre-cleaned

References

  1. Mcdonnell, L. A., Heeren, R. M. A. Imaging Mass Spectrometry. Mass Spectrom. Rev. 26, 606-643 (2007).
  2. Chughtai, K., Heeren, R. M. A. Mass spectrometric imaging for biomedical tissue analysis. Chem. Rev. 110 (5), 3237-3277 (2010).
  3. Robichaud, G., Barry, J. A., Muddiman, D. C. Atmospheric Pressure Mass Spectrometry Imaging. Encycl. Anal. Chem. , (2014).
  4. Sampson, J. S., Hawkridge, A. M., Muddiman, D. C. Generation and detection of multiply-charged peptides and proteins by matrix-assisted laser desorption electrospray ionization (MALDESI) Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 17 (12), 1712-1716 (2006).
  5. Robichaud, G., Barry, J. A., Garrard, K. P., Muddiman, D. C. Infrared matrix-assisted laser desorption electrospray ionization (IR-MALDESI) imaging source coupled to a FT-ICR mass spectrometer. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 24 (1), 92-100 (2013).
  6. Robichaud, G., Barry, J. A., Muddiman, D. C. IR-MALDESI Mass Spectrometry Imaging of Biological Tissue Sections Using Ice as a Matrix. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 25 (3), 319-328 (2014).
  7. Barry, J. A., et al. Mapping Antiretroviral Drugs in Tissue by IR-MALDESI MSI Coupled to the Q Exactive and Comparison with LC-MS/MS SRM Assay. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 25 (12), 2038-2047 (2014).
  8. Rosen, E. P., Bokhart, M. T., Ghashghaei, H. T., Muddiman, D. C. Influence of Desorption Conditions on Analyte Sensitivity and Internal Energy in Discrete Tissue or Whole Body Imaging by IR-MALDESI. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 26, 899-910 (2015).
  9. Nelson, K. A., Daniels, G. J., Fournie, J. W., Hemmer, M. J. Optimization of whole-body zebrafish sectioning methods for mass spectrometry imaging. J. Biomol. Tech. 24 (3), 119-127 (2013).
  10. Park, J. J., Cunningham, M. G. Thin sectioning of slice preparations for immunohistochemistry. J. Vis. Exp. (3), e194 (2007).
  11. Bokhart, M. T., Rosen, E., Thompson, C., Sykes, C., Kashuba, A. D. M., Muddiman, D. C. Quantitative mass spectrometry imaging of emtricitabine in cervical tissue model using infrared matrix-assisted laser desorption electrospray ionization. Anal. Bioanal. Chem. 407 (8), 2073-2084 (2015).
  12. Nazari, M., Muddiman, D. C. Polarity Switching Mass Spectrometry Imaging of Healthy and Cancerous Hen Ovarian Tissue Sections by Infrared Matrix-Assisted Laser Desorption Electrospray Ionization (IR-MALDESI). Analyst. 141, 595-605 (2016).
  13. Hsu, C. C., et al. Design and Application of a Low-Temperature Peltier-Cooling Microscope. J. Pharm. Sci. 85 (1), 70-74 (1996).
  14. Jurchen, J. C., Rubakhin, S. S., Sweedler, J. V. MALDI-MS imaging of features smaller than the size of the laser beam. J. Am. Soc.Mass Spectrom. 16 (10), 1654-1659 (2005).
  15. Nazari, M., Muddiman, D. C. Cellular-level mass spectrometry imaging using infrared matrix-assisted laser desorption electrospray ionization (IR-MALDESI) by oversampling. Anal. Bioanal. Chem. 407 (8), 2265-2271 (2015).
  16. Rosen, E. P., Bokhart, M. T., Nazari, M., Muddiman, D. C. Influence of C-Trap Ion Accumulation Time on the Detectability of Analytes in IR-MALDESI MSI. Anal. Chem. 87, 10483-10490 (2015).
  17. Kessner, D., Chambers, M., Burke, R., Agus, D., Mallick, P. ProteoWizard: open source software for rapid proteomics tools development. Bioinformatics. 24 (21), 2534-2536 (2008).
  18. Schramm, T., et al. ImzML – A common data format for the flexible exchange and processing of mass spectrometry imaging data. J. Proteomics. 75 (16), 5106-5110 (2012).
  19. Race, A. M., Styles, I. B., Bunch, J. Inclusive sharing of mass spectrometry imaging data requires a converter for all. J. Proteomics. 75 (16), 5111-5112 (2012).
  20. Robichaud, G., Garrard, K. P., Barry, J. A., Muddiman, D. C. MSiReader: an open-source interface to view and analyze high resolving power MS imaging files on Matlab platform. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 24 (5), 718-721 (2013).
  21. Smith, C. A., O’Maille, G., et al. METLIN: a metabolite mass spectral database. Ther. Drug. Monit. 27 (6), 747-751 (2005).
  22. Sud, M., et al. LMSD: LIPID MAPS structure database. Nucleic Acids Res. 35, D527-D532 (2007).
  23. Schwartz, S. A., Reyzer, M. L., Caprioli, R. M. Direct tissue analysis using matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry: practical aspects of sample preparation. J. Mass Spectrom. 38 (7), 699-708 (2003).
  24. Takai, N., Tanaka, Y., Inazawa, K., Saji, H. Quantitative analysis of pharmaceutical drug distribution in multiple organs by imaging mass spectrometry. Rapid Commun. Mass Spectrom. 26 (13), 1549-1556 (2012).
  25. Liu, J., Gingras, J., Ganley, K. P., Vismeh, R., Teffera, Y., Zhao, Z. Whole-body tissue distribution study of drugs in neonate mice using desorption electrospray ionization mass spectrometry imaging. Rapid Commun. Mass Spectrom. 28 (2), 185-190 (2014).

Play Video

Cite This Article
Nazari, M., Bokhart, M. T., Muddiman, D. C. Whole-body Mass Spectrometry Imaging by Infrared Matrix-assisted Laser Desorption Electrospray Ionization (IR-MALDESI). J. Vis. Exp. (109), e53942, doi:10.3791/53942 (2016).

View Video