Summary

Multi-steg varierande höjd Fotolitografi för Ventilförsedda Multilayer Mikrofluidikanordningar

Published: January 27, 2017
doi:

Summary

Multilayer microfluidic devices often involve the fabrication of master molds with complex geometries for functionality. This article presents a complete protocol for multi-step photolithography with valves and variable height features tunable to any application. As a demonstration, we fabricate a microfluidic droplet generator capable of producing hydrogel beads.

Abstract

Microfluidic systems have enabled powerful new approaches to high-throughput biochemical and biological analysis. However, there remains a barrier to entry for non-specialists who would benefit greatly from the ability to develop their own microfluidic devices to address research questions. Particularly lacking has been the open dissemination of protocols related to photolithography, a key step in the development of a replica mold for the manufacture of polydimethylsiloxane (PDMS) devices. While the fabrication of single height silicon masters has been explored extensively in literature, fabrication steps for more complicated photolithography features necessary for many interesting device functionalities (such as feature rounding to make valve structures, multi-height single-mold patterning, or high aspect ratio definition) are often not explicitly outlined.

Here, we provide a complete protocol for making multilayer microfluidic devices with valves and complex multi-height geometries, tunable for any application. These fabrication procedures are presented in the context of a microfluidic hydrogel bead synthesizer and demonstrate the production of droplets containing polyethylene glycol (PEG diacrylate) and a photoinitiator that can be polymerized into solid beads. This protocol and accompanying discussion provide a foundation of design principles and fabrication methods that enables development of a wide variety of microfluidic devices. The details included here should allow non-specialists to design and fabricate novel devices, thereby bringing a host of recently developed technologies to their most exciting applications in biological laboratories.

Introduction

Under de senaste 15 åren, har mikrofluidik som ett fält genomgått en snabb tillväxt, med en explosion av ny teknik som möjliggör manipulering av vätskor på mikrometerskala 1. Mikroflödessystem är attraktiva plattformar för våt laboratorie funktionalitet eftersom små volymer har potential att förverkliga ökad hastighet och känslighet, medan samtidigt dramatiskt öka genomströmningen och minska kostnaderna genom att utnyttja skalfördelar två, tre. Multilayer mikroflödessystem har gjort särskilt betydande effekter i hög genomströmning biokemiska analysapplikationer såsom enda cell analys 4, 5, 6, enda molekyl analys (t.ex. digital PCR 7), proteinkristallografi 8, transkriptionsfaktor bindningsanalyserf "> 9, 10, och cellulära screening 11.

Ett centralt mål för mikrofluidik har varit utvecklingen av "lab on a chip" enheter som kan utföra komplexa fluid manipulationer inom en enda enhet för total biokemisk analys 12. Utvecklingen av flerskikts mjuk litografitekniker har hjälpt förverkliga detta mål genom att möjliggöra skapandet av on-chip ventiler, blandare och pumpar för att aktivt styra vätskor i små volymer 13, 14, 15. Trots sina fördelar och visat program, många av dessa mikroflödesteknik fortfarande till stor del outnyttjad av icke-specialister användare. Utbredd har varit utmanande delvis på grund av begränsad tillgång till mikrotillverkningsanläggningar, men också på grund av bristande kommunikation av tillverkningstekniker. Detta gäller särskilt for skiktsmikroflödes enheter med strukturer för ventiler eller komplexa geometrier: bristen på detaljerade, praktisk information om viktiga designparametrar och tillverkningstekniker avskräcker ofta nya forskare från att gå ombord på projekt som omfattar design och skapande av dessa enheter.

Denna artikel syftar till att åtgärda detta kunskapsluckorna genom att presentera en komplett protokoll för att göra flerskiktsmikroflödessystem enheter med ventiler och varierande höjd funktioner, från designparametrar och rör sig genom alla tillverkningssteg. Genom att fokusera på de inledande fotolitografiska stegen tillverkning kompletterar detta protokoll andra mikrofluidik protokoll 16 som beskriver nedströms steg för gjutning enheter från formar och kör specifika experiment.

Mikrofluidanordningar med monolitisk on-chip ventiler består av två skikt: ett "flöde" skikt, där fluiden av intresse manipuleras i mikrokanaler, och en "kontroll" skikt, där mikrokanaler som innehåller luft eller vatten selektivt kan modulera fluidflödet i flödesskiktet 14. Dessa två skikt är vardera tillverkade på en separat kiselformnings mästare, som därefter används för polydimetylsiloxan (PDMS) replika gjutning i en process som kallas "mjuk litografi 17." För att bilda en flerskiktsanordning, är var och en av PDMS skikten gjutna på deras respektive formnings mästare och sedan i linje med varandra, för att därigenom bilda en komposit PDMS enhet med kanaler i varje skikt. Ventiler är utformade på platser där flödes- och styrkanalerna korsar varandra och är åtskilda av endast ett tunt membran; trycksättning av styrkanalen deflekterar detta membran för att täppa flödeskanalen och lokalt förskjuta fluid (Figur 1).

Aktiva on-chip ventiler kan tillverkas på flera olika sätt, beroende på den önskade slutliga tillämpningen. ventilerkan konfigureras i antingen en "push down" eller "push up" geometri, beroende på om kontrollskiktet är över eller under den flödesskiktet (Figur 1) 15. "Push up" geometrier möjliggöra lägre stängningstryck och högre stabilitet enheten mot delaminering, medan "push down" geometrier möjliggöra flödeskanalerna att vara i direkt kontakt med det bundna substratet, som ger fördelen av selektiv funktionalisering eller mönstring av substratytan för senare funktionalitet 18, 19.

Ventiler kan också vara antingen avsiktligt läckande "sikt" ventiler eller fullständigt förslutbar, beroende på tvärsnittsprofilen av strömningskanalen. Sikt ventiler är användbara för infångande pärlor, celler eller andra macroanalytes 1, och är tillverkade genom användning av typiska negativa fotoresister (dvs., SU-8-serien), som have rektangulära profiler. När en styrkanal trycksättes över dessa ventil regioner, PDMS membranet mellan manöverorganet och strömningsskikt böjer isotropiskt i den rektangulära profilen av ventilen utan att klistras hörnen, som tillåter fluidflöde men fånga makrokalkpartiklar (figur 1). Omvänt är fullt förseglingsbara mikroflödesventiler tillverkas genom att inkludera en liten lapp av rundade fotoresist på ventil platser. Med denna geometri, trycksättning av styrkanalen böjer membranet mot den rundade strömningsskikt för att fullständigt försegla kanalen, stoppa vätskeflöde. Rundade profiler i flödesskiktet genereras via smältning och omsmältning av positiv fotoresist (t.ex. AZ50 XT eller SPR 220) efter typiska fotolitografiska steg. Vi har tidigare visat att efter återflöde höjder av ventil regioner beroende på valda funktionen dimensioner 21. Detta protokoll visar tillverkningen av båda ventil geometrier medi en vulst syntesanordning.

Figur 1
Figur 1: Multilayer mikroflödes Valve geometrier. Typiska "push up" enhetsarkitekturer för sil och fullt förseglingsbara ventiler före (överst) och efter (nederst) tryck. Klicka här för att se en större version av denna siffra.

Enheter kan också innehålla komplexa passiva funktioner såsom kaotiska bländare 13 och on-chip motstånd 20 som kräver funktioner i flera olika höjder inom ett enda flöde skikt. För att uppnå en höjd flödesskikt variabel har olika grupper användes många metoder inklusive kretskort etsning 22 skikts PDMS lättnad justering 23, eller flerstegs photolithography 24. Vår grupp har funnit flerstegsfotolitografi på ett enda formnings master för att vara ett effektivt och reproducerbart förfarande. För att göra detta, är en enkel fotolitografiteknik för att bygga tjocka kanaler med negativ fotoresist (t.ex. SU-8-serien fotoresister) i skikt utan utveckling mellan tillämpningen av varje skikt som används. Varje lager är spunnen i negativ fotoresist enligt dess tjocklek med användning av tillverkarens instruktioner 25 på kisel mastern. Dragen av denna höjd är mönstras sedan på skiktet med hjälp av en särskild genomskinlighetsmask (Figur 2) fäst vid en glas mask platta och anpassas till den tidigare spunna skiktet före exponering. I flerstegsfotolitografi, är exakt inriktning mellan skikt kritiska i att bilda en komplett variabel höjd flödeskanalen. Efter justering, är varje lager utsätts för en tjocklek beroende efter exponering baka. Utan utveckling, är nästa skikt similarly mönstrad. På detta sätt kan höga funktioner byggas upp på ett enda flöde wafer skikt-vid-skikt via användningen av flera masker. Genom att hoppa utveckling mellan varje steg, kan tidigare fotoresistskikten användas för att generera sammansatta höjd funktioner (dvs kan två 25 nm skikt gör en 50 pm funktion) 24. Dessutom kan kanalgolv funktioner som kaotisk mixer fiskbensspår 13 göras med hjälp av lager med tidigare exponerade funktioner. Ett slutligt utvecklingssteg avslutar processen, skapa en enda flödesskiva med funktioner av varierande höjd (Figur 3).

Här är en komplett protokoll för flerstegsfotolitografi som innehåller exempel på alla förfaranden som är nödvändiga för att tillverka on-chip ventiler och flödeskanaler med flera höjder tillhandahålls. Denna tillverkningsprotokoll presenteras i samband med en flerskiktsmikroflödes pärla synthesizer som kräver ventiler och variable-höjd funktioner för dess funktionalitet. Denna anordning innefattar T-korsningar för att generera vattendroppar i en oljemantel, on-chip motstånd att modulera flödeshastigheter genom att styra Poiseuille motstånd, en kaotisk mixer för homogenisering droppkomponenter, och båda helt förslutning och sikt ventiler för att möjliggöra automatiserade arbetsflöden som involverar flera reagens ingångar. Med hjälp av flerstegsfotolitografi, kan dessa var tillverkade på ett annat lager enligt höjd eller fotoresist; följande skikt är konstruerade på detta protokoll: (1) Flödes Round ventilskikt (55 um, AZ50 XT) (2) Flow Låg skikt (55 um, SU-8 2050) (3) Flödes Hög skikt (85 um, SU- 8 2025, 30 um tillsats höjd), och (4) Fiskbens Grooves (125 um, SU-8 2025 40 pm tillsats höjd) (Figur 3).

Hydrogel pärlor kan användas för en mängd olika tillämpningar, inklusive selektiv yta funktionalisering för analyser nedströms, drog inkapsling, radiotracing och avbildnings analyser och cell införlivandet; vi tidigare använt en mer komplex version av dessa enheter för att producera spektralt kodade PEG hydrogel pärlor innehållande lantanid- nanophosphors 20. De mönster som diskuteras här ingår i Ytterligare resurser för alla lab att använda i sina forskningsinsatser om så önskas. Vi räknar med att detta protokoll kommer att ge en öppen resurs för specialister och icke-specialister både intresserade av att göra flera lager mikroflödessystem enheter med ventiler eller komplexa geometrier att sänka hinder för inträde i mikrofluidik och öka chanserna att tillverknings framgång.

Protocol

1. Flera lager Device Design OBS: Funktioner av olika höjder och / eller fotoresister måste läggas sekventiellt till skivan under olika tillverkningssteg för att skapa slutliga kompositfunktioner. Därför mönster för varje separat höjd och fotoresist som skall finnas på en skiva skall tryckas på sin egen mask (Figur 4). Hämta en datorstödd konstruktion (CAD) utarbeta program (t.ex. AutoCAD Educational Version). Definiera 4 "wafe…

Representative Results

Här visar vi tillverkning av ventilförsedda, variabel höjd flerskiktade mikroflödes formar genom att göra anordningar som kan alstra poly etylenglykol (PEG) hydrogelsträngar från droppar (Figur 2). En översikt över hela tillverkningsprocessen ingår i Figur 3. Använda designelement från tidigare arbete, sysselsätter pärla synthesizer 4 höjder i sitt flöde skikt innefattande (1) rundade AZ50 XT ventiler för laminärt fl?…

Discussion

Detta arbete visar en komplett flerstegsfotolitografi protokoll för en flerskiktsmikroflödessystem enhet med ventiler och varierande höjd geometri som kan ställas in för varje applikation med enkla ändringar av tillverkningsparametrar baserade på våra onlineverktyg 26 och tillverkarens instruktioner 25. Detta protokoll är avsett att avmystifiera skiktsfotolitografi för forskare som vill bygga mikroflödessystem enheter bortom enkla, passiva ett lager formar.

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

The authors thank Scott Longwell for helpful comments and edits to the manuscript and Robert Puccinelli for device photography. The authors acknowledge generous support from a Beckman Institute Technology Development Grant. K.B. is supported by a NSF GFRP fellowship and the TLI component of the Stanford Clinical and Translational Science Award to Spectrum (NIH TL1 TR 001084); P.F. acknowledges a McCormick and Gabilan Faculty Fellowship.

Materials

Materials
Mylar Transparency Masks, 5" FineLine Plotting
5" Quartz Plates United Silica  Custom
4" Silicon Wafers, Test Grade University Wafer 452
SU8 2005, 2025, 2050 photoresist Microchem Y111045, Y111069, Y111072
Az50XT  Integrated Micromaterials AZ50XT-Q
SU8 Developer Microchem Y020100
AZ400K 1:3 Developer Integrated Micromaterials AZ400K1:3-CS
Pyrex 150 mm glass dish Sigma-Aldrich CLS3140150-1EA
Wafer Petri Dishes, 150 mm VWR 25384-326
Wafer Tweezers  Electron Microscopy Sciences (EMS) 78410-2W
Trichloro(1H,1H,2H,2H-perfluorooctyl)silane (PFOTS) Sigma-Aldrich 448931-10G
2" x 3" glass slides Thomas Scientific  6686K20
RTV 615 elastomeric base and curing agent PDMS set Momentive  RTV615-1P
Tygon Tubing, 0.02" O.D.  Fischer Scientific  14-171-284
Capillary PEEK tubing,  510 um OD, 125 um ID Zeus Custom 360 um PEEK is readily available by Idex (catalog number: 1571)
Cyro 4 mL tube Greiner Bio-One 127279
Epoxy, 30-minute Permatex 84107
Metal Pins, 0.025" OD, .013" ID New England Small Tube NE-1310-02
Poly(ethylene glycol) diacrylate, Mn 700 Sigma-Aldrich 455008-100ML
Lithium Phenyl(2,4,6-trimethylbenzoyl)phosphinate photoinitator  Tokyo Chemical Industry Co. L0290 We typically synthesize LAP in-house. 
HEPES Sigma-Aldrich H4034-25G
Light mineral oil Sigma-Aldrich 330779-1L
Span-80 Sigma-Aldrich 85548
ABIL EM 90 UPI Chem 420095
Name  Company Catalog Number Comments
Equipment Equivalent equiptment or homebuilt setups will work equally as well
Mask Aligner Karl Suss MA6
Profilometer KLA-Tencor Alpha-Step D500
Spin Coater Laurell Technologies WS-650-23 Any spincoater can be used that accepts 100 mm wafers
Vacuum Dessicator, Bell-Jar Style Bel-Art 420100000
Oven Cole-Palmer WU-52120-02
UV Spot Curing System with 3 mm LLG option Dymax 41015 UV LEDs, Xenon Arc Lamps, or other UV sources of the same intensity work equally as well
MFCS Microfluidic Fluid Control System Fluidgent MFCS-EZ Syringe pumps, custom pneumatics or other control systems can also be used
Automated control scripting MATLAB
Hotplate Tory Pines Scientific HP30 Any hotplate with uniform heating (i.e. aluminum or ceramic plates) will suffice. 

References

  1. Duncombe, T. A., Tentori, A. M., Herr, A. E. Microfluidics: reframing biological enquiry. Nat. Rev. Mol. Cell Bio. 16 (9), (2015).
  2. Squires, T. M., Quake, S. R. Microfluidics: Fluid physics at the nanoliter scale. Rev.Mod. Phys. 77 (3), (2005).
  3. Whitesides, G. M. The origins and the future of microfluidics. Nature. 442 (7101), (2006).
  4. Kalisky, T., Blainey, P., Quake, S. R. Genomic Analysis at the Single-Cell Level. Ann. Rev. of Genetics. 45 (1), (2011).
  5. Finkel, N. H., Lou, X., Wang, C., He, L. Peer Reviewed: Barcoding the Microworld. Anal. Chem. 76 (19), (2004).
  6. Lecault, V., White, A. K., Singhal, A., Hansen, C. L. Microfluidic single cell analysis: from promise to practice. Curr. Opin. in Chem. Bio. 16 (3-4), (2012).
  7. White, A. K., Heyries, K. A., Doolin, C., VanInsberghe, M., Hansen, C. L. High-Throughput Microfluidic Single-Cell Digital Polymerase Chain Reaction. Anal. Chem. 85 (15), (2013).
  8. Hansen, C. L., Classen, S., Berger, J. M., Quake, S. R. A Microfluidic Device for Kinetic Optimization of Protein Crystallization and In Situ Structure Determination. J. Am. Chem. Soc. 128 (10), (2006).
  9. Maerkl, S. J., Quake, S. R. A Systems Approach to Measuring the Binding Energy Landscapes of Transcription Factors. Science. 315 (5809), (2007).
  10. Fordyce, P. M., Gerber, D., et al. De novo identification and biophysical characterization of transcription-factor binding sites with microfluidic affinity analysis. Nat. Biotech. 28 (9), (2010).
  11. Fan, R., et al. Integrated barcode chips for rapid, multiplexed analysis of proteins in microliter quantities of blood. Nat. Biotech. 26 (12), (2008).
  12. Kovarik, M. L., Gach, P. C., Ornoff, D. M., Wang, Y. Micro total analysis systems for cell biology and biochemical assays. Anal. Chem. , (2011).
  13. Stroock, A. D., Dertinger, S. K. W., Ajdari, A., Mezić, I., Stone, H. A., Whitesides, G. M. Chaotic Mixer for Microchannels. Science. 295 (5555), 647-651 (2002).
  14. Unger, M. A., Chou, H. -. P., Thorsen, T., Scherer, A., Quake, S. R. Monolithic Microfabricated Valves and Pumps by Multilayer Soft Lithography. Science. 288 (5463), 113-116 (2000).
  15. Thorsen, T., Maerkl, S. J., Quake, S. R. Microfluidic Large-Scale Integration. Science. 298 (5593), (2002).
  16. Li, N., Sip, C., Folch, A. Microfluidic Chips Controlled with Elastomeric Microvalve Arrays. JoVE. (8), e296 (2007).
  17. Kim, P., et al. Soft lithography for microfluidics: a review. Biochip. J. 2 (1), 1-11 (2008).
  18. Studer, V., Hang, G., Pandolfi, A., Ortiz, M., Anderson, W. F., Quake, S. R. Scaling properties of a low-actuation pressure microfluidic valve. J. Appl. Phys. 95 (1), 393-398 (2004).
  19. Kartalov, E. P., Scherer, A., Quake, S. R., Taylor, C. R., Anderson, W. F. Experimentally validated quantitative linear model for the device physics of elastomeric microfluidic valves. J. Appl. Phys. 101 (6), 064505 (2007).
  20. Gerver, R. E., Gómez-Sjöberg, R., et al. Programmable microfluidic synthesis of spectrally encoded microspheres. Lab. Chip. 12 (22), 4716-4723 (2012).
  21. Fordyce, P. M., Diaz-Botia, C. A., DeRisi, J. L., Gómez-Sjöberg, R. Systematic characterization of feature dimensions and closing pressures for microfluidic valves produced via photoresist reflow. Lab. Chip. 12 (21), 4287-4295 (2012).
  22. Li, C. -. W., Cheung, C. N., Yang, J., Tzang, C. H., Yang, M. PDMS-based microfluidic device with multi-height structures fabricated by single-step photolithography using printed circuit board as masters. The Analyst. 128 (9), 1137-1142 (2003).
  23. Romanowsky, M. B., Abate, A. R., Rotem, A., Holtze, C., Weitz, D. A. High throughput production of single core double emulsions in a parallelized microfluidic device. Lab. Chip. 12 (4), 802-807 (2012).
  24. Mata, A., Fleischman, A. J., Roy, S. Fabrication of multi-layer SU-8 microstructures. JMM. 16 (2), 276 (2006).
  25. . Rafael’s Microfluidics Site Available from: https://sites.google.com/site/rafaelsmicrofluidicspage/valve-controllers (2016)
  26. Wanat, S., Plass, R., Sison, E., Zhuang, H., Lu, P. -. H. Optimized Thick Film Processing for Bumping Layers. Proc. SPIE. , 1281-1288 (2003).

Play Video

Cite This Article
Brower, K., White, A. K., Fordyce, P. M. Multi-step Variable Height Photolithography for Valved Multilayer Microfluidic Devices. J. Vis. Exp. (119), e55276, doi:10.3791/55276 (2017).

View Video