פרוטוקול זה מתאר את התהליך של החלת שבעה כלים פילוח אוטומטיות שונות מבנית סריקות MRI T1 משוקלל על החומר האפור באזורים יכול לשמש עבור כימות של נפח החומר האפור.
בתוך להפרעת, מספר המחקרים האחרונים דנו את השפעת ההבדלים בין למידה-נפחי ממצאים נחשבים הם תוצאה של שימוש בכלים פילוח שונים כדי ליצור אמצעי אחסון המוח. כאן מוצגים צינורות עיבוד עבור שבעה כלים אוטומטיים יכול לשמש כדי לחלק חומר אפור בתוך המוח. הפרוטוקול מספק צעד ראשוני עבור חוקרים במטרה למצוא את השיטה המדויקת ביותר ליצירת אמצעי אחסון החומר האפור של סריקות MRI T1 משוקלל. צעדים לבצע בקרת איכות חזותית מפורטת כלולים גם בכתב היד. פרוטוקול זה מכסה מגוון של כלים פילוח פוטנציאליים ומעודדת משתמשים כדי להשוות את הביצועים של כלים אלה בתוך קבוצת משנה של הנתונים שלהם לפני בחירת אחד כדי להחיל על עמית מלאה. יתר על כן, הפרוטוקול ייתכן כללית נוספת פילוח מאזורים אחרים במוח.
דימות מוחי נעשה שימוש נרחב בשתי קליניים ומחקר הגדרות. ישנו איזשהו מהלך הנוכחי כדי לשפר את הפארמצבטית של מחקרים לכמת נפח המוח של סריקות דימות תהודה מגנטית (MRI); לכן, חשוב כי החוקרים לשתף חוויות של שימוש בכלים הזמינים MRI ולהפרדת סריקות MRI באמצעי אחסון מקומיים, כדי לשפר את התקינה ואופטימיזציה של שיטות1. פרוטוקול זה מספק מדריך צעד אחר צעד לשימוש שבעה כלים שונים כדי לחלק את החומר האפור בקליפת המוח (CGM; החומר האפור, אשר אינו כולל אזורים subcortical) של סריקות MRI T1 משוקלל. כלים אלה שימשו בעבר השוואה מתודולוגי של פילוח שיטות2, אשר הפגינו ביצועים משתנה בין כלי קוהורטה מחלת הנטינגטון. מאז הביצועים של כלים אלה, נחשב משתנים בין נתונים (datasets) שונות, חשוב לחוקרים לבחון מספר כלים לפני בחירת רק אחד כדי להחיל את ערכת הנתונים שלהם.
נפח החומר האפור (GM) משמש באופן קבוע כאמצעי של המוח מורפולוגיה. מידות נפח הם בדרך כלל אמין מסוגל להפלות בין הפקדים בריא לבין קבוצות קליניים3. הנפח של רקמות שונות סוגי אזורים במוח מחושב בדרך כלל באמצעות כלי תוכנה אוטומטית לזהות את סוגי רקמות אלה. לכן, כדי ליצור איכות גבוהה delineations (segmentations) של GM, תיחום מדויק של חומר לבן (WM), נוזל מוחי שדרתי (CSF) היא קריטית בהשגת דיוק של האזור GM. ישנם מספר כלים אוטומטיים העשויות לשמש לביצוע סגמנטציה GM, כל אחד דורש שלבי עיבוד שונות ותוצאות פלט שונה. מספר מחקרים החלת בכלים שונים datasets להשוות אותם עם אחד אחרים, חלקם יש אופטימיזציה כלים ספציפיים1,4,5,6,7,8 ,9,10,11. העבודות הקודמות הוכיחה כי השתנות בין כלי נפחי עלולה לגרום חוסר עקביות בתוך הספרות כשלמדתי נפח המוח, הבדלים אלה שהוצעו נהיגה גורמים מסקנות שווא משורטטים על מחלות נוירולוגיות1.
לאחרונה, בוצעה השוואה של כלים שונים פילוח במדגם שכלל המשתתפים שליטה בריאים והן של המשתתפים עם מחלת הנטינגטון. מחלת הנטינגטון היא מחלה גנטית ניווניות עם תחילת טיפוסי בבגרות. אטרופיה הדרגתית של subcortical ו- CGM היא תכונה neuropathological בולטים למד היטב של המחלה. התוצאות הראו ביצועים משתנה של שבעה כלים פילוח שהוחלו על קבוצה, תמיכה לעבוד קודמים שהראו השתנות של ממצאים בהתאם לתוכנה המשמש לחישוב המוח כרכים של סריקות MRI. פרוטוקול זה מספק מידע על עיבוד המשמשים ג’ונסון. et al. (2017) 2 שמעודד בחירה זהירה מתודולוגי הכלים המתאים ביותר לשימוש בדימות מוחי. מדריך זה מכסה את פילוח של GM האחסון אך אינו מכסה את פילוח של נגעים, כגון אלה ראה טרשת נפוצה.
לאחרונה, מחקר הראה כי השימוש בשיטות נפח שונה יכול להיות השלכות חשובות על דימות מוחי מחקרים1,2. פרסום פרוטוקולים המסייעים משתמשים טירון מדריך איך ליישם כלי דימות מוחי שונים, כמו גם כיצד לבצע QC על הפלט התוצאות באמצעות כלים אלה, חוקרים ניתן לבחור את השיטה הטובה ?…
The authors have nothing to disclose.
אנו רוצים להודות לכל אלה של קרן Q CHDI/גבוהה אחראי על המחקר המסלול-HD; בפרט, בית Borowsky, אלן טובין, דניאל ואן Kammen, איתן החותם ואת שרי אסיר עולם. המחברים גם רוצים להאריך את המשתתפים במחקר מעקב אחר-HD ובני משפחותיהם תודתם. עבודה זו נערך ב UCLH/UCL, אשר קיבל שיעור מימון מן המכון הלאומי של מחלקת הבריאות עבור הבריאות מחקר ביו-רפואי מרכזי מחקר מימון ערכת. S.J.T. מאשר התמיכה של המכון הלאומי לחקר הבריאות באמצעות Dementias, רשת המחקר ניווניות, DeNDRoN.
חוקרים מסלול-HD:
ג. קמפבל, מר קמפבל, אני Labuschagne, ג Milchman, ג’יי סטאוט, אוניברסיטת מונש, מלבורן, ויק, אוסטרליה; א קולמן, סנטוס דאר רבי, ג’יי Decolongon, נולד ב ר לוויט, Sturrock א, אוניברסיטת בריטיש קולומביה, וונקובר, קנדה; א Durr, ג Jauffret, ד Justo, S. Lehericy, ג Marelli, ק’ Nigaud, ר’ Valabrègue, ICM מכון, פריז, צרפת; (ש ע) Bechtel, ס Bohlen, ר’ Reilmann, אוניברסיטת מינסטר, מינסטר, גרמניה; B. Landwehrmeyer, האוניברסיטה ההיסטורית אולם, אולם, גרמניה; ס י א ואן דן Bogaard, דומא מ א, ג’יי ואן דר גרונד, E. P אל הארט, ר א רוס, המרכז הרפואי של אוניברסיטת ליידן, ליידן, הולנד; (ש ע) Arran, ג’יי קלהאן, האימפראטור ד, ג Stopford, אוניברסיטת מנצ’סטר, מנצ’סטר, אנגליה; ד מ במזומן, IXICO, לונדון, אנגליה; ה קרופורד פוקס נ ג, גרגורי ס’, אוון ג, ש צ הובס, ש להירי, מאלון. אני, ג’יי לקריאה, מ’ ג’, וייטהד ד, אי פראי, נניח באוניברסיטת קולג ‘ בלונדון, לונדון, אנגליה; ג. פרוסט, ר ‘ ג’ונס, London School of להיגיינה, רפואה טרופית, לונדון, אנגליה; אי Axelson ה ג’יי ג’ונסון, Langbehn ד, אוניברסיטת איווה, IA, ארצות הברית; ס קוולר, אוניברסיטת ג קמפבל, אינדיאנה, ארה.