Validating Whole Genome Nanopore Sequencing, using Usutu Virus as an Example

Bas  B. Oude Munnink; David  F. Nieuwenhuijse; Reina  S. Sikkema; Marion Koopmans

doi:10.3791/60906

Journal

/

Genetics

/

التحقق من صحة تسلسل الجينوم كله نانوبور، وذلك باستخدام فيروس Usutu كمثال

JoVE Journal
Genetics

This content is Free Access.

JoVE Journal Genetics

Validating Whole Genome Nanopore Sequencing, using Usutu Virus as an Example

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

التحقق من صحة تسلسل الجينوم كله نانوبور، وذلك باستخدام فيروس Usutu كمثال

DOI:

10.3791/60906-v

•

05:45 min

•

March 11, 2020

•

Bas B. Oude Munnink, David F. Nieuwenhuijse, Reina S. Sikkema, Marion Koopmans

¹ErasmusMC, Department of Viroscience, WHO Collaborating Centre for Arbovirus and Viral Hemorrhagic Fever Reference and Research,Erasmus University Medical Center

Chapters

00:04Introduction
00:59Nanopore Data Consensus Sequence Generation
02:33Nanopore Sequencing Error Profile Compensation
03:54Results: Representative Nanopore Sequencing Error Rate Overview
04:58Conclusion

Summary

Automatic Translation

لقد سبق لنا التحقق من صحة بروتوكول لتسلسل فيروس أوسوتو الجينومي الكامل القائم على amplicon (USUV) على منصة تسلسل النانوبور. هنا ، ونحن وصف الأساليب المستخدمة بمزيد من التفصيل وتحديد معدل الخطأ من نانوبور R10 تدفق الخلية.

التحقق من صحة تسلسل الجينوم كله نانوبور، وذلك باستخدام فيروس Usutu كمثال

•

•

•

Chapters

Summary

Automatic Translation

Tags

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

رسم الخرائط التفاعلات رنا-رنا على الصعيد العالمي باستخدام السورالين البيروكسيديز

جيل من الكروماتين الأصلية إيمونوبريسيبيتيشن تسلسل المكتبات لتحليل كثافة نوكليوسومي

G2-seq: عالية إنتاجية على أساس تسلسل تقنية لتحديد تكرار متأخر مناطق الجينوم

التنميط الحمض النووي توقيت النسخ المتماثل باستخدام الزرد كنظام نموذجي في فيفو

الكشف عن حالة نادرة باستخدام الحمض النووي لتصحيح الخطأ وتسلسل الحمض النووي الريبي

معالجات الجينوم الإدخال تسلسل إعداد مكتبة من عينة تارديجرادي واحد

التضخيم من القرب من كامل طول فيروس نقص المناعة البشرية-1 بروفيروسيس للجيل التالي التسلسل

فصل البكتيريا بمقدار كبسولة استخدام تدرج كثافة متقطع

تحرير الجينوم في "خطوط خلايا الثدييات" استخدام Cas كريسبر

تسلسل mRNA من الدم الكامل باستخدام التسلسل نانو

Read Article