Summary

Encapsulation rapide du cytosquelette reconstitué à l’intérieur de vésicules unilamellaires géantes

Published: November 10, 2021
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Summary

Cet article présente une méthode simple pour la production rapide de vésicules unilamellaires géantes avec des protéines cytosquelettiques encapsulées. La méthode s’avère utile pour la reconstitution ascendante des structures cytosquelettiques dans le confinement et les interactions cytosquelette-membrane.

Abstract

Les vésicules unilamellaires géantes (GUV) sont fréquemment utilisées comme modèles de membranes biologiques et constituent donc un excellent outil pour étudier les processus cellulaires liés à la membrane in vitro. Ces dernières années, l’encapsulation dans les GUV s’est avérée être une approche utile pour les expériences de reconstitution en biologie cellulaire et dans des domaines connexes. Il imite mieux les conditions de confinement à l’intérieur des cellules vivantes, par opposition à la reconstitution biochimique conventionnelle. Les méthodes d’encapsulation à l’intérieur des GUV ne sont souvent pas faciles à mettre en œuvre, et les taux de réussite peuvent différer considérablement d’un laboratoire à l’autre. Une technique qui s’est avérée efficace pour encapsuler des systèmes protéiques plus complexes est appelée encapsulation croisée d’interface gouttelette continue (cDICE). Ici, une méthode basée sur cDICE est présentée pour encapsuler rapidement des protéines cytosquelettiques dans des GUV avec une efficacité d’encapsulation élevée. Dans cette méthode, tout d’abord, les gouttelettes lipido-monocouches sont générées en émulsionnant une solution protéique d’intérêt dans un mélange lipide/huile. Après avoir été ajoutées dans une chambre rotative imprimée en 3D, ces gouttelettes monocouches lipidiques passent ensuite à travers une deuxième monocouche lipidique à une interface eau/huile à l’intérieur de la chambre pour former des GUV qui contiennent le système protéique. Cette méthode simplifie la procédure globale d’encapsulation dans les GUV et accélère le processus, et nous permet ainsi de confiner et d’observer l’évolution dynamique de l’assemblage du réseau à l’intérieur des vésicules bicouches lipidiques. Cette plate-forme est pratique pour étudier la mécanique des interactions cytosquelette-membrane en confinement.

Introduction

Les compartiments bicouches lipidiques sont utilisés comme modèles de cellules synthétiques pour l’étude des réactions organiques fermées et des processus membranaires ou comme modules porteurs dans les applications d’administrationde médicaments 1,2. La biologie ascendante avec des composants purifiés nécessite un minimum de systèmes expérimentaux pour explorer les propriétés et les interactions entre les biomolécules, telles que les protéines et les lipides 3,4. Cependant, avec les progrès du domaine, il y a un besoin accru de systèmes expérimentaux plus complexes qui imitent mieux les conditions dans les cellules biologiques. L’encapsulation dans les GUV est une approche pratique qui peut offrir certaines de ces propriétés cellulaires en fournissant une bicouche lipidique déformable et sélectivement perméable et un espace de réaction confiné. En particulier, la reconstitution in vitro de systèmes cytosquelettiques, en tant que modèles de cellules synthétiques, peut bénéficier de l’encapsulation dans les compartiments membranaires5. De nombreuses protéines du cytosquelette se lient et interagissent avec la membrane cellulaire. Comme la plupart des assemblages cytosquelettiques forment des structures qui couvrent l’ensemble de la cellule, leur forme est naturellement déterminée par le confinement de la tailled’une cellule 6.

Différentes méthodes sont utilisées pour générer des GUV, telles que le gonflement 7,8, la fusion de petites vésicules 9,10, le transfert d’émulsion 11,12, le jet pulsé13 et d’autres approches microfluidiques14,15. Bien que ces méthodes soient encore utilisées, chacune a ses limites. Ainsi, une approche robuste et simple avec un rendement élevé d’encapsulation GUV est hautement souhaitable. Bien que des techniques telles que le gonflement spontané et l’électrosuit soient largement adoptées pour la formation de GUV, ces méthodes sont principalement compatibles avec des compositions lipidiques spécifiques16, des tampons à faible concentration de sel17, une taille moléculaire encapsulanteplus petite 18 et nécessitent un volume élevé d’encapsulant. La fusion de plusieurs petites vésicules dans un GUV est intrinsèquement énergétiquement défavorable, nécessitant ainsi une spécificité dans les compositions lipidiques chargées9 et / ou les agents externes induisant la fusion, tels que les peptides19 ou d’autres produits chimiques. Le transfert d’émulsion et les méthodes microfluidiques, d’autre part, peuvent nécessiter une stabilisation des gouttelettes par l’élimination des tensioactifs et des solvants après la formation de bicouches, respectivement18,20. La complexité de la configuration expérimentale et du dispositif dans les techniques microfluidiques telles que le jet pulsé impose un défi supplémentaire21. cDICE est une méthode basée sur l’émulsion dérivée de principes similaires régissant le transfert d’émulsion22,23. Une solution aqueuse (solution externe) et un mélange lipid-huile sont stratifiés par forces centrifuges dans une chambre cylindrique rotative (chambre cDICE) formant une interface saturée de lipides. La navette de gouttelettes aqueuses monocouches lipidiques dans la chambre cDICE rotative entraîne la fermeture éclair d’une bicouche lorsque les gouttelettes traversent l’interface saturée de lipides dans la solution aqueuse externe22,24. L’approche cDICE est une technique robuste pour l’encapsulation GUV. Avec la méthode modifiée présentée, non seulement le rendement élevé des vésicules typique de la cDICE avec un temps d’encapsulation significativement plus court (quelques secondes) est atteint, mais le temps de génération de GUV qui permet l’observation des processus dépendant du temps (par exemple, la formation d’un réseau cytosquelettique d’actine) est considérablement réduit. Le protocole prend environ 15-20 minutes du début à la collecte et à l’imagerie GUV. Ici, la génération de GUV est décrite à l’aide de la méthode cDICE modifiée pour encapsuler l’actine et les protéines de liaison à l’actine (ABP). Cependant, la technique présentée est applicable pour encapsuler un large éventail de réactions biologiques et d’interactions membranaires, de l’assemblage de biopolymères à l’expression de protéines sans cellules en passant par le transfert de cargaison basé sur la fusion membranaire.

Protocol

1. Préparation du mélange huile-lipides REMARQUE: L’étape doit être effectuée dans une hotte en suivant toutes les directives de sécurité pour la manipulation du chloroforme. Prendre 0,5 mL de chloroforme dans un flacon en verre de 15 mL. Ajouter 88 μL de 25 mg/mL de dioléoyl-phosphocholine (DOPC), 9,3 μL de 50 mg/mL de cholestérol et 5 μL de 1 mg/mL de dioléoyl-phosphoéthanolamine-lissamine B (rhodamine PE) (voir tableau des matériaux</stron…

Representative Results

Pour démontrer la génération réussie de GUV cytosquelettiques à l’aide du protocole actuel, des structures de faisceau fascine-actine dans les GUV ont été reconstituées. La fascine est un réticulant court de filaments d’actine qui forme des faisceaux d’actine rigides alignés en parallèle et est purifié à partir d’E. coli sous forme de protéine de fusion glutathion-S-transférase (GST)26. 5 μM d’actine ont d’abord été reconstitués, dont 0,53 μM d’actine ATT…

Discussion

Différentes méthodes de génération de GUV ont été explorées pour la création de cellules synthétiques Cependant, la complexité des procédures, le temps prolongé pour atteindre l’encapsulation, la restriction des types de lipides et de la composition moléculaire de l’encapsulant, le besoin de produits chimiques non physiologiques pour faciliter l’encapsulation, le faible rendement en GUV et les incohérences dans l’efficacité de l’encapsulation ont continué à défier les chercheurs dans ce domain…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

APL reconnaît le soutien d’une bourse de recherche Humboldt pour chercheurs expérimentés et de la National Science Foundation (1939310 et 1817909) et des National Institutes of Health (R01 EB030031).

Materials

18:1 Liss Rhod PE lipid in chloroform Avanti Polar Lipids 810150C
96 Well Optical Btm Pit PolymerBase ThermoFisher Scientific 165305
Actin from rabbit skeletal muscle Cytoskeleton AKL99-A
ATTO 488-actin from rabbit skeletal muscle Hypermol 8153-01
Axygen microtubes (200 µL) Fisher Scientific 14-222-262 for handling ABPs
Black resin Formlabs RS-F2-GPBK-04
Cholesterol (powder) Avanti Polar Lipids 700100P
Choloroform Sigma Aldrich 67-66-3
Clear resin Formlabs RS-F2-GPCL-04
CSU-X1 Confocal Scanner Unit YOKOGAWA CSU-X1
Density gradient medium (Optiprep) Sigma-Aldrich D1556
DOPC lipid in chloroform Avanti Polar Lipids 850375C
Fascin homemade N/A
F-buffer homemade N/A
Fisherbrand microtubes (1.5 mL) Fisher Scientific 05-408-129
FS02 Sonicator Fischer Scientific FS20
G-buffer homemade N/A
Glucose Sigma-Aldrich 158968
iXon X3 camera Andor DU-897E-CS0
Mineral oil Acros Organics 8042-47-5
Olympus IX81 Inverted Microscope Olympus IX21
Olympus PlanApo N 60x Oil Microscope Objective Olumpus 1-U2B933
Silicone oil Sigma-Aldrich 317667

References

  1. Groaz, A., et al. Engineering spatiotemporal organization and dynamics in synthetic cells. Wiley Interdisciplinary Reviews: Nanomedicine and Nanobiotechnology. 13 (3), 1685 (2021).
  2. Diltemiz, S. E., et al. Use of artificial cells as drug carriers. Materials Chemistry Frontiers. 5, 6672-6692 (2021).
  3. Liu, A. P., Fletcher, D. A. Biology under construction: In vitro reconstitution of cellular function. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 10 (9), 644-650 (2009).
  4. Ganzinger, K. A., Schwille, P. More from less – bottom-up reconstitution of cell biology. Journal of Cell Science. 132 (4), 227488 (2019).
  5. Bashirzadeh, Y., Liu, A. P. Encapsulation of the cytoskeleton: Towards mimicking the mechanics of a cell. Soft Matter. 15 (42), 8425-8436 (2019).
  6. Blanchoin, L., Boujemaa-Paterski, R., Sykes, C., Plastino, J. Actin dynamics, architecture, and mechanics in cell motility. Physiol reviews. 94 (1), 235-263 (2014).
  7. Angelova, M. I., Dimitrov, D. S. Liposome electroformation. Faraday Discussions of the Chemical Society. 81, 303-311 (1986).
  8. Tsumoto, K., Matsuo, H., Tomita, M., Yoshimura, T. Efficient formation of giant liposomes through the gentle hydration of phosphatidylcholine films doped with sugar. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces. 68 (1), 98-105 (2009).
  9. Bailey, A. L., Cullis, P. R. Membrane fusion with cationic liposomes: Effects of target membrane lipid composition. Biochemistry. 36 (7), 1628-1634 (1997).
  10. Haluska, C. K., Riske, K. A., Marchi-Artzner, V., Lehn, J. M., Lipowsky, R., Dimova, R. Time scales of membrane fusion revealed by direct imaging of vesicle fusion with high temporal resolution. Proceedings of the National Academy of Sciences. 103 (43), 15841-15846 (2006).
  11. Nishimura, K., Suzuki, H., Toyota, T., Yomo, T. Size control of giant unilamellar vesicles prepared from inverted emulsion droplets. Journal of Colloid and Interface Science. 376 (1), 119-125 (2012).
  12. Pautot, S., Frisken, B. J., Weitz, D. A. Production of unilamellar vesicles using an inverted emulsion. Langmuir. 19 (7), 2870-2879 (2003).
  13. Stachowiak, J. C., Richmond, D. L., Li, T. H., Liu, A. P., Parekh, S. H., Fletcher, D. A. Unilamellar vesicle formation and encapsulation by microfluidic jetting. Proceedings of the National Academy of Sciences. 105 (12), 4697-4702 (2008).
  14. Noireaux, V., Liu, A. P. The new age of cell-free biology. Annual Review of Biomedical Engineering. 22, 51-77 (2020).
  15. Ho, K. K. Y., Murray, V. L., Liu, A. P. Engineering artificial cells by combining HeLa-based cell-free expression and ultrathin double emulsion template. Methods in Cell Biology. , 303-318 (2015).
  16. Akashi, K., Miyata, H., Itoh, H., Kinosita, K. Preparation of giant liposomes in physiological conditions and their characterization under an optical microscope. Biophysical Journal. 71 (6), 3242-3250 (1996).
  17. Méléard, P., Bagatolli, L. A., Pott, T. Giant unilamellar vesicle electroformation: From lipid mixtures to native membranes under physiological conditions. Methods in Enzymology. 465, 161-176 (2009).
  18. Walde, P., Cosentino, K., Engel, H., Stano, P. Giant vesicles: Preparations and applications. ChemBioChem. 11 (7), 848-865 (2010).
  19. Pécheur, E. I., Martin, I., Ruysschaert, J. M., Bienvenüe, A., Hoekstra, D. Membrane fusion induced by 11-mer anionic and cationic peptides: A structure− function study. Biochemistry. 37 (8), 2361-2371 (1998).
  20. Morigaki, K., Walde, P. Giant vesicle formation from oleic acid/sodium oleate on glass surfaces induced by adsorbed hydrocarbon molecules. Langmuir. 18 (26), 10509-10511 (2002).
  21. Majumder, S., Wubshet, N., Liu, A. P. Encapsulation of complex solutions using droplet microfluidics towards the synthesis of artificial cells. Journal of Micromechanics and Microengineering. 29 (8), 83001 (2019).
  22. Abkarian, M., Loiseau, E., Massiera, G. Continuous droplet interface crossing encapsulation (cDICE) for high throughput monodisperse vesicle design. Soft Matter. 7 (10), 4610-4614 (2011).
  23. Van de Cauter, L., et al. Optimized cDICE for efficient reconstitution of biological systems in giant unilamellar vesicles. ACS Synthetic Biology. 10 (7), 1690-1702 (2021).
  24. Claudet, C., In, M., Massiera, G. Method to disperse lipids as aggregates in oil for bilayers production. The European Physical Journal E. 39 (1), 1-6 (2016).
  25. Bashirzadeh, Y., Wubshet, N. H., Liu, A. P. Confinement Geometry tunes fascin-actin bundle structures and consequently the shape of a lipid bilayer vesicle. Frontiers in Molecular Biosciences. 7, 610277 (2020).
  26. Bashirzadeh, Y., et al. Actin crosslinker competition and sorting drive emergent GUV size-dependent actin network architecture. Communications Biology. 4, 1136 (2021).
  27. Bashirzadeh, Y., Moghimianavval, H., Liu, A. P. Encapsulated actomyosin patterns drive cell-like membrane shape changes. bioRxiv. , (2021).
  28. Litschel, T., et al. Reconstitution of contractile actomyosin rings in vesicles. Nature Communications. 12 (1), 1-10 (2021).
  29. Vitale, S. A., Katz, J. L. Liquid droplet dispersions formed by homogeneous liquid− liquid nucleation:"The Ouzo effect.&#34. Langmuir. 19 (10), 4105-4110 (2003).
  30. Pautot, S., Frisken, B. J., Weitz, D. A. Engineering asymmetric vesicles. Proceedings of the National Academy of Sciences. 100 (19), 10718-10721 (2003).
  31. Deshpande, S., Dekker, C. On-chip microfluidic production of cell-sized liposomes. Nature Protocols. 13 (5), 856-874 (2018).
  32. Deshpande, S., Caspi, Y., Meijering, A. E. C., Dekker, C. Octanol-assisted liposome assembly on chip. Nature Communications. 7, 10447 (2016).
  33. Wubshet, N. H., Bashirzadeh, Y., Liu, A. P. Fascin-induced actin protrusions are suppressed by dendritic networks in GUVs. Molecular Biology of the Cell. 32 (18), 1634-1640 (2021).
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Bashirzadeh, Y., Wubshet, N., Litschel, T., Schwille, P., Liu, A. P. Rapid Encapsulation of Reconstituted Cytoskeleton Inside Giant Unilamellar Vesicles. J. Vis. Exp. (177), e63332, doi:10.3791/63332 (2021).

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