A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:00Title
- 00:45Introduction
- 01:17Preparation of the Bait and SILAC Control Strain
- 02:44Grinding of Cells
- 04:05Pre-clearing Cell Lysate
- 05:51Eluting From IgG Beads by TEV Protease Cleavage
- 06:45Trichloroacetic Acid (TCA) Precipitation
- 08:11EtOH/ Acetate Precipitation
- 09:00Sample Analysis by Western Blotting and/ or Silver Staining
- 09:30Representative Results/ Outcome
- 10:15Conclusion
Hier beschrijven we een nieuwe kwantitatieve proteomics-techniek voor het identificeren van eiwitcomplexen in Saccharomyces cerevisiae. In deze studie hebben we gebruik gemaakt van de SILAC methode, samen met affiniteit zuivering, gevolgd door tandem massaspectrometrie te identificeren met een hoge specificiteit van de binding partners van een ER-eiwit, Scs2p.
Tags
Protein ComplexesQuantitative ProteomicsS. CerevisiaeLipidsCellular MembranesCompartmentalizationIntracellular Signaling MoleculesNonvesicular RoutesMembrane Contact Sites (MCSs)Endoplasmic Reticulum (ER)Plasma Membrane (PM)Lipid-synthesizing EnzymesLipid TrafficER-PM MCSsYeast ModelEukaryotesScs2pMolecular PartnersGel ElectrophoresisIn-gel DigestionMass Spectrometry
