Journal
/
Biology
/
Análisis de todo el genoma con chip para identificar objetivos específicos para cada isoforma Gene
JoVE Journal
Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal Biology
Genome-wide Analysis using ChIP to Identify Isoform-specific Gene Targets
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Análisis de todo el genoma con chip para identificar objetivos específicos para cada isoforma Gene

DOI:
10.3791/2101-v

•

11:19 min

•

July 07, 2010

•

, , , , , ,
1Department of Biochemistry and Molecular Genetics,University of Illinois Chicago – UIC, 2Research Unit on Biomedical Informatics,Universitat Pompeu Fabra, 3Genome Technology Core,Whitehead Institute for Biomedical Research

Chapters

  • 00:00Title
  • 00:53Introduction
  • 01:33Cell Cross-linking
  • 02:39Cell Sonication
  • 04:03Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)
  • 07:06Amplification of Genomic DNA
  • 08:27Gel Purification of Amplified Products
  • 09:46Representative Results for Genome-wide Analysis Using ChIP
  • 10:53Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Aquí estamos presentando una inmunoprecipitación de cromatina (CHIP) Procedimiento para el análisis de localización en todo el genoma de las isoformas de la proteína que se diferencian en un dominio de unión a las histonas. Estamos aplicando a CHIP-Seq análisis para identificar los objetivos de la histona desmetilasa KDM5A/JARID1A/RBP2.

Tags

Genome-wide AnalysisChIPIsoform-specific Gene TargetsTranscriptional FactorsEpigenetic FactorsProtein DomainsPlant Homeodomain (PHD)Histone ModificationsRBP2Oncogenic FusionHuman LeukemiaTrimethylated Lysine 4Histone H3 (H3K4me3)RBP2 IsoformDifferentiationU937 CellsGenomic RegionsHistone Demethylase ActivityTranscriptional Activity

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/2101?article_type=v

Gen bacteriano y Análisis de Expresión El uso de microarrays
check_url/2101?article_type=v

Todo el genoma análisis de Aminoacilación (de carga) Niveles de tRNA utilizando microarrays
check_url/2101?article_type=v

Genoma toda la pantalla de los genes miARN objetivos mediante el objetivo de la misión Carnet de identificación
check_url/2101?article_type=v

Cuantitativos y automatizada de alto rendimiento del genoma completo de RNAi pantallas en C. elegans</em
check_url/2101?article_type=v

El aislamiento de los ribosomas polipéptidos nacientes Bound<em> In vitro</em> Para la identificación de sitios de traslación pausa a lo largo del ARNm
check_url/2101?article_type=v

Un bayesiano novela Cambio de punto Algoritmo para el Genoma en todo el análisis de diversos tipos de datos ChIPseq
check_url/2101?article_type=v

Genoma escala supresiones de genes en<em> Streptococcus sanguinis</em> Por PCR de alto rendimiento
check_url/2101?article_type=v

Polisoma Fraccionamiento y análisis de los mamíferos Translatomes en un genoma de gran escala
check_url/2101?article_type=v

Purificado de ADN afinidad Chip (DAP-chip) Método para determinar los objetivos de genes para bacteriana Dos Sistemas Regulatorios componentes
check_url/2101?article_type=v

Mapeo de todo el genoma de la droga-ADN interacciones en células con COSMIC (reticulación de pequeñas moléculas para aislar la cromatina)

Read Article