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Bewertung von immunologisch relevanten dynamischen tertiären strukturellen Merkmale der HIV-1 V3-Loop Crown R2 Sequence durch Ab initio Folding
JoVE Journal
Immunology and Infection
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JoVE Journal Immunology and Infection
Assessment of Immunologically Relevant Dynamic Tertiary Structural Features of the HIV-1 V3 Loop Crown R2 Sequence by ab initio Folding
DOI:

10:50 min

September 15, 2010

,

Chapters

  • 00:00Title
  • 01:07Introduction
  • 01:57R2 HIV-1 Strain V3 Loop ab initio Folding via the ICM-Pro GUI
  • 04:19R2 HIV-1 Strain V3 Loop ab initio Folding via the ICM-Pro Command Line
  • 06:35 ab initio Folding Data Analysis
  • 08:41Representative Results for R2 HIV-1 Strain V3 Loop ab initio Folding
  • 09:59Conclusion

Summary

Automatic Translation

Die Krone Region unterschiedliche V3-Loop-Sequenzen von der Oberfläche Hüllglycoprotein (gp120) des HIV-1 kann strukturell in vielen Fällen gekennzeichnet durch in silico Faltung von Positionen 10 bis 22 der Schleife mit einer state-of-the-art<em> Ab initio</em> Falt-Algorithmus. Hier zeigen wir die Faltung und Auswertung dieser Region des V3-Loops von der R2-Stamm HIV-1, ein einzigartig Neutralisation sensiblen Stamm mit rätselhaften funktionellen Eigenschaften.

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