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다양한 ChIPseq 데이터 유형의 게놈 차원의 분석을위한 소설 베이지안 변경 - 포인트 알고리즘
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Biology
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JoVE Journal Biology
A Novel Bayesian Change-point Algorithm for Genome-wide Analysis of Diverse ChIPseq Data Types
DOI:

12:39 min

December 10, 2012

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Chapters

  • 00:05Title
  • 02:43Preprocessing: Preparing Input Files for Bayesian Change-point (BCP) Analysis & ChIP Read Densities for Detection of Enriched Islands in Diffuse Data
  • 04:48Estimating the Posterior Mean Read Density of Each Block using BCMIX Approximation
  • 06:24Post-processing Posterior Means of Diffuse Read Profiles
  • 07:06Results: Comparison of BCP and SICER in Analysis of Histone Modification Data
  • 11:47Conclusion

Summary

Automatic Translation

우리 베이지안 변경 포인트 (BCP)이 알고리즘은 숨겨진 마르코프 모델을 통해 모델링 변화 포인트의 최신 발전을 토대로와 염색질 immunoprecipitation 시퀀싱 (ChIPseq) 데이터 분석에 적용됩니다. BCP는 광범위하고 작은 반점이있는 두 데이터 유형에서 잘 수행하지만, 정확하게 확산 히스톤 농축의 강력한 재현 섬을 식별하는 탁월한.

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