Journal
/
/
Utarmning av ribosomalt RNA för Mosquito Gut Metagenomic RNA-seq
JoVE Journal
Biology
Author Produced
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Depletion of Ribosomal RNA for Mosquito Gut Metagenomic RNA-seq
DOI:

06:21 min

April 07, 2013

, ,

Chapters

  • 00:02Title
  • 00:08Introduction
  • 00:48Mosquito Rearing
  • 01:31Mosquito gut dissection
  • 01:43Metagenomic DNA and RNA isolation
  • 02:27Ribosomal RNA depletion
  • 02:34PCR amplification of rRNA gene fragments
  • 02:48In vitro transcription of rRNA probes
  • 03:19rRNA subtraction
  • 03:39Removal of rRNA
  • 05:07Representative results
  • 05:48Conclusion

Summary

Automatic Translation

En ribosomalt RNA (rRNA) utarmning protokoll utvecklades för att berika budbärar-RNA (mRNA) för RNA-punkter i mygga tarmen metatranscriptome. Exempel specifika rRNA sonder, som används för att avlägsna rRNA via subtraktion, skapades från mygga och dess mikrober gut. Utförande av protokollet kan resultera i avlägsnande av ungefär 90-99% av rRNA.

Related Videos

Read Article