Journal
/
Biology
/
Genomvid Kartläggning av narkotika DNA interaktioner i celler med COSMIC (Tvärbindning av små molekyler att isolera Chromatin)
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Genome-wide Mapping of Drug-DNA Interactions in Cells with COSMIC (Crosslinking of Small Molecules to Isolate Chromatin)
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Genomvid Kartläggning av narkotika DNA interaktioner i celler med COSMIC (Tvärbindning av små molekyler att isolera Chromatin)

DOI:
10.3791/53510-v

•

10:05 min

•

January 20, 2016

•

, , , , ,
1Department of Biochemistry,University of Wisconsin–Madison, 2Department of Electrical and Computer Engineering,University of Wisconsin–Madison, 3Graduate Program in Cellular and Molecular Biology,University of Wisconsin–Madison, 4The Genome Center,University of Wisconsin–Madison

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:48Crosslinking in Live Cells
  • 03:19Isolation of Chromatin
  • 05:14Capture of Ligand-DNA Crosslinks and Isolation of Affinity-purified DNA
  • 07:52Results: COSMIC Indentifies Genome-wide Binding Events of Polyamides
  • 09:21Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Identifiera de direkta målen för genom-målsökande molekyler är fortfarande en stor utmaning. För att förstå hur DNA-bindande molekyler engagera genomet har vi utvecklat en metod som bygger på tvärbindning av små molekyler för att isolera kromatin (COSMIC).

Tags

Keywords: Genome-wide MappingDrug-DNA InteractionsCOSMICCrosslinkingSmall MoleculesChromatinPolyamidesDNA-targetingMechanism Of ActionTherapeutic AgentsDNA-targeting MoleculesPluripotent Stem CellsPhoto-cross-linkingUV RadiationCell DissociationEnzymeE8 Media

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/53510?article_type=v

Genomvid Analys av Aminoacylation (laddning) Nivåerna av tRNA Använda Microarrays
check_url/53510?article_type=v

Genomvid Analys med hjälp av chip för att identifiera isoform-specifik gen mål
check_url/53510?article_type=v

iCLIP - transkriptom hela Kartläggning av protein-RNA interaktioner med individuella Nukleotid Upplösning
check_url/53510?article_type=v

Kromatin Interaktion Analys med parade-End Tag sekvensering (CHIA-PET) för kartläggning kromatin Interaktioner och förstå transkriptionsreglering
check_url/53510?article_type=v

Genome-wide Gene Deletioner i<em> Streptococcus sanguinis</em> Av High Throughput PCR
check_url/53510?article_type=v

Ett In vivo Tvärbindning metod att isolera proteinkomplex från Drosophila Embryon
check_url/53510?article_type=v

Genomvid Protein-proteininteraktion Screening av Protein-fragment kompletteringsanalys (PCA) i levande celler
check_url/53510?article_type=v

Isolering av specifika genomregioner och Identifiering av associerade molekyler av enChIP
check_url/53510?article_type=v

DamID-punkter: Genomvid Kartläggning av protein-DNA interaktioner från hög genomströmning sekvensering av Adenine-metylerade DNA-fragment
check_url/53510?article_type=v

Förstärkning, Nästa generations sekvensering, och Genomic DNA Kartläggning av retroviral integration webbplatser

Read Article