Journal
/
Biology
/
En Web værktøj til at generere høj kvalitet maskinlæsbare biologiske veje
JoVE Journal
Biology
This content is Free Access.
JoVE Journal Biology
A Web Tool for Generating High Quality Machine-readable Biological Pathways

En Web værktøj til at generere høj kvalitet maskinlæsbare biologiske veje

DOI:
10.3791/54869-v

•

08:01 min

•

February 08, 2017

•

, , , , ,
1Department of Computer Science,University of Alberta, 2Department of Biological Sciences,University of Alberta

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:45Pathway Generation
  • 03:08Reaction Editing
  • 04:53Pathway Replication, Viewing, and Downloading
  • 05:50Results: Representative Pathway Editing Options
  • 06:34Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

PathWhiz er en omfattende, online vej tegning værktøj til at generere biokemiske og biologiske veje. Det bruger offentligt tilgængelige databaser og let udvides paletter, der består af pre-trukket pathway komponenter. Denne protokol beskriver, hvordan man nemt bygge nye veje, kopiere og redigere eksisterende veje, og udbrede tidligere trukket veje til forskellige organismer.

Tags

Keywords: Web ToolPathway GenerationMachine-readableBiochemical PathwaysPathWhizVisual Pathway CreatorBiological DetailComplexityPublic GalleryOperating SystemNew PathwayOrganismSpeciesTaxonomyReferencesReactionsReactantsProductsEnzymesStoichiometryElement TypeReaction DirectionEnzyme Addition

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/54869?article_type=v

A Neuronal and Astrocyte Co-Culture Assay for High Content Analysis of Neurotoxicity
check_url/54869?article_type=v

Lensless On-chip Imaging of Cells Provides a New Tool for High-throughput Cell-Biology and Medical Diagnostics
check_url/54869?article_type=v

Synthesis and Calibration of Phosphorescent Nanoprobes for Oxygen Imaging in Biological Systems
check_url/54869?article_type=v

Quantification of dsDNA using the Hitachi F-7000 Fluorescence Spectrophotometer and PicoGreen Dye
check_url/54869?article_type=v

A Noninvasive Hair Sampling Technique to Obtain High Quality DNA from Elusive Small Mammals
check_url/54869?article_type=v

Absolut kvantumudbytte Måling af pulverprøver
check_url/54869?article_type=v

Brug SecM Arrest Sequence som et redskab til at isolere ribo bundne polypeptider
check_url/54869?article_type=v

Generering af høj kvalitet Chromatin Immunoprecipitation DNA Skabelon til High-throughput sekventering (Chip-seq)
check_url/54869?article_type=v

High Throughput Microinjections af søpindsvin Zygoter
check_url/54869?article_type=v

siRNA Screening at identificere Ubiquitin og ubiquitinlignende System Regulators Biologisk Pathways i dyrkede pattedyrceller

Read Article