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RNA-Seq
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Overview
유전자 발현을 평가하는 다른 방법 중, RNA의 높은 처리량 시퀀싱, 또는 RNA-seq. 특히 매력적이며, 이전에 이용 가능한 게놈 정보에 의존하지 않고 수행하고 분석할 수 있기 때문에 특히 매력적입니다. RNA-seq 동안, 관심있는 샘플에서 분리 된 RNA는 DNA 라이브러리를 생성하는 데 사용되며, 이는 증폭되고 시퀀스됩니다. 궁극적으로 RNA-seq는 어떤 유전자가 표현되는지, 발현 수준 및 이전에 알려지지 않은 성적증명서의 존재를 결정할 수 있습니다.
여기서 JoVE는 RNA-seq의 기본 원리를 제시합니다. 그런 다음 일반적인 RNA-seq 프로토콜의 실험 및 분석 단계에 대해 논의합니다. 마지막으로, 우리는 연구원이 현재 RNA-seq를 어떻게 사용하고 있는지, 예를 들면, 다른 생물학 견본 사이 유전자 발현을 비교하거나, 단백질-RNA 상호 작용을 특성화하기 위하여 검토합니다.
Procedure
RNA 시퀀싱, 또는 RNA-seq는 세포 집단에서 “전사”로 알려진 발현된 모든 RNA의 서열 및 양에 대한 정보를 제공할 수 있는 기술이다. 알려진 RNA 서열에 대한 프로빙을 포함하는 마이크로어레이와 같은 다른 발현 프로파일링 방법과 달리 RNA-seq는 불순한 게놈을 가진 유기체로부터유전자 발현을 프로파일링할 수 있다. 추가적으로, RNA-seq는 마이크로어레이보다는 성적증명서 발현 수준의 더 큰 범위를 정확…
Disclosures
No conflicts of interest declared.
Transcript
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JoVE Science Education Database. JoVE Science Education. RNA-Seq. JoVE, Cambridge, MA, (2023).
