Journal
/
Genetics
/
Omfattande DNA-metyleringsanalys med användning av en metyl-CpG-bindande domänfångningsbaserad metod i patienter med kronisk lymfocytisk leukemi
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Comprehensive DNA Methylation Analysis Using a Methyl-CpG-binding Domain Capture-based Method in Chronic Lymphocytic Leukemia Patients
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Omfattande DNA-metyleringsanalys med användning av en metyl-CpG-bindande domänfångningsbaserad metod i patienter med kronisk lymfocytisk leukemi

DOI:
10.3791/55773-v

•

13:21 min

•

June 16, 2017

•

,
1Department of Medical Genetics, Institute of Biomedicine,Gothenburg University, 2Department of Clinical Chemistry and Transfusion Medicine, Institute of Biomedicine,Gothenburg University

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:49Genomic DNA Extraction and Sonication
  • 02:06Bead Preparation Prior to Binding with Methyl-CpG-binding Domain (MBD)-biotin Protein
  • 03:35Binding the MBD-biotin Protein to the Washed Beads
  • 04:59Binding MBD-biotin Beads with Fragmented Genomic DNA
  • 06:22Removing the Unbound DNA and Eluting the Methylated DNA from the Beads
  • 08:10Ethanol Precipitation and the Enrichment of Methylated DNA
  • 10:09Results: Identification of Differentially Methylated CpG Rich Regions in Chronic Lymphocytic Leukemia (CLL) Samples
  • 11:26Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Detta arbete beskriver ett optimerat metyl-CpG-bindningsdomän (MBD) sekvenseringsprotokoll och en beräkningsrörledning för identifiering av differentiellt metylerade CpG-rika regioner hos patienter med kronisk lymfocytisk leukemi (CLL).

Tags

DNA MethylationMethyl-CpG-binding DomainCapture-based MethodChronic Lymphocytic LeukemiaNext-generation SequencingGlobal Methylation ProfilingDifferentially Methylated CpG-rich RegionsCLL-specific Signature GenesDisease PathogenesisPrognosisGenomic DNA ExtractionSonicationMagnetic Streptavidin BeadsMBD-biotin Protein

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Bestämning av optimala kromosomala belägenheten för ett DNA-Element i Escherichia coli använder en ny metod för Transposon-medierad

Immunfärgning för DNA ändringar: tillämpad analys av Confocal bilder

Profilering DNA Replication Timing med zebrafiskar som ett In Vivo -modellsystem

Kandidat Gene tester i klinisk kohortstudier med multiplexade genotypning och masspektrometri

Metodik för korrekt upptäckt av mitokondrie-DNA metylering

Kvantitativ analys av alternativa Pre-mRNA Splicing i mus hjärnan sektioner med RNA In Situ hybridisering analys

Single-molekyl Förster resonans energiöverförings metoder för real tids utredning av Holliday Junction resolution av GEN1

Utredning av den transkriptionella roll som en RUNX1 Intronic ljuddämpare av CRISPR/Cas9 Ribonucleoprotein i akut myeloisk leukemi celler

Användning av pyrimidinanalogen, 5-jod-2′-deoxiuridin (IdU) med cellcykelmarkörer för att upprätta cellcykelfaser i en masscytometriplattform

LINE-1 Mesenkymala stamceller behandlade med osteosarkom-härledda extracellulära blåsor

Read Article