Journal
/
Bioengineering
/
Patroon-based Search van Epigenomic gegevens met behulp van GeNemo
JoVE Journal
Bioengineering
Author Produced
This content is Free Access.
JoVE Journal Bioengineering
Pattern-based Search of Epigenomic Data Using GeNemo
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Patroon-based Search van Epigenomic gegevens met behulp van GeNemo

DOI:
10.3791/56136-v

•

06:38 min

•

October 08, 2017

•

, ,
1Department of Bioengineering,University of California San Diego

Chapters

  • 00:00Title
  • 01:24Using GeNemo
  • 04:05Results
  • 04:56Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

In tegenstelling tot DNA sequencedata, epigenomic gegevens niet gemakkelijk worden blootgesteld aan tekstgebaseerde zoekopdrachten. Hier zijn de procedures voor het gebruik van een bijgewerkte versie van GeNemo, een tool web gebaseerde bioinformatics, uit te voeren patroon gebaseerde overeenkomsten in epigenomic gegevens vergelijken beschikbaar online databanken, met inbegrip van de encyclopedie van de elementen van het DNA met zoekt gebruikersgegevens.

Tags

– GeNemo- Epigenomic Data- Pattern-based Search- DNA-binding Protein- Epigenetic Modifications- Cell Types- ENCODE- Mousington- BED Format- Bigwig Format- Search Range- Chromosome- Base Pair

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/56136?article_type=v

Fabricatie van Micro-weefsels met behulp van modules van Collageen gel met cellen
check_url/56136?article_type=v

Buigstijfheid Metingen van Biopolymeren gebruik Zweefvliegen Assays
check_url/56136?article_type=v

Permeabilisatie van Gekleefd cellen met behulp van een inert gas Jet
check_url/56136?article_type=v

Van Voxels to Knowledge: Een praktische gids voor de segmentatie van Complex Electron Microscopy 3D-Data
check_url/56136?article_type=v

Scaled anatomisch model Creatie van biomedische tomografieafbeeldingssysteem gegevens en bijbehorende labels voor volgende Sub-surface Gravure van de Laser (SSLE) of Glass Crystals
check_url/56136?article_type=v

Het creëren van cardiale weefsels die mechanische integratie van sferoïden tonen met behulp van 3D bioprinting
check_url/56136?article_type=v

Beoordeling van de kwetsbaarheid van boviene corticaal bot met behulp van kras Tests
check_url/56136?article_type=v

Databases voor het efficiënt beheren van middelgrote, lage snelheid, multidimensionale data in weefsel engineering
check_url/56136?article_type=v

Modulerende vorm van polymersomen op polyesterbasis met osmotische druk
check_url/56136?article_type=v

Experimental and Data Analysis Workflow for Soft Matter Nanoindentation

Read Article