Intestinal organoid kulturer er etablert fra hele Krypter og tillater ikke analyse av selvtillit fornyelse og differensiering i en celle-spesifikk måte. Denne protokollen beskriver rekonstituering av sorterte stamme (Lgr5+) og nisje (Paneth) celler, som gir opphav til organoids mens deres tidligere biokjemiske og genetiske modifikasjoner og funksjonell analyse.