इस प्रोटोकॉल में सेल लाइनों और प्राथमिक कोशिकाओं के लिए चिप-seq, 4sU-seq, कुल आरएनए-seq, और ribosome profile के मिश्रित उपयोग का वर्णन है । यह समय के साथ प्रतिलेखन फ़ैक्टर बाइंडिंग, de नोवो प्रतिलेखन, आरएनए प्रोसेसिंग, कारोबार और अनुवाद में परिवर्तन पर नज़र रखने में सक्षम बनाता है, और सक्रिय और/या तेजी से बदलती कोशिकाओं में घटनाओं के समग्र पाठ्यक्रम प्रदर्शित