Journal
/
Genetics
/
Tilpasse 3' slutter hurtige forstærkning af CDNA for at kortlægge udskrifter i kræft
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Adapting 3′ Rapid Amplification of CDNA Ends to Map Transcripts in Cancer

Tilpasse 3' slutter hurtige forstærkning af CDNA for at kortlægge udskrifter i kræft

DOI:
10.3791/57318-v

•

09:38 min

•

March 28, 2018

•

,
1Department of Pharmaceutical Sciences, College of Pharmacy and Health Sciences,Butler University

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:01Cell Lysis and RNA Precipitation
  • 03:12cDNA Synthesis
  • 04:21Primer Search for Gene Transcript
  • 06:00Optimization and Verification of 3′ RACE to Map the 3′ UTR Using Two Different Enzymes
  • 07:46Results: Nested Forward Primer Search
  • 08:12Results: Successful Mapping of Cancer Transcripts
  • 09:03Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

De to forskellige 3' hurtige forstærkning af cDNA ender (3' RACE) protokoller beskrevet her gøre brug af to forskellige DNA polymeraser til at knytte sekvenser, der omfatter et segment af åben behandling ramme (ORF), stop-codon og den hele 3' UTR af et udskrift ved hjælp af RNA fremstillet af forskellige kræft cellelinjer.

Tags

Keywords: 3′ RACEMRNA TranscriptsCancerNested PCRTranscript SequencingPolyadenylation SignalStop Codon3′ UTRFusion GenesSplice VariantsRNA ExtractionPhenol-chloroformRNA PrecipitationRNA Resuspension

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/57318?article_type=v

Fletning absolutte og relative kvantitativ PCR data at kvantificere STAT3 Splice Variant Afskrifter
check_url/57318?article_type=v

Tekniske kunstige faktorer til specifikt manipulation af alternativ splejsning i humane celler
check_url/57318?article_type=v

Hurtig sletningsproduktion i svampe via<em> Agrobacterium</em> Medieret transformation af OSCAR-sletningskonstruktioner
check_url/57318?article_type=v

Høj opløsning fluorescerende In Situ hybridisering i Drosophila fostre og væv ved hjælp af Tyramide Signal forstærkning
check_url/57318?article_type=v

CRISPR-medieret reorganisering af kromatin løkke struktur
check_url/57318?article_type=v

Forstærkning af nær fuld længde HIV-1 provirus for næste Generation Sequencing
check_url/57318?article_type=v

Reverse transkription-Loop-medieret isotermisk forstærkning (RT-lampe) Assay for Zika Virus og husholdning gener i urin, Serum og myg prøver
check_url/57318?article_type=v

En murine cellelinje baseret model af kronisk CDK9 hæmning at studere udbredte ikke-genetiske Transkriptional forlængelse defekter (TEabsolut) i kræft
check_url/57318?article_type=v

Diskrimination og kortlægning af primære og forarbejdede transskriptioner i majs mitokondrier ved hjælp af en cirkulær RT-PCR-baseret strategi
check_url/57318?article_type=v

Undersøgelse af den transkriptionelle rolle af en RUNX1 intronic LYDDÆMPER af crispr/Cas9 ribonucleoprotein i akutte myeloid leukæmiceller

Read Article