Journal
/
Neuroscience
/
Identifisere transkripsjon faktor Olig2 genomisk bindende områder i akutt renset PDGFRα + celler av lav-cellers Chromatin Immunoprecipitation sekvensering analyse
JoVE Journal
Neuroscience
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Neuroscience
Identifying Transcription Factor Olig2 Genomic Binding Sites in Acutely Purified PDGFRα+ Cells by Low-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Analysis

Identifisere transkripsjon faktor Olig2 genomisk bindende områder i akutt renset PDGFRα + celler av lav-cellers Chromatin Immunoprecipitation sekvensering analyse

DOI:
10.3791/57547-v

•

12:29 min

•

April 16, 2018

•

, , ,
1The Vivian L. Smith Department of Neurosurgery, Center for Stem Cell and Regenerative Medicine,University of Texas Health Science Center

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:10Purification of PDGFRα Positive Oligodendrocyte Lineage Cells from Mouse
  • 05:03Low-cell ChIP Preparation and ChIP Library Construction for High-throughput Sequencing
  • 09:41Results: Use of ChIP Analysis to Study Genome-wide Binding of the Olig2 in OPCs
  • 11:42Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Her presenterer vi en protokoll som er utformet for å analysere genomet hele binding av oligodendrocyte transkripsjon faktor 2 (Olig2) i akutt renset hjernen oligodendrocyte precursor celler (OPCs) ved å utføre lav-cellers chromatin immunoprecipitation (ChIP) , bibliotek forberedelse, høy gjennomstrømming sekvensering og bioinformatic dataanalyse.

Tags

Transcription Factor Olig2PDGFR-α+ CellsChIP-seqLow-cell ChIP-seqOligodendrocyte Precursor CellsImmunopanningGenome-wide Transcriptional RegulationEpigenetic MechanismsCell DifferentiationCell Development

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/57547?article_type=v

Transfection of Mouse Retinal Ganglion Cells by in vivo Electroporation
check_url/57547?article_type=v

Live-cell Imaging of Sensory Organ Precursor Cells in Intact Drosophila Pupae
check_url/57547?article_type=v

Chromatin Immunoprecipitation from Dorsal Root Ganglia Tissue following Axonal Injury
check_url/57547?article_type=v

Påvisning av Protein palmitoylation i Cultured hippocampus neurons ved Immunoutfellingsanalyse og Acyl-Biotin Exchange (ABE)
check_url/57547?article_type=v

Ekstracellulært Identifisere motor nevroner for en muskel Motor Pool i<em> Aplysia californica</em
check_url/57547?article_type=v

Intracerebroventrikulær Injeksjon av amyloid-beta Peptider i normale mus til Akutt Fremkall Alzheimer-lignende kognitive mangler
check_url/57547?article_type=v

Vurdering av Dopaminergic homeostase i mus ved bruk av høytytende flytende kromatografi analyse og Synaptosomal dopamin opptak
check_url/57547?article_type=v

Isolasjon og dyrking av nevrale Progenitors etterfulgt av Chromatin-Immunoprecipitation av Histone 3 lysin 79 Dimethylation
check_url/57547?article_type=v

Isolasjon av voksen ryggmargen kjerner for massivt parallelle Single-kjernen RNA sekvensering
check_url/57547?article_type=v

Encellede RNA sekvensering av Fluorescently merket musen Neurons med manuell sortering og dobbel In Vitro transkripsjon absolutte teller sekvensering (DIVA-Seq)

Read Article