Journal
/
Neuroscience
/
Encellede RNA sekventering af Fluorescently mærket mus neuroner ved hjælp af manuel sortering og dobbelt In Vitro transskription med absolut tæller sekventering (DIVA-Seq)
JoVE Journal
Neuroscience
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Neuroscience
Single-cell RNA Sequencing of Fluorescently Labeled Mouse Neurons Using Manual Sorting and Double In Vitro Transcription with Absolute Counts Sequencing (DIVA-Seq)

Encellede RNA sekventering af Fluorescently mærket mus neuroner ved hjælp af manuel sortering og dobbelt In Vitro transskription med absolut tæller sekventering (DIVA-Seq)

DOI:
10.3791/58690-v

•

07:49 min

•

October 26, 2018

•

,
1Cold Spring Harbor Laboratory

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:43Preparation for Dissection and Neuron Sorting
  • 02:09Brain Sectioning and Cell Dissociation
  • 04:15Manual Sorting of Fluorescently Labeled Mouse Neurons
  • 05:59Results: Microdissection of GABAergic Neurons
  • 07:24Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Denne protokol beskriver den manuelle sortering procedure for at isolere enkelt fluorescently mærket neuroner efterfulgt af in vitro- transskription-baserede mRNA forstærkning til høj-dybde encellede RNA sekvensering.

Tags

Keywords: Single-cell RNA SequencingFluorescently Labeled NeuronsManual SortingDouble In Vitro TranscriptionDIVA-SeqNeuron IsolationSubpopulationFACS SortingGlass MicrocapillariesArtificial Cerebrospinal FluidProteaseFBSPasteur PipettesBrain DissectionVibratomeLabeled CellsActivity Blockers

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/58690?article_type=v

Ikke-Laser Capture Mikroskopi Tilgang til mikrodissektion af diskrete Mouse Brain Regioner for Total RNA Isolation og downstream næste generation sekventering og Gene Expression Profiling
check_url/58690?article_type=v

Enkelt-celle Profilering af at udvikle og Ældre retinaneuroner
check_url/58690?article_type=v

Real-time Imaging af axonal Transport af Quantum Dot-mærket BDNF i Primary neuroner
check_url/58690?article_type=v

Pålidelig Identifikation af Living dopaminerge neuroner i midthjernen Cultures Brug RNA Sequencing og TH-promotor-drevet eGFP Expression
check_url/58690?article_type=v

Single-cell RNA-Seq af definerede subsæt af retinale Ganglion-celler
check_url/58690?article_type=v

En In Vivo blod - hjerne barrieren permeabilitet Assay i mus ved hjælp af Fluorescently mærket røbestoffer
check_url/58690?article_type=v

At identificere transskription faktor Olig2 genomisk bindingssteder i akut renset PDGFRα + celler ved lav-celle kromatin Immunoprecipitation sekventering analyse
check_url/58690?article_type=v

Enkelt celle Multiplex Reverse transkription Polymerase Chain Reaction efter Patch-klemme
check_url/58690?article_type=v

Isolering af voksen rygmarven kerner for massivt Parallel Single-kernen RNA sekventering
check_url/58690?article_type=v

Isolering af region-specifikke mikroglia fra en voksen mus hjerne halvkugle for dyb single-celle RNA Sequencing

Read Article