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빼기 게놈에 의해 소설 시퀀스 검색

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Genetics

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JoVE Journal Genetics

Novel Sequence Discovery by Subtractive Genomics

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빼기 게놈에 의해 소설 시퀀스 검색

DOI:

10.3791/58877-v

•

09:40 min

•

January 25, 2019

•

Kathryn C. Asalone, Megan M. Nelson, John R. Bracht

¹Biology Department,American University

Chapters

00:04Title
01:08De novo Assemble Starting Sequence
02:03BLAST the Assembly Against the Reference Sequence
04:44Design Primers for the Sequence that Remains
06:25qPCR Validation of the Remaining Sequence
07:51Results: Example Data of qPCR Results Including Negative and Positive Outcomes
08:53Conclusion

Summary

Automatic Translation

이 프로토콜의 목적은 계산의 조합 및 벤치 연구를 사용 하 여 부분적 으로만 알려져 있을 수 있습니다 공동 정화 시퀀스에서 쉽게 분리 될 수 없는 새로운 시퀀스를 찾을 것입니다.

Tags

Novel Sequence Discovery Subtractive Genomics Genomic Sequences Inexpensive Flexible Bacterial Vaccine Targets Virus Identification Unknown Separation Reference Sequence Trimmomatic Pear Reptile Trinity Blast Transdeckor Tblastn

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