Journal
/
Genetics
/
Massa spectrometrie gebaseerde Proteomics Analyses met behulp van de OpenProt Database te onthullen nieuwe eiwitten vertaald uit niet-canonieke Open lezing Frames
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Mass Spectrometry-Based Proteomics Analyses Using the OpenProt Database to Unveil Novel Proteins Translated from Non-Canonical Open Reading Frames
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Massa spectrometrie gebaseerde Proteomics Analyses met behulp van de OpenProt Database te onthullen nieuwe eiwitten vertaald uit niet-canonieke Open lezing Frames

DOI:
10.3791/59589-v

•

07:38 min

•

April 11, 2019

•

,
1Department of Biochemistry,Université de Sherbrooke, 2PROTEO,Quebec Network for Research on Protein Function, Structure, and Engineering

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:52OpenProt Database Download
  • 01:53Database Handling
  • 02:41Mass Spectrometry File Preparation
  • 03:13Protein Quantification
  • 04:13Quality Control and OpenProt Database Mining
  • 05:25Results: Representative Interactor and Mass Spectrometry Identification of a Novel Protein
  • 06:40Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

OpenProt is een vrij toegankelijke databank die wordt afgedwongen door een polycistronic model van eukaryotische genomen. Hier presenteren we een protocol voor het gebruik van OpenProt databases wanneer ondervragen massaspectrometrie datasets. Met behulp van OpenProt zorgt database voor analyse van proteomic experimenten voor de ontdekking van de roman en eerder niet detecteerbaar eiwitten.

Tags

Mass SpectrometryProteomicsOpenProt DatabaseNon-canonical Open Reading FramesNovel ProteinsProteomeProteomic AnalysesDatabase HandlingMS Convert ToolMzML File Format

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/59589?article_type=v

subtypering van<em> Campylobacter jejuni</em> Ssp.<em> doylei</em> Isolaten, met behulp massaspectrometrie-gebaseerde PhyloProteomics (MSPP)
check_url/59589?article_type=v

Novel-RNA-bindende eiwitten Isolatie door de snelle Methodologie
check_url/59589?article_type=v

Conjugative Mating Testen voor sequentie-specifieke analyse van Transfer eiwitten die betrokken zijn in bacterieconjugatie
check_url/59589?article_type=v

Van een natuurlijk product om Zijn Biosynthetisch Gene Cluster: Een demonstratie met behulp van Polyketomycin<em> Streptomyces diastatochromogenes</em> Tü6028
check_url/59589?article_type=v

Bepaling van de optimale chromosomale locatie (s) voor een DNA Element in Escherichia coli met behulp van een nieuwe benadering van Transposon-gemedieerde
check_url/59589?article_type=v

Aanpassing van hybridisatie inname van chromatine-geassocieerde eiwitten voor Proteomics op zoogdiercellen
check_url/59589?article_type=v

Met behulp van de muis eicellen te beoordelen van menselijke genfunctie tijdens de meiose I
check_url/59589?article_type=v

Een snelle en kwantitatieve methode voor de posttranslationele wijziging en Variant ingeschakeld toewijzing van peptiden aan Genomes
check_url/59589?article_type=v

Verkennen van de effecten van de ruimtevaart op de Fysiologie van de muis met behulp van de Open Access NASA GeneLab Platform
check_url/59589?article_type=v

Met behulp van In Vitro en In cel vorm te onderzoeken klein molecuul veroorzaakte structurele veranderingen van de Pre-mRNA

Read Article