Journal
/
Genetics
/
Картирование вариантов болезни Альцгеймера к их целевым генам с помощью вычислительного анализа конфигурации хроматина
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Mapping Alzheimer’s Disease Variants to Their Target Genes Using Computational Analysis of Chromatin Configuration
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Картирование вариантов болезни Альцгеймера к их целевым генам с помощью вычислительного анализа конфигурации хроматина

DOI:
10.3791/60428-v

•

04:41 min

•

January 09, 2020

•

, , ,
1Department of Genetics,University of North Carolina, 2Neuroscience Center,University of North Carolina, 3Thurston Arthritis Research Center,University of North Carolina, 4Department of Cell Biology and Physiology,University of North Carolina

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:00Generation of a Granges Object for Credible SNPs and Positional Mapping
  • 01:53Developmental Expression Trajectories
  • 02:18Cell-type Expression Profiles and Gene Annotation Enrichment Analysis
  • 02:46Results: Determination and Characterization of Putative Target Genes of AD GWS Loci
  • 03:52Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Мы представляем протокол для определения функциональных последствий некодирующих вариантов, выявленных в ходе общегеномных ассоциативных исследований (GWAS) с использованием трехмерных взаимодействий хроматина.

Tags

Alzheimer’s DiseaseGWASChromatin ConfigurationComputational AnalysisTarget GenesSNPsHi-CGene ExpressionCell-type ExpressionGene Annotation Enrichment

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/60428?article_type=v

Сопоставление взаимодействия РНК-РНК в глобальном масштабе с использованием биотинилированного псоралена
check_url/60428?article_type=v

Последовательные соли экстракции для анализа массовых Chromatin привязки свойств Chromatin изменения комплексы
check_url/60428?article_type=v

Анализ промотора c-KIT-лиганда с использованием иммунопреципитации хроматина
check_url/60428?article_type=v

Ретровирусное сканирование: определение сайтов интеграции MLV для определения регуляторных областей, специфичных для клеток
check_url/60428?article_type=v

Картирование генома всей доступной хроматина в основной человеческий Т-лимфоцитов, ATAC-Seq
check_url/60428?article_type=v

Иммуноокрашивания для модификации ДНК: Вычислительный анализ конфокальный изображений
check_url/60428?article_type=v

С помощью снайпера Cas9 для сведения к минимуму последствий пробить ТРИФОСФАТЫ Cas9 без потери на цель деятельности через направленной эволюции
check_url/60428?article_type=v

Протокол In Vitro для оценки уровней, функций и связанных с ними целевых генов в опухолевых клетках
check_url/60428?article_type=v

В Vivo Функциональное исследование связанных с болезнями редких человеческих вариантов с использованием дрозофилы
check_url/60428?article_type=v

Идентификация циркулярных РНК с использованием секвенирования РНК

Read Article