Journal
/
Biochemistry
/
Overvågning af protein-RNA-interaktionsdynamik in vivo ved høj tidsmæssig opløsning ved hjælp af χCRAC
JoVE Journal
Biochemistry
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochemistry
Monitoring Protein-RNA Interaction Dynamics In Vivo at High Temporal Resolution Using χCRAC

Overvågning af protein-RNA-interaktionsdynamik in vivo ved høj tidsmæssig opløsning ved hjælp af χCRAC

DOI:
10.3791/61027-v

•

09:15 min

•

May 09, 2020

•

, , , , , , , , ,
1Centre for Engineering Biology,University of Edinburgh, 2Institute of Cell Biology,University of Edinburgh, 3Department of Molecular Biology and Genetics,Aarhus University, 4UVO3 Ltd.

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:58UV Crosslinking and Lysate Production
  • 03:18Elution and SDS-PAGE
  • 05:24PCR and Gel Extraction
  • 07:06Results: Temporal Binding of Nrd1 to its Targets
  • 08:47Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Kinetisk tværbinding og analyse af cDNA er en metode, der muliggør undersøgelse af dynamikken i protein-RNA-interaktioner i levende celler ved høj tidsmæssig opløsning. Her beskrives protokollen detaljeret, herunder vækst af gærceller, UV-tværbinding, høst, proteinrensning og næste generations sekventeringsbiblioteksforberedelsestrin.

Tags

Protein-RNA InteractionKinetic CRACUV CrosslinkingRNA Binding ProteinsRNA ExtractionCell HarvestingTime-resolved AnalysisLive Cell MonitoringStress ResponseAdherent CellsMicroorganisms

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/61027?article_type=v

High-resolution single particle analyse fra elektronkryo-mikroskopi billeder ved hjælp af SPHIRE
check_url/61027?article_type=v

Bruger i Vitro fluorescens resonans energioverførsel at studere dynamikken i proteinkomplekser på en millisekund tidsskala
check_url/61027?article_type=v

In vivo calcium Imaging i C. elegans krop væg muskler
check_url/61027?article_type=v

Proteom-wide kvantificering af mærkning homogenitet på enkelt-molekyle niveau
check_url/61027?article_type=v

Undersøge dynamikken i cellulære vedhæftning og spredning af Epiteliale celler på Fibronectin under oxidativ stress
check_url/61027?article_type=v

Kvantificering af protein interaktions netværk dynamik ved hjælp af Multiplexed Co-Immunopræcipitation
check_url/61027?article_type=v

Dual-Color Fluorescens Krydskorrelation Spektroskopi til undersøgelse protein-protein interaktion og protein dynamik i levende celler
check_url/61027?article_type=v

Overvågning af proteinaggregeringskinetik in vivo ved hjælp af automatiseret inklusionstælling i caenorhabditis elegans
check_url/61027?article_type=v

Rutinemæssig indsamling af kryo-EM-datasæt i høj opløsning ved hjælp af 200 KV transmissionselektronmikroskop
check_url/61027?article_type=v

Neutronspektroskopi med høj opløsning til undersøgelse af picosekund-nanosekunddynamik af proteiner og hydreringsvand

Read Article