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Überwachung der Protein-RNA-Interaktionsdynamik in vivo mit hoher zeitlicher Auflösung unter Verwendung von χCRAC
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Monitoring Protein-RNA Interaction Dynamics In Vivo at High Temporal Resolution Using χCRAC
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Überwachung der Protein-RNA-Interaktionsdynamik in vivo mit hoher zeitlicher Auflösung unter Verwendung von χCRAC

DOI:
10.3791/61027-v

•

09:15 min

•

May 09, 2020

•

, , , , , , , , ,
1Centre for Engineering Biology,University of Edinburgh, 2Institute of Cell Biology,University of Edinburgh, 3Department of Molecular Biology and Genetics,Aarhus University, 4UVO3 Ltd.

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:58UV Crosslinking and Lysate Production
  • 03:18Elution and SDS-PAGE
  • 05:24PCR and Gel Extraction
  • 07:06Results: Temporal Binding of Nrd1 to its Targets
  • 08:47Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Die kinetische Vernetzung und Analyse von cDNA ist eine Methode, die es ermöglicht, die Dynamik von Protein-RNA-Interaktionen in lebenden Zellen mit hoher zeitlicher Auflösung zu untersuchen. Hier wird das Protokoll detailliert beschrieben, einschließlich des Wachstums von Hefezellen, der UV-Vernetzung, der Ernte, der Proteinreinigung und der Vorbereitungsschritte der Next-Generation-Sequencing-Bibliothek.

Tags

Protein-RNA InteractionKinetic CRACUV CrosslinkingRNA Binding ProteinsRNA ExtractionCell HarvestingTime-resolved AnalysisLive Cell MonitoringStress ResponseAdherent CellsMicroorganisms

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