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組織サンプルの質量分析ベースのショットガンプロテオミクスの包括的ワークフロー
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Biology
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JoVE Journal Biology
Comprehensive Workflow of Mass Spectrometry-based Shotgun Proteomics of Tissue Samples
DOI:

14:51 min

November 13, 2021

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Chapters

  • 00:00Introduction
  • 00:42Tissue Lysate Preparation
  • 01:51Quantification and Quality Check of Tissue Lysates
  • 02:33Enzymatic Digestion of Proteins
  • 03:57Desalting of Digested Peptides
  • 05:16Quantification of Desalted Peptides
  • 05:58Labeling of Digested Peptides using iTRAQ Reagents
  • 08:14Liquid Chromatography Set-up
  • 09:25Mass Spectrometry Set-up
  • 12:30Representative Results
  • 13:45Conclusions

Summary

Automatic Translation

記載されたプロトコルは、ラベルベースとラベルフリー定量の2つのアプローチを用いて、組織サンプルの最適化された定量プロテオミクス分析を提供します。ラベルベースのアプローチは、より正確なタンパク質定量の利点を有する一方で、ラベルフリーアプローチはより費用対効果が高く、コホートの何百ものサンプルを分析するために使用されます。

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