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次世代シーケンシングを用いたT細胞受容体免疫レパートリー解析

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T and B Cell Receptor Immune Repertoire Analysis using Next-generation Sequencing

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次世代シーケンシングを用いたT細胞受容体免疫レパートリー解析

DOI:

10.3791/61792-v

•

08:59 min

•

January 12, 2021

•

Lael Werner², Chen Dor⁴, Naomi Salamon, Meital Nagar⁴, Dror S. Shouval²

¹Pediatric Gastroenterology Unit, Edmond and Lily Safra Children’s Hospital,Sheba Medical Center, ²Sackler Faculty of Medicine,Tel Aviv University, ³Cancer Research Center,Sheba Medical Center, ⁴Molecular Hematology Laboratory,Sheba Medical Center

Chapters

00:05Introduction
00:48DNA Isolation and Library Preparation
04:21Amplicon Purification and Quantification
05:57Next-generation Sequencing
06:57Results: TCRβ and IGH Immune Repertoire Data Analysis
08:27Conclusion

Summary

Automatic Translation

現在のプロトコルは、血液サンプルおよび腸内生検からのDNA分離、次世代シーケンシングのためのTCRβおよびIGH PCRライブラリの生成、NGSランの性能および基本的なデータ分析のための方法を記述する。

Tags

Keywords: T Cell Receptor B Cell Receptor Next-generation Sequencing Lymphocyte Diversity Biomarkers DNA Isolation Cell Lysis Proteinase K Protein Precipitation DNA Extraction

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