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Adaptation des organoïdes gastro-intestinaux à l’infection pathogène et au séquençage unicellulaire dans des conditions de biosécurité de niveau 3 (BSL-3)
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Immunology and Infection
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JoVE Journal Immunology and Infection
Adapting Gastrointestinal Organoids for Pathogen Infection and Single Cell Sequencing under Biosafety Level 3 (BSL-3) Conditions
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Adaptation des organoïdes gastro-intestinaux à l’infection pathogène et au séquençage unicellulaire dans des conditions de biosécurité de niveau 3 (BSL-3)

DOI:
10.3791/62857-v

•

07:59 min

•

September 10, 2021

•

,
1Department of Infectious Diseases, Molecular Virology,Heidelberg University Hospital, 2Department of Molecular Genetics and Microbiology, College of Medicine,University of Florida, Gainesville, 3Department of Infectious Diseases, Virology,Heidelberg University Hospital, 4Research Group “Cellular Polarity and Viral Infection”,German Cancer Research Center (DKFZ)

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:04Preparation of Single-Cell Solution and Preparation of Gel Beads-in-Emulsion Under Biosafety Level 3 Conditions
  • 05:47Results: Characterization of Host/Pathogen Interactions at a Single-Cell Level Using scRNAseq Technology
  • 07:11Conclusion

Summary

Automatic Translation

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Ce protocole décrit comment infecter les organoïdes intestinaux humains de leur côté apical ou basolatéral pour caractériser les interactions hôte/pathogène au niveau de la cellule unique à l’aide de la technologie de séquençage de l’ARN unicellulaire (scRNAseq).

Tags

Keywords: Gastrointestinal OrganoidsPathogen InfectionSingle Cell SequencingBiosafety Level 3Viral InfectionIntestinal EpitheliumDifferentiated OrganoidsExtracellular MatrixDissociation EnzymeSingle Cell RNA Sequencing

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