Journal
/
Biology
/
Inherent Dynamics Visualizer ، تطبيق تفاعلي لتقييم وتصور المخرجات من خط أنابيب الاستدلال على شبكة تنظيم الجينات
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Inherent Dynamics Visualizer, an Interactive Application for Evaluating and Visualizing Outputs from a Gene Regulatory Network Inference Pipeline
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Inherent Dynamics Visualizer ، تطبيق تفاعلي لتقييم وتصور المخرجات من خط أنابيب الاستدلال على شبكة تنظيم الجينات

DOI:
10.3791/63084-v

•

10:44 min

•

December 07, 2021

•

, , , ,
1Department of Biology,Duke University, 2Department of Mathematical Sciences,Montana State University, 3Department of Mathematical Sciences,Florida Atlantic University

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:46Node Finding
  • 03:40Edge Finding
  • 05:32Network Finding
  • 08:14Results: Investigating the Core Oscillator Gene Regulatory Network of the Yeast Cell-Cycle
  • 10:06Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

إن Inherent Dynamics Visualizer عبارة عن حزمة تصور تفاعلية تتصل بأداة استدلال شبكة تنظيمية جينية لتوليد محسن ومبسط لنماذج الشبكات الوظيفية. يمكن استخدام المتخيل لاتخاذ قرارات أكثر استنارة لوضع معلمات أداة الاستدلال ، وبالتالي زيادة الثقة في النماذج الناتجة.

Tags

Gene Regulatory NetworkInference PipelineInherent Dynamics VisualizerInteractive ApplicationVisualizationParameter ExplorationTime Series DataAnnotation FileOutput FileNumber Of ProcessesDLxJTKCutoffGene List

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

التنظيمية خلايا T : الإمكانات العلاجية لعلاج رفض الأعضاء والنوع الأول من مرض السكري

باستخدام خلية مكافحة الآلي لتبسيط دراسات التعبير الجيني : ضربة قاضية سيرنا من IL - 4 التعبير الجيني في الخلايا التابعة Namalwa

الكمية مقارنة رابطة الدول المستقلة التنظيم العنصر (لجنة المساواة العرقية) في الأنشطة المعدلة وراثيا ذبابة الفاكهة السوداء البطن</em

باستخدام SecM تسلسل توقيف كأداة لعزل البروتينية منضم ريبوسوم

انتقائية لقطة من hydroxymethylcytosine-5 من الحمض النووي الجيني

خط أنابيب سريعة وموثوق بها للدراسة وتحليل الحالات البكتيرية Transcriptome على: تنظيم الجينات سيرين التي تعتمد في<em> العقدية الرئوية</em

تصور التردد Stromule مع مضان المجهر

طريقة بسيطة لعزل بروتوبلاستس فول الصويا وتطبيق لتحليل التعبير الجيني عابر

التصوير البصري المستند إلى الصمامات الثنائية الضوئية لتسجيل ديناميكيات الشبكة بدقة أحادية الخلايا العصبية في اللافقاريات غير المعدلة وراثيا

خط أنابيب المعلوماتية الحيوية للتحقيق في التطور الجزيئي والتعبير الجيني باستخدام الحمض النووي الريبي-seq

Read Article