Journal
/
Biochemistry
/
Modellering av et enzymaktivt nettsted ved hjelp av molekylær visualisering Freeware
JoVE Journal
Biochemistry
Author Produced
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochemistry
Modeling an Enzyme Active Site using Molecular Visualization Freeware

Modellering av et enzymaktivt nettsted ved hjelp av molekylær visualisering Freeware

DOI:
10.3791/63170-v

•

14:37 min

•

December 25, 2021

•

, , , , ,
1The University of Texas at Austin, 2Mount Mary University, 3College of St. Benedict/St. John’s University, 4Wabash College

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 01:42Protocol: UCSF ChimeraX
  • 03:14Results: UCSF ChimeraX
  • 03:33iCN3D Protocol
  • 06:38Results: iCN3D
  • 07:02Protocol: Jmol
  • 09:47Results: Jmol
  • 10:08Protocol: PyMOL
  • 12:56Results: PyMOL
  • 14:01Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

En viktig ferdighet i biomolekylær modellering er å vise og kommentere aktive steder i proteiner. Denne teknikken er demonstrert ved hjelp av fire populære gratis programmer for makromolekylær visualisering: iCn3D, Jmol, PyMOL og UCSF ChimeraX.

Tags

Keywords: Molecular VisualizationEnzyme Active SiteGlucokinasePDBID 3FGULigandsSubstrate AnalogCatalytic ComplexBinding InteractionsUCSF ChimeraXMolecular ModelingBiological MacromoleculesVisualization Software

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/63170?article_type=v

Kartlegging av bindingssetet på en Aptamer på ATP Bruke mikro termodiffusjon
check_url/63170?article_type=v

Oligopeptidkonkurranseanalyse for fosforyleringsstedbestemmelse
check_url/63170?article_type=v

Nettstedet-rettet mutagenese for In Vitro og Vivo eksperimenter eksemplifisert med RNA samhandling i Escherichia Coli
check_url/63170?article_type=v

Fluorescerende visualisering av mango-Tagged RNA i polyakrylamid gels via en Poststaining metode
check_url/63170?article_type=v

Uttrykk, rensing, krystallisering, og enzym analyser av Fumarylacetoacetate Hydrolase domene-inneholdende proteiner
check_url/63170?article_type=v

Evaluering av protein-protein interaksjoner ved hjelp av en on-membran fordøyelsen Technique
check_url/63170?article_type=v

Karakterisering på Molecular Level bruker robust biokjemiske tilnærminger av en ny kinase protein
check_url/63170?article_type=v

Visualisering av østrogenreseptorer i kolon av mus med TNBS-indusert Crohns sykdom ved hjelp av immunofluorescens
check_url/63170?article_type=v

Enkeltcelleanalyse av transkripsjonsaktive alleler av enkeltmolekyl fisk
check_url/63170?article_type=v

Stedsspesifikk lysinacetylering av histoner for nukleosomrekonstituering ved bruk av genetisk kodeutvidelse i Escherichia coli

Read Article