Journal
/
Biochemistry
/
Moleküler Görselleştirme Freeware Kullanarak Bir Enzim Aktif Sitesini Modelleme
JoVE Journal
Biochemistry
Author Produced
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochemistry
Modeling an Enzyme Active Site using Molecular Visualization Freeware
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Moleküler Görselleştirme Freeware Kullanarak Bir Enzim Aktif Sitesini Modelleme

DOI:
10.3791/63170-v

•

14:37 min

•

December 25, 2021

•

, , , , ,
1The University of Texas at Austin, 2Mount Mary University, 3College of St. Benedict/St. John’s University, 4Wabash College

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 01:42Protocol: UCSF ChimeraX
  • 03:14Results: UCSF ChimeraX
  • 03:33iCN3D Protocol
  • 06:38Results: iCN3D
  • 07:02Protocol: Jmol
  • 09:47Results: Jmol
  • 10:08Protocol: PyMOL
  • 12:56Results: PyMOL
  • 14:01Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Biyomoleküler modellemede önemli bir beceri, proteinlerdeki aktif bölgelerin görüntülenmesi ve açıklamalarının gösterilmesidir. Bu teknik makromoleküler görselleştirme için dört popüler ücretsiz program kullanılarak gösterilmiştir: iCn3D, Jmol, PyMOL ve UCSF ChimeraX.

Tags

Keywords: Molecular VisualizationEnzyme Active SiteGlucokinasePDBID 3FGULigandsSubstrate AnalogCatalytic ComplexBinding InteractionsUCSF ChimeraXMolecular ModelingBiological MacromoleculesVisualization Software

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/63170?article_type=v

Mikro Termoforesis kullanarak ATP bir aptamer Bağlama Sitesi Haritalama
check_url/63170?article_type=v

Fosforilasyon Saha Tespiti İçin Oligopeptide Rekabet Testi
check_url/63170?article_type=v

Site yönettiği Mutagenesis in Vitro ve Escherichia Coli etkileşimlerde RNA ile örneği Vivo deneyler için
check_url/63170?article_type=v

Polyacrylamide jeller içinde Mango-Tagged RNA floresan görselleştirme bir Poststaining yöntemi ile
check_url/63170?article_type=v

Fumarylacetoasetat Hydrolase etki alanı Içeren proteinleri ifade, arıtma, kristalizasyon ve enzim Asdimleri
check_url/63170?article_type=v

Bir on-membran sindirim tekniği kullanılarak protein-protein etkileşimlerinin değerlendirilmesi
check_url/63170?article_type=v

Yeni kinaz proteinin sağlam biyokimyasal yaklaşımlar kullanılarak moleküler düzeyde karakterize edilmesi
check_url/63170?article_type=v

İmmünofluoresans kullanarak TNBS'ye Bağlı Crohn Hastalığı olan Farelerin Kolonlarında Östrojen Reseptörlerinin Görüntülenmesi
check_url/63170?article_type=v

Transkripsiyonel Aktif Alellerin Tek Molekül FISH ile Tek Hücre Analizi
check_url/63170?article_type=v

Escherichia coli'de Genetik Kod Genişlemesi Kullanılarak Nükleozom Rekonses için Histonların Siteye Özgü Lizin Asetilasyonu

Read Article