Her beskriver vi to modifikasjoner av DNA-fiberanalysen for å undersøke enkeltstrengede DNA-hull i replikering av DNA etter lesjonsinduksjon. S1 fiberanalyse gjør det mulig å oppdage postrepliktive hull ved hjelp av den ssDNA-spesifikke S1 endonuclease, mens gapfyllingsanalysen tillater visualisering og kvantifisering av gapreparasjon.