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Chapters
- 00:04Introduction
- 01:04Cell Lysis and Tn5 Tagmentation
- 01:52DNA Purification
- 02:57PCR Amplification
- 03:43Beads Purification
- 04:26Results: Comparison of TSS Enrichment Scores and Differential Peaks Obtained Using Optimized Cell‐Lysis Buffers, Cell Number Input, and Tn5 Concentration of ATAC‐Seq Libraries
- 06:33Conclusion
एटीएसी-सेक एक डीएनए अनुक्रमण विधि है जो प्रतिलेखन कारकों द्वारा मध्यस्थता वाले क्रोमैटिन पहुंच में परिवर्तन को मैप करने के लिए हाइपरएक्टिव म्यूटेंट ट्रांसपोसेस, टीएन 5 का उपयोग करती है। एटीएसी-सेक कैंसर कोशिकाओं में फेनोटाइपिक परिवर्तनों को अंतर्निहित आणविक तंत्र की खोज को सक्षम बनाता है। यह प्रोटोकॉल कैंसर कोशिकाओं सहित उपकला कोशिका प्रकारों में एटीएसी-सेक के लिए अनुकूलन प्रक्रियाओं को रेखांकित करता है।
