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インシリコで 宿主-病原体相互作用におけるcircRNAの同定と特性評価
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Biology
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JoVE Journal Biology
In Silico Identification and Characterization of circRNAs During Host-Pathogen Interactions
DOI:

10:27 min

October 21, 2022

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:02CircRNA Predictions
  • 01:46Differential Expression Analysis and Filtering of DE circRNAs
  • 03:26Predicting the circRNA-miRNA Interaction Using Circr
  • 05:05Construction of the ceRNA Network
  • 06:34Functional Enrichment Analysis
  • 07:49Results: Functional Analysis of DE circRNAs Parental Genes Using GO and KEGG Enrichment
  • 09:43Conclusion

Summary

Automatic Translation

ここで提出されたプロトコルは、宿主と病原体の相互作用を研究するRNAシーケンシングトランスクリプトームデータからcircRNAを予測し、機能的に特徴付けるために必要な完全な インシリコ パイプラインを説明しています。

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