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यहां, हम माउस और मानव सेल लाइनों से एमएचसी कक्षा I और कक्षा II पेप्टाइड परिसरों के शुद्धिकरण के लिए एक प्रोटोकॉल प्रस्तुत करते हैं जो उच्च गुणवत्ता वाले इम्यूनोपेप्टिडोमिक्स डेटा प्रदान करते हैं। प्रोटोकॉल व्यावसायिक रूप से उपलब्ध एंटीबॉडी का उपयोग करके नमूना तैयारी पर केंद्रित है।
