Summary

エメラルドアッシュボーラーの遺伝子発現の解析( Agrilus planipennis)を使用して定量的リアルタイム- PCR

Published: May 04, 2010
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Summary

定量リアルタイムPCR(定量RT – PCR)が異なる昆虫の組織と発達段階にmRNAレベルを診断する有効なツールです。このレポートでは、異なる幼虫の組織や侵襲的な昆虫種の発達段階で把握するmRNAのレベルまで定量RT – PCRの使用、エメラルド灰ボーラーを示す。

Abstract

エメラルド灰のボーラー(EAB、<em> Agrilus planipennis</em>)灰の木々の何百万人を殺してエキゾチックな侵襲的な害虫であり、(<em>アオダモ</em北米で>属)。<strong></strong> EABは、急速に普及し続け、成熟した木々の苗木から、さまざまな年齢の灰の木を攻撃する。しかし、非常にほとんど、あるいはまったく分子知識がEABのために存在する日付に。私たちは、灰の木々の成功した植民地化の援助のEABという組織レベルでの分子ベースの生理学的プロセスを解読することに興味がある。本報告書では、別の幼虫組織における把握するmRNAのレベルまで定量的リアルタイムPCR(定量RT – PCR)(中腸、脂肪体とキューティクルを含む)と1を含むさまざまな発達段階(の効果的な使用方法を示して<sup> ST</sup> – 、2<sup> ND</sup> – 、3<sup> RD</sup> – 、4<sup>目</supEABの> -齢期、prepupaeと大人)。例として、peritrophinの遺伝子(ここに名前、<em> AP – PERI1</em>)は、目的の遺伝子とリボソームタンパク質(のように例示されている<em> AP – RP1</em>)内部統制として。 Peritrophinsは昆虫腸の粘膜であるperitrophic膜/マトリクス(PM)、の重要なコンポーネントです。 PMは、消化と腸上皮への機械的保護を含む多様な機能を備えています。

Protocol

別のステップで完全なプロトコルは、図1のフローチャートに示されている。解剖を構成する個々のステップは、RNA抽出、ファーストストランドcDNA合成や定量RT – PCRは以下に詳述する。 I.幼虫の解剖この手順の開始時、代わりにエメラルド灰ボーラー、またはEAB、湿ったティッシュペーパーで幼虫の前に解剖が行われるまで。新しく調製した1Xリン酸塩は解剖を通?…

Discussion

閾値サイクル(Ct値)の値は、定量RT – PCRプレートに各サンプルについて得られる。標準曲線を作成するために、各希釈液について得られたCt値は、その濃度の対数に対してプロットした。実験サンプルのCt値は、この希釈系列の標準曲線にプロットした。目標量は、それぞれの実験、すなわち組織や発生過程での発現用に生成された別々の標準曲線から計算した。相対式の値は、(回転)し?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

我々は、実験のセットアップでルルドデルタArruetaアンテケラ(昆虫学科、オハイオ州立大学/ OARDC、ウースター、オハイオ州)が提供するヘルプを認めます。我々は、EAB幼虫のサンプルを送るための博士テレーズポーランドを(USDA、森林サービス、NRS)感謝。顕微鏡のセットアップが認識されているとDr。ルイスカナスとNuris Mアコスタが提供するのに役立ちます。このプロジェクトの資金は、オハイオ農業研究開発センター、オハイオ州立大学に充当州と連邦資金によって提供されていました。

References

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check_url/cn/1974?article_type=t

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Cite This Article
Bhandary, B., Rajarapu, S. P., Rivera-Vega, L., Mittapalli, O. Analysis of Gene Expression in Emerald Ash Borer (Agrilus planipennis) Using Quantitative Real Time-PCR. J. Vis. Exp. (39), e1974, doi:10.3791/1974 (2010).

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