Summary

이중 가닥 RNA와 패턴 인식 수용 체 부정적인 감 RNA 바이러스 감염에의 confocal 영상

Published: January 26, 2019
doi:

Summary

RNA 바이러스 복제 생산 하는 이중 가닥 RNA는 타고 난 면역 반응 유도 하 패턴 인식 수용 체에 의해 인식할 수 있습니다. 부정적인 감 RNA 바이러스에 대 한 낮은 수준의 dsRNA와 호흡기 간의 상호 작용 불분명 남아 있습니다. Arenavirus dsRNA와 개별 셀에서 PRR를 시각화 하는 confocal 현미경 검사 법 방법을 개발 했습니다.

Abstract

더블-좌초 (ds) RNA는 RNA 바이러스 감염 시 일차 중간으로 생산 됩니다. 호스트 패턴 인식 수용 체 (호흡기) retinoic 산 등으로 dsRNA의 인식 (장비-나) 수용 체 (RLRs) 의장 처럼-난 및 흑색 종 분화 관련 단백질 5 (MDA-5) 타고 난 면역 반응의 유도에 이르게. 형성 및 세포내 분포 긍정적인 감 RNA 바이러스 감염에서에서 dsRNA가 되었습니다 잘 특징 현미경 검사 법. 일부 arenaviruses를 포함 하 여 많은 부정적인 감 RNA 바이러스 감염 시 타고 난 면역 반응을 트리거합니다. 그러나, 부정적인 감 RNA 바이러스는 dsRNA 바이러스 성 dsRNA의 PRR 인식의 이미징 연구를 방해 하는 낮은 수준의 생산으로 생각 되었다. 또한, 감염 실험 높게 병원 성 arenaviruses 높은 견제 biosafety 수준 시설 (BSL-4)에서 수행 되어야 합니다. 높게 병원 성 RNA 바이러스에 대 한 바이러스 성 RNA와 호흡기 간의 상호 작용 크게 알려진 연구자 BSL-4 시설에서 직면 하는 추가 기술 도전 때문입니다. 최근, 단일 클론 항 체 (Mab) (클론 9D 5) 원래 팬 엔테로바이러스 감지에 사용 특히 dsRNA 전통적인 J2 또는 K1 안티 dsRNA 항 체 보다 더 높은 감도와 감지 하 발견 되었습니다. 9D 5를 이용 하 여 여기, 항 체, confocal 현미경 검사 법 프로토콜 dsRNA, 바이러스 성 단백질 및 PRR arenavirus에 의해 감염 하는 개별 셀에 동시에 시각화를 성공적으로 사용 된 설명. 프로토콜은 또한 이미징 연구 dsRNA 및 PRR 분포 BSL4 시설에서 감염 하는 병원 성 arenavirus 세포에 적합 합니다.

Introduction

타고 난 면역 반응의 유도의 초기 단계는 더블-좌초 (ds) RNA retinoic 산 등 패턴 인식 수용 체 (호흡기)에 의해 호스트 인식 (장비-나) 수용 체 (RLRs) 의장 처럼-난 및 흑색 종 분화 관련 단백질 5 (MDA-5)1. 긍정적인 감 RNA 바이러스, dsRNA 수 있습니다 일반적으로 쉽게 감지가 J2 또는 K1 안티 dsRNA 단일 클론 항 체 (Mab)2를 사용 하 여. DsRNA와 호흡기 간의 상호 작용 picornavirus, 같은 긍정적인 물가 RNA 바이러스에 confocal 현미경 검사 법3을 사용 하 여 특징 되었습니다 했다. 그러나, 부정적인 감 RNA 바이러스에 대 한 시각화 및 PRR 및 dsRNA 상호 작용의 특성은 되었습니다 의해 방해 dsRNA에 중요 한 항 체의 부족. RNA 형광 제자리 교 잡 (물고기) 바이러스 성 RNA와 호흡기4의 시각화에 적용 되었습니다. 그럼에도 불구 하 고, 물고기 방법론 대상 RNA 시퀀스의 지식이 필요 하 고 PRR 공동 얼룩과 호환 되지 않을 수 있습니다. 최근, 9D 5는 원래 팬 엔테로바이러스 감염의 진단에 대 한 개발, Mab 발견 됐다 J2 Mab 보다 더 예민 하 고 쉽게 수 부정적인 감 RNA 바이러스 감염5,6에서 dsRNA를 감지. 따라서, Mab 9D 5 소설과 바이러스 성 복제 및 PRR 부정적인 감 RNA 바이러스에 대 한 바이러스 성 RNA의 상호작용 연구에 유용한 도구 이다.

Arenaviruses는 Lassa 바이러스 (LASV), Junín 바이러스 (JUNV)와 Machupo (MACV), 인간7에서 심각한 출혈 질병의 원인이 그 같은 여러 인간 병원 체를 포함 하는 단일 가닥, 부정적인 감 RNA 바이러스의 가족입니다. 임상 데이터로 새로운 세계 arenavirus JUNV에 의해 발생 하는 아르헨티나 출혈의 심각 하 고 치명적인 경우 혈 청 IFN-α8,9의 비정상적으로 높은 수준의 전시. 우리 병원 성 NW arenaviruses (JUNV, MACV), 하지만 하지는 병원 성 올드 월드 arenavirus, LASV, 유도 종류 것으로 나타났습니다 내가 인간 monocyte 파생 된 모 수석 세포10인터페론 (IFN) 응답. 또한, 장비-센서 중 하나입니다 중재 유형 I IFN 응답 JUNV 감염 세포11. 우리는 또한 전통적으로 dsRNA 인식에 대 한 알려져 있다는 단백질 키 니 아 제 R (PKR) 수용 체 병원 성 NW arenavirus 감염12활성화 됩니다 발견. 더 arenavirus 감염 시 바이러스 관련 IFN 응답의 메커니즘을 이해, 우리는 바이러스 성 dsRNA와 세포질 호흡기 간의 상호 작용을 시각화 하기 위해 프로토콜을 개발 목적.

병원 성 JUNV, MACV 및 LASV 감염 실험 biosafety에서 수행 되어야 하는 레벨 4 (BSL-4) 시설. 따라서, 뿐만 아니라 arenavirus 감염에 dsRNA의 아마도 낮은 수준 biosafety 요구 사항을 충족입니다 다른 기술 도전이 높게 병원 성 바이러스에 대 한 이미징 연구를 수행할 때. 9D 5를 이용 하 여 항 체와 JUNV의 Candid1 # 백신 긴장, confocal 현미경 검사 법 기반 프로토콜은 dsRNA, 바이러스 성 단백질 및 PRR에 arenavirus에 의해 감염 된 세포에 동시에 시각화를 성공적으로 사용 된이 보고서에 설명 BSL2 실험실입니다. 프로토콜 또한 세포내의 분포 dsRNA와 PRR BSL4 시설에서 병원 성 arenavirus 감염 시의 시각화를 위해 적당 하다.

Protocol

1. 준비 A549 세포 및 JUNV 감염의 폴 리-D-리 (PDL)에 시드 2 x 105 인간 폐 상피 A549 세포 감염 이전 24 시간에 유리 coverslips 12-잘 접시에 코팅. JUNV13 감염 (MOI)의 곱셈에서의 150 mL의 aliquots 단위를 형성 하는 Dulbecco의 수정이 글의 중간 (DMEM) 미디어 2% 태아 둔감 한 혈 청 (FBS)와 1% 페니실린과 스 (P/S 보충에 희석 셀당 1.0 플 라크의 준비 ). 세포 배양에서 미디어…

Representative Results

이 프로토콜 배포 및 colocalization는 RLRs 사이 연구에 적용 된 (장비-어 MDA-5) 및 JUNV에 감염 된 세포에 dsRNA. 그림 1 과 그림 2에서 같이, dsRNA의 축적 바이러스 감염 진행으로 시간이 지남에 따라 증가 합니다. MDA-5 (그림 1) 및 장비를 집중-(그림 2) 신호는 NP의 dsRNA punctate 구조와 colocalized 발…

Discussion

긍정적인 감 RNA 바이러스 및 dsDNA 바이러스, dsRNA J2 안티 dsRNA 널리 사용 항 체로 쉽게 검색 됩니다. 그러나, 부정적인 감 RNA 바이러스는 dsRNA 동일한 항 체2를 사용 하 여 감지 수준 이하로 낮은 생산 하는으로 추정 된다. 따라서, 바이러스 성 RNA 및 PRR 상호 작용의 여러 측면 크게 부정적인 감 RNA 바이러스에 대 한 명확 하지 않다. 우리는 dsRNA J2 항 체를 사용 하 여 arenavirus 감염에 대 …

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

우리는 UTMB 이미징 핵심 시설과 Maxim Ivannikov 현미경 지원에 감사 하 고 싶습니다.

이 작품은 공중 보건 서비스에 의해 지원 되었다 RO1AI093445 및 RO1AI129198 및 수 여에 SP, UTMB 지 펀드 P84373 채널, T32 AI007526 그들을 부여.

Materials

APEX Alexa Fluor 647 antibody labeling kit Invitrogen A10475
BSA Sigma Aldrich A4503
DAPI Cell Signaling 4083 1:1,000 dilution
Donkey-anti rabbit Alexa Fluor 594 Invitrogen A-11058 1:2,000 dilution; Lot #: 1454437
Dulbecco's modified Eagle's medium Corning 10-013-CV
Fetal Bovine Serum Atlanta Bio S11150
Glass microscope slides Fisher 12-550-15
Goat-anti mouse Alexa Fluor 488 Invitrogen A-11029 1:2000 dilution; Lot #: 1874804
Human lung epithelial A549 cells ATCC CCL-185
Methanol Fisher A412 Stored at -20 °C
Mouse MAb anti-JUNV NP BEI NA05-AG12 Conjugated to Alexa-647 at 1:1,000 dilution
Mouse MAb pan-Enterovirus 9D5 Reagent Millipore Sigma 3361 ready for use; diluted to 1:2; Lot #: 3067445
PBS supplemented with Ca and Mg Corning 21-030-CV
PDL Coated coverslips Neuvitro H-12-1.5-pdl
ProLong Gold antifade Invitrogen P10144
Rabbit MAb MDA-5 Abcam ab126630 1:250 dilution; Lot #: GR97758-7
recombiant Candid#1 strain of JUNV Lab generated Lab generated As previously described in reference 13.
RIG-I mouse MAb conjugated to Alexa-594 Santa Cruz sc-376845 1:1000 dilution; Lot #: AO218
Triton X-100 Sigma Aldrich T8787 

References

  1. Jensen, S., Thomsen, A. R. Sensing of RNA viruses: a review of innate immune receptors involved in recognizing RNA virus invasion. Journal of Virology. 86, 2900-2910 (2012).
  2. Weber, F., Wagner, V., Rasmussen, S. B., Hartmann, R., Paludan, S. R. Double-stranded RNA is produced by positive-strand RNA viruses and DNA viruses but not in detectable amounts by negative-strand RNA viruses. Journal of Virology. 80, 6 (2006).
  3. Triantafilou, K., Vakakis, E., Kar, S., Richer, E., Evans, G. L., Triantafilou, M. Visualisation of direct interaction of MDA5 and the dsRNA replicative intermediate form of positive strand RNA viruses. Journal of Cell Science. 125, 4761-4769 (2012).
  4. Onomoto, K., et al. Critical role of an antiviral stress granule containing RIG-I and PKR in viral detection and innate immunity. PLoS One. 7, e43031 (2012).
  5. Son, K. N., Liang, Z., Lipton, H. L. Double-stranded RNA is detected by immunofluorescence analysis in RNA and DNA virus infections, including those by negative-sense RNA viruses. Journal of Virology. 89, 9383-9392 (2015).
  6. Mateer, E. J., Paessler, S., Huang, C. Visualization of double-stranded RNA colocalizing with pattern recognition receptors in arenavirus infected cells. Frontiers Cellular and Infection Microbiology. 8, 251 (2018).
  7. Buchmeier, M. J., de la Torre, J. C., Peters, C. J., Knipe, D. M., Howley, P. M. Arenavirdae: The viruses and their replication. Fields Virology. 2, (2006).
  8. Levis, S. C., et al. Endogenous interferon in Argentine hemorrhagic fever. The Journal of Infectious Diseases. 149, 428-433 (1984).
  9. Levis, S. C., et al. Correlation between endogenous interferon and the clinical evolution of patients with Argentine hemorrhagic fever. Journal of Interferon Research. 5, 383-389 (1985).
  10. Huang, C., et al. Highly pathogenic new world and old world human arenaviruses induce distinct interferon response in human cells. Journal of Virology. 89, 7079-7088 (2015).
  11. Huang, C., et al. Junin virus infection activates the type I interferon pathway in a RIG-I-dependent manner. PLoS Neglected Tropical Diseases. 6, e1659 (2012).
  12. Huang, C., Kolokoltsova, O. A., Mateer, E. J., Koma, T., Paessler, S. Highly pathogenic new world arenavirus infection activates the pattern recognition receptor protein kinase R without attenuating virus replication in human cells. Journal of Virology. 91, 20 (2017).
  13. Emonet, S. F., et al. Rescue from cloned cDNAs and in vivo characterization of recombinant pathogenic Romero and live-attenuated Candid#1 strains of Junin virus, the causative agent of Argentine hemorrhagic fever disease. Journal of Virology. 85 (4), 1473-1483 (2011).
  14. Child, S. J., et al. Antagonism of the protein kinase R pathway in human cells by Rhesus Cytomegalovirus. Journal of Virology. 92, 6 (2018).
  15. Hobro, A. J., Smith, N. I. An evaluation of fixation methods: Spatial and compositional cellular changes observed by Raman imaging. Vibrational Spectroscopy. 91, 31-45 (2017).
check_url/cn/59095?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Mateer, E., Paessler, S., Huang, C. Confocal Imaging of Double-Stranded RNA and Pattern Recognition Receptors in Negative-Sense RNA Virus Infection. J. Vis. Exp. (143), e59095, doi:10.3791/59095 (2019).

View Video