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Gleichzeitige Zuordnung und Quantifizierung der Purine im menschlichen mitochondrialen DNA
JoVE 杂志
生物学
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JoVE 杂志 生物学
Simultaneous Mapping and Quantitation of Ribonucleotides in Human Mitochondrial DNA
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Gleichzeitige Zuordnung und Quantifizierung der Purine im menschlichen mitochondrialen DNA

DOI:
10.3791/56551-v

•

12:35 min

•

November 14, 2017

•

, ,
1Department for Medical Biochemistry and Cell Biology,University of Gothenburg, 2Department of Biology and Biological Engineering,Chalmers University of Technology

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:55HincII Treatment and Alkaline Hydrolysis
  • 04:115′-End Phosphorylation
  • 05:21Single Strand DNA Ligation
  • 06:35Second Strand Synthesis
  • 08:23PCR Amplification, Library Analysis and Pooling
  • 10:10Results: Simultaneous Quantitation and Genome-wide Mapping of Ribonucleotides
  • 11:39Conclusion

Summary

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Hier beschreiben wir eine Methode zugänglich gleichzeitig quantitate und genomweite Karte Purine in höchst intakte DNA bei Einzel-Nukleotid-Auflösung, Kombination von enzymatischen Spaltung von genomischer DNA mit seinen alkalische Hydrolyse und anschließende 5´-Ende Sequenzierung.

Tags

Keywords: Mitochondrial DNARibonucleotidesDNA IntegrityDNA ReplicationDNA RepairHeLa CellsHincIIParamagnetic Beads70% EthanolPotassium HydroxidePotassium ChlorideSodium Acetate

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