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Ottenere dati trascrittomi di alta qualità dai semi di cereali con un metodo modificato per la profilazione dell'espressione genica
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Obtaining High-Quality Transcriptome Data from Cereal Seeds by a Modified Method for Gene Expression Profiling
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Ottenere dati trascrittomi di alta qualità dai semi di cereali con un metodo modificato per la profilazione dell'espressione genica

DOI:
10.3791/60602-v

•

07:18 min

•

May 21, 2020

•

, , ,
1Department of Chemistry and Biotechnology,Swinburne University of Technology, 2Department of Molecular Genetics, Heterosis Research Group,Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), 3Grain Quality and Nutrition Center, Applied Functional Genomics Cluster,International Rice Research Institute

Kapitel

  • 00:04Introduction
  • 00:40Microarray Hybridization
  • 03:09Microarray Scanning
  • 05:05Results: Representative Transcriptome Data Analyses
  • 06:39Conclusion

Summary

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Viene presentato un metodo per la profilazione trascrittoma dei cereali. La profilazione dell'espressione genica basata su microarray inizia con l'isolamento dell'RNA totale di alta qualità dai cereali e continua con la generazione di cDNA. Dopo l'etichettatura cRNA e l'ibridazione dei microarray, vengono fornite raccomandazioni per il rilevamento del segnale e il controllo della qualità.

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Keywords: Microarray HybridizationGene Expression ProfilingCereal SeedsTranscriptome DataHigh-throughput SequencingBlocking AgentFragmentation MixHybridization BufferMicroarray SlideHybridization AssemblyHybridization Oven

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