La desdiferenciación de condrocitos hialinos en condrocitos fibroblásticos acompaña a menudo la expansión monocapa de condrocitos in vitro . El nivel global de metilación del ADN de los condrocitos se considera un biomarcador adecuado para la pérdida del fenotipo de los condrocitos. Sin embargo, los resultados basados en diferentes métodos experimentales pueden ser inconsistentes. Por lo tanto, es importante establecer un método preciso, simple y rápido para cuantificar los niveles globales de metilación del ADN durante la desdiferenciación de los condrocitos.
Las técnicas actuales de análisis de metilación en todo el genoma se basan en gran medida en la secuenciación genómica del bisulfito. Debido a la degradación del ADN durante la conversión de bisulfito, estos métodos requieren típicamente un gran volumen de muestra. Otros métodos utilizados para cuantificar los niveles globales de metilación del ADN incluyen la cromatografía líquida de alto rendimiento (HPLC). Sin embargo, la HPLC requiere digestión completa del ADN genómico. Además, el costo prohibitivo de la HPLC enLimita la aplicación más amplia de HPLC.
En este estudio, el ADN genómico (gDNA) se extrajo de condrocitos humanos cultivados con un número variable de pasajes. El nivel de metilación de gDNA se detectó usando un ensayo dot blot de metilación específica. En este enfoque dot blot, una mezcla de gDNA que contenía el ADN metilado a detectar se colocó directamente sobre una membrana N + como un punto dentro de un patrón de plantilla circular previamente dibujado. Comparado con otros enfoques basados en electroforesis en gel y otros procedimientos de transferencia de material complejos, el método dot blot ahorra tiempo significativo. Además, las manchas de puntos pueden detectar el nivel de metilación del ADN global usando un anticuerpo de 5 mC comercialmente disponible. Encontramos que el nivel de metilación del ADN difería entre los subcultivos monocapa, y por lo tanto podría desempeñar un papel clave en la desdiferenciación condrocitos. El punto blot de 5 mC es un método confiable, simple y rápido para detectar el nivel general de metilación del ADN a evaluarE fenotipo de condrocito.