David Fenyo Laboratory of Mass Spectrometry and Gaseous Ion Chemistry Rockefeller University Biography Publications Institution JoVE Articles David Fenyo has not added a biography. If you are David Fenyo and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications The GPMDB REST Interface Bioinformatics (Oxford, England). Feb, 2015 | Pubmed ID: 25697819 Use of ENCODE Resources to Characterize Novel Proteoforms and Missing Proteins in the Human Proteome Journal of Proteome Research. Feb, 2015 | Pubmed ID: 25369122 Pathway Analysis and Transcriptomics Improve Protein Identification by Shotgun Proteomics from Samples Comprising Small Number of Cells--a Benchmarking Study BMC Genomics. 2014 | Pubmed ID: 25521637 A Robust Pipeline for Rapid Production of Versatile Nanobody Repertoires Nature Methods. Dec, 2014 | Pubmed ID: 25362362 Super-resolution Imaging Reveals That Loss of the C-terminus of Connexin43 Limits Microtubule Plus-end Capture and NaV1.5 Localization at the Intercalated Disc Cardiovascular Research. Nov, 2014 | Pubmed ID: 25139742 Ischemia in Tumors Induces Early and Sustained Phosphorylation Changes in Stress Kinase Pathways but Does Not Affect Global Protein Levels Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Jul, 2014 | Pubmed ID: 24719451 Integrated Chromosome 19 Transcriptomic and Proteomic Data Sets Derived from Glioma Cancer Stem-cell Lines Journal of Proteome Research. Jan, 2014 | Pubmed ID: 24266786 Super-resolution Fluorescence Microscopy of the Cardiac Connexome Reveals Plakophilin-2 Inside the Connexin43 Plaque Cardiovascular Research. Nov, 2013 | Pubmed ID: 23929525 Developments in Biobanking Workflow Standardization Providing Sample Integrity and Stability Journal of Proteomics. Dec, 2013 | Pubmed ID: 23856607 Atypical and Classical Memory B Cells Produce Plasmodium Falciparum Neutralizing Antibodies The Journal of Experimental Medicine. Feb, 2013 | Pubmed ID: 23319701 A Chromosome-centric Human Proteome Project (C-HPP) to Characterize the Sets of Proteins Encoded in Chromosome 17 Journal of Proteome Research. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23259914 Chromosome 19 Annotations with Disease Speciation: a First Report from the Global Research Consortium Journal of Proteome Research. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23249167 Comparative Proteomic Analysis of the ATP-sensitive K+ Channel Complex in Different Tissue Types Proteomics. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23197389 Strategy for Identifying Dendritic Cell-processed CD4+ T Cell Epitopes from the HIV Gag P24 Protein PloS One. 2012 | Pubmed ID: 22860026 Sequenz Und Strukturelle Konvergenz Der Breite Und Starke HIV-Antikörper, Die CD4-Bindung Zu Imitieren Science (New York, N.Y.). Sep, 2011 | Pubmed ID: 21764753 Hoher Kapazität Ionenfalle Kopplung Mit Einer Time-of-Flight-Massenspektrometer Für Umfassende Verknüpfte Scannt Mit Keine Scan-Verluste International Journal of Mass Spectrometry. Mar, 2011 | Pubmed ID: 21516228 Modellierung Von Massen-Spektrometrie-basierte Proteinanalytik Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2011 | Pubmed ID: 21082431 Modellierung Experimentelles Design Für Proteomics Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 20835802 Protein-Quantisierung Mit Massenspektrometrie Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 20835801 Massenspektrometrische Protein Identifikation Mit Der Globalen Proteom-Maschine Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 20835799 Asien Oceania Human Proteome Organisation Membrane Proteomics Initiative. Herstellung Und Charakterisierung Der Norm Membran Karbonat-gewaschen Proteomics. Nov, 2010 | Pubmed ID: 20486120 GINS Bewegung Zeigt, Dass Die Replikation Gabel Fortschreiten Hefegenoms Bemerkenswert Einheitlich Ist Molecular Systems Biology. 2010 | Pubmed ID: 20212525 Ringversuch Studie Charakterisierung Einer Hefe-Leistungsstandard Für LC-MS-Plattform-Performance-benchmarking Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Feb, 2010 | Pubmed ID: 19858499 Sensible Schnellanalytik Cystein Reichen Peptid-Gift-Komponenten Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2009 | Pubmed ID: 19380747 Vier Histon-Varianten Markieren Die Grenzen Der Polycistronic Transkription Einheiten in Trypanosoma Brucei Genes & Development. May, 2009 | Pubmed ID: 19369410 Bewertung Der Variationen Probenvorbereitung Für Vergleichende Proteomics Mit Stabilen Isotop Kennzeichnung Von Aminosäuren in Der Zellkultur Journal of Proteome Research. Mar, 2009 | Pubmed ID: 19140678 Screening Für EphB Signalisierung Effektoren Mit SILAC Mit Einem Linearen Ionenfalle-Orbitrap-Massenspektrometer Journal of Proteome Research. Nov, 2008 | Pubmed ID: 18816084 Validierung Von Endogenen Peptid-Identifikationen, Die Mit Eine Datenbank Von Massenspektren Tandem Journal of Proteome Research. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18549260 Effiziente Ermittlung Der Phosphorylierung Von Massenspektrometrischen Phosphopeptide Fingerabdruck Analytical Chemistry. Apr, 2008 | Pubmed ID: 18321079 Schnelle Isolierung Und Identifizierung Der Bakteriophage T4-codierte Modifikationen Von Escherichia Coli RNA Polymerase: Eine Generische Methode Bakteriophage/Host-Interaktionen Zu Studieren Journal of Proteome Research. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18271525 Verwendung Von DNA-Leitern Für Reproduzierbare Protein Fraktionierung Von Natrium Natriumdodecylsulfat-Sulfat-Polyacrylamid Gel-Elektrophorese (SDS-PAGE) Für Quantitative Proteomik Journal of Proteome Research. Feb, 2008 | Pubmed ID: 18189343 Informatik Entwicklung: Herausforderungen Und Lösungen Für Die MALDI-Massenspektrometrie Mass Spectrometry Reviews. Jan-Feb, 2008 | Pubmed ID: 17979143 Eine Automatisierte Methode Zum Scannen Von LC-MS Daten Legt Für Bedeutende Peptide Und Proteine, Einschließlich Quantitativer Profilierung Und Interaktive Bestätigung Journal of Proteome Research. Jul, 2007 | Pubmed ID: 17559249 Verbesserung Der Die Erfolgsquote Der Proteomanalyse Durch Modellierung Protein-Fülle-Distributionen Und Experimentellen Designs Nature Biotechnology. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17557102 Neuropeptidomics Strategien Für Spezifische Und Empfindliche Identifizierung Von Endogenen Peptiden Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Jul, 2007 | Pubmed ID: 17401030 Bestimmung Des Gesamten Verdienstordens Protein Identifizierung Von Datensätzen: Rho-Diagramme Und Rho-Resultate Journal of Proteome Research. May, 2007 | Pubmed ID: 17397212 Erkennung Von Artefakten Und Peptid-Modifikationen in Flüssige Chromatographie/Masse-Spektrometrie-Daten Mithilfe Von Zweidimensionalen Signal Intensität Daten Kartenvisualisierung Rapid Communications in Mass Spectrometry : RCM. 2006 | Pubmed ID: 16628601 Reproduzierbarkeit Der LC-MS-basierte Protein-Identifikation Journal of Experimental Botany. 2006 | Pubmed ID: 16551682 SwePep, Eine Datenbank Für Endogene Peptide Und Massenspektrometrie Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Jun, 2006 | Pubmed ID: 16501280 Optimierung Von Suchbedingungen Für Die Fingerabdruck-basierten Massen-Identifizierung Von Proteinen Proteomics. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16485258 Eine Auswertung, Vergleich, Und Genau Das Benchmarking Von Mehreren öffentlich Zugänglichen MS / MS-Suchalgorithmen: Sensitivität Und Spezifität Analyse Proteomics. Aug, 2005 | Pubmed ID: 16047398 Proteinidentifizierung in Komplexen Mischungen Journal of Proteome Research. Mar-Apr, 2005 | Pubmed ID: 15822914 Phosphotyrosine Signalnetzwerke in Epidermalen Wachstumsfaktor-Rezeptor überexprimieren, Plattenepithelkarzinom-Zellen Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Apr, 2005 | Pubmed ID: 15657067 Proteinsequenzen Mit PROWL Zu Finden Current Protocols in Bioinformatics / Editoral Board, Andreas D. Baxevanis ... [et Al.]. Oct, 2004 | Pubmed ID: 18428719 Einen Proteomics-Ansatz Zum Studium Der Resorption, Verteilung, Stoffwechsel, Ausscheidung Und Toxizität Journal of Biomolecular Techniques : JBT. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15585823 Die Statistische Signifikanz Der Ergebnisse Proteinidentifizierung Als Funktion Der Anzahl Von Proteinsequenzen Gesucht Journal of Proteome Research. Sep-Oct, 2004 | Pubmed ID: 15473685 Redlichkeit: Ein Protein Identifikationsalgorithmus Genaue Zuordnung Der Statistischen Signifikanz Der Ergebnisse Journal of Proteome Research. Jan-Feb, 2004 | Pubmed ID: 14998160 Ein Verfahren Zur Beurteilung Der Statistischen Signifikanz Der Massenspektrometrie-basierten Protein-Identifikationen Mit Allgemeinen Scoring-Systeme Analytical Chemistry. Feb, 2003 | Pubmed ID: 12622365 Eine Modulare Vernetzung Ansatz Für Die Erkundung Protein-Interaktionen Journal of the American Chemical Society. Mar, 2003 | Pubmed ID: 12603129 Informatik Und Datenmanagement in Der Proteomik Trends in Biotechnology. Dec, 2002 | Pubmed ID: 12570158 Ein Muster Von Zufälligen Masse-Passungs Und Seine Verwendung Für Die Automatisierte Signifikanztests Für Die Massenspektrometrische Proteomanalyse Proteomics. Mar, 2002 | Pubmed ID: 11921442 Radar, Ein Bioinformatik-Lösung, Die Proteom-massenspektrometrischen Analyse Automatisiert, Optimiert Die Identifizierung Von Proteinen, Und Archiviert Die Daten in Einer Relationalen Datenbank Proteomics. Jan, 2002 | Pubmed ID: 11788990 MALDI-Probenvorbereitung: Die Ultra Thin-Layer-Methode David Fenyo1, Qingjun Wang1, Jeffrey A. DeGrasse1, Julio C. Padovan1, Martine Cadene1, Brian T. Chait1 1Laboratory of Mass Spectrometry and Gaseous Ion Chemistry, Rockefeller University JoVE 192 Biologie
MALDI-Probenvorbereitung: Die Ultra Thin-Layer-Methode David Fenyo1, Qingjun Wang1, Jeffrey A. DeGrasse1, Julio C. Padovan1, Martine Cadene1, Brian T. Chait1 1Laboratory of Mass Spectrometry and Gaseous Ion Chemistry, Rockefeller University JoVE 192 Biologie