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Article de méthode

Imagerie chimique bioorthogonale du métabolisme cellulaire régulé par les acides aminés aromatiques

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DOI :

10.3791/65121

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12 mai 2023

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* These authors contributed equally

Dans cet article

Résumé

Nous présentons un protocole pour visualiser directement les activités métaboliques dans les cellules régulées par les acides aminés à l’aide de la microscopie à diffusion Raman stimulée sondée (DO-SRS) à oxyde de deutérium (eau lourde D2O), intégrée à la microscopie à fluorescence d’excitation à deux photons (2PEF).

Résumé

Les acides aminés aromatiques essentiels (AAA) sont des éléments constitutifs pour synthétiser de nouvelles biomasses dans les cellules et maintenir des fonctions biologiques normales. Par exemple, un approvisionnement abondant en AAA est important pour que les cellules cancéreuses maintiennent leur croissance et leur division rapides. Avec cela, il y a une demande croissante pour une approche d’imagerie hautement spécifique et non invasive avec une préparation minimale des échantillons pour visualiser directement comment les cellules exploitent les AAA pour leur métabolisme in situ. Ici, nous développons une plate-forme d’imagerie optique qui combine le sondage d’oxyde de deutérium (D2O) avec la diffusion Raman stimulée (DO-SRS) et intègre DO-SRS avec fluorescence d’excitation à deux photons (2PEF) dans un seul microscope pour visualiser directement les activités métaboliques des cellules HeLa sous régulation AAA. Collectivement, la plateforme DO-SRS fournit une résolution spatiale et une spécificité élevées des protéines et des lipides nouvellement synthétisés dans des unités cellulaires HeLa uniques. En outre, la modalité 2PEF peut détecter les signaux d’autofluorescence du nicotinamide adénine dinucléotide (NADH) et de la flavine d’une manière sans marqueur. Le système d’imagerie décrit ici est compatible avec les modèles in vitro et in vivo , ce qui est flexible pour diverses expériences. Le flux de travail général de ce protocole comprend la culture cellulaire, la préparation des milieux de culture, la synchronisation cellulaire, la fixation cellulaire et l’imagerie d’échantillons avec les modalités DO-SRS et 2PEF.

Introduction

Étant des acides aminés aromatiques essentiels (AAA), la phénylalanine (Phe) et le tryptophane (Tryp) peuvent être absorbés par le corps humain pour synthétiser de nouvelles molécules pour maintenir des fonctions biologiques normales1. Phe est nécessaire pour la synthèse des protéines, de la mélanine et de la tyrosine, tandis que Tryp est nécessaire pour la synthèse de la mélatonine, de la sérotonine et de la niacine 2,3. Cependant, une consommation excessive de ces AAA peut réguler positivement la cible mammifère de la voie de la rapamycine (mTOR), inhiber la protéine kinase activée pa....

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Protocole

1. Préparation des médias

  1. Préparer 10 mL de contrôle et d’AAA en excès dans le milieu Eagle modifié (DMEM) de Dulbecco contenant 50 % deD2O.
    1. Pour le milieu témoin, mesurer et mélanger 10 mg de poudre de DMEM avec 4,7 mL d’eau bidistillée (ddH2O) dans un tube conique de 15 mL. La poudre DMEM contient tous les acides aminés à des concentrations standard. Bien vorter et inverser le tube pour s’assurer que la solution est bien mélangée. Ajouter 4,7 mL deD2O, 0,5 mL de sérum bovin fœtal (FBS à 5 %) et 0,1 mL de pénicilline/streptomycine (1 %). Bien vorter et inverser le tube pour s’assurer que la solution e....

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Résultats

L’ajout d’un excès d’AAA à des concentrations de 15x dans les milieux de culture cellulaire contenant 50 % de D2O a produit des bandes Raman C-D distinctes de lipides et de protéines nouvellement synthétisés dans les cellules HeLa (Figure 2B). Des expériences antérieures ont été réalisées avec différents niveaux de concentration, tels que 2x et 5x, et bien que les données ne soient pas présentées, la concentration 15x a produit les bandes Raman C-D les plus distinctes de lipides e.......

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Discussion

L’imagerie DO-SRS et 2PEF a été appliquée pour étudier la dynamique métabolique dans divers modèles ex vivo, y compris la drosophile et les tissus humains 21,22,23,24,26,27,33. La modalité d’imagerie utilisée dans cette étude intègre la microscopie DO-SRS et 2PEF, qui peut devancer .......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs n’ont pas d’intérêts financiers concurrents ou d’autres conflits d’intérêts.

Remerciements

Nous remercions le Dr Yajuan Li et Anthony Fung pour leur soutien technique, et le laboratoire Fraley pour la lignée cellulaire. Nous reconnaissons les fonds de démarrage de UCSD, NIH U54CA132378, NIH 5R01NS111039, NIH R21NS125395, NIHU54DK134301, NIHU54 HL165443 et Hellman Fellow Award.

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
Pipettes sérologiques de 10 ml  ;Avantor (by VWR)75816-100https://us.vwr.com/store/product?keyword=75816-100
Tube à centrifuger conique de 15 mLVWR89039-664https://mms.mckesson.com/product/1001859/VWR-International-89039-664
16 % de formaldéhyde, sans méthanolThermoFisher Scientific28906https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/28906
plaqueà 24 puitsFisherbrandFB0112929https://www.fishersci.com/shop/products/24-well-tc-multidish-100-cs/FB012929#?keyword=FB012929
Filtre à seringue de 25 mm, 2 & m PESFoxx Life Sciences381-2216-OEMhttps://www.foxxlifesciences.com/collections/pes-syringe-filters/products/381-2216-oem?variant=16274336003
460 nm Filtre CubeOlympusOCT-ET460/50M32
Adaptateurs secteur de l’alimentation pour LD OBIS 6 Laser RemoteOlympusAlimentation du laser
passe-bandeFiltre KR ElectronicsKR27248 MHz
Terminaison BNC 50 Ohm  ;Mini CircuitsSTRM-50
Câble BNCThorlabs2249-CCâble coaxial, BNC mâle/mâle
Miroir diélectrique à large bandeThorlabsBB1-E03750 - 1100 nm
Centrifugeuse
CondenseurOlympus
Cover GlassCorning2850-25https://ecatalog.corning.com/life-sciences/b2b/NL/en/Glassware/Cover-Glass/Corning%C2%AE-Square-%231%C2%BD-Cover-Glass/p/2850-25
Alimentation DCTopWard6302D
Dichroïque MountThorlabsKM100CL
Dimethyl Sulfoxide Cell Culture Reagentmpbio  ;196055https://www.mpbio.com/0219605525-dimethyl-sulfoxide-cf
l’aigle modifié de Dulbecco s Medium sans méthionine, thréonine et pyruvate de sodiumMilliporeSigma38210000https://www.usbio.net/media/D9800-22/dulbeccorsquos-mem-dmem-wsodium-bicarbonate-wo-methionine-threonine-sodium-pyruvate-powder
Avec du bicarbonate de sodium et sans méthionine, thréonine et pyruvate de sodium.
Dulbecco' s Aigle modifié' s MediumCorningMT10027CVhttps ://www.fishersci.com/shop/products/dmem-dulbecco-s-modified-eagle-s-medium-4/MT10027CV# :~ :text=Dulbecco’s %20Modified %20Eagle’s %20Medium %20
FIJI ImageJImageJVersion 1.53t 24 août 2022https://imagej.net/software/fiji/downloads
Eau lourde (oxyde de deutérium)Cambridge Isotope Laboratories, Inc.7732-18-5https://shop.isotope.com/productdetails.aspx?itemno=DLM-4-1L
Hela CellsATCCCCL-2https://www.atcc.org/products/ccl-2
HémocymètreMilliporeSigmaZ359629-1EAhttps://www.sigmaaldrich.com/US/en/product/sigma/z359629?gclid=Cj0KCQiA37KbBhDgARIsAI
zce15A5FIy0WS7I6ec2KVk
QPXVMEqlAnYis_bKB6P6lr
SIZ-wAXOyAELIaAhhEEAL
w_wcB& gclsrc=aw.ds
Filtre passe-bande à haute ouvertureChroma TechnologyET890/220mFiltrer le faisceau de Stokes et transmettre le faisceau de pompe
HyClone Fetal Bovin Serum (FBS)Cytiva  ;SH300880340https://www.fishersci.com/shop/products/hyclone-fetal-bovine-serum-u-s-standard-4/SH300880340
HyClone Trypsine 0,25 % (1x) SolutionCytivaSH30042,02https://www.cytivalifesciences.com/en/us/shop/cell-culture-and-fermentation/reagents-and-supplements/cell-disassociation-reagents/hyclone-trypsin-protease-p-00445
Système laser SRS intégréPhysique appliquée & Électronique, Inc.picoEMERALDpicoEMERALD fournit une impulsion de sortie à 1031 nm avec une largeur d’impulsion de 6 ps et un taux de répétition de 80 MHz, qui sert de faisceau de Stokes.  ; Le faisceau doublé de fréquence à 532 nm est utilisé pour amorcer de manière synchrone un oscillateur paramétrique optique picoseconde (OPO) afin de produire un train d’impulsions à mode verrouillé avec une largeur d’impulsion de cinq ~ 6 ps (le faisceau de renvoi de l’OPO est bloqué par un filtre interférométrique). La longueur d’onde de sortie de l’OPO est réglable à partir de 720&ndash ; 950 nm, qui sert de faisceau de pompe. L’intensité du faisceau Stokes de 1031 nm est modulée de manière sinusoïdale par une EOM intégrée à 8 MHz avec une profondeur de modulation supérieure à 90 %. Le faisceau de la pompe est superposé spatialement avec le faisceau de Stokes en utilisant un miroir dichroïque à l’intérieur de picoEMERALD. Le chevauchement temporel entre la pompe et les impulsions de Stokes est obtenu à l’aide d’un étage de retard intégré et optimisé par le signal SRS de D2O pur au microscope.
Microscope à balayage laser inverséOlympusFV1200MPE
IX3-CBH Boîtier de commandeOlympusContrôler le microscope à balayage laser
Monture miroir cinématiqueThorlabsPOLARIS-K1-2AH2 Ajusteurs hexagonaux à profil bas
L-PhenalynineSigmaP5482-25Ghttps://www.sigmaaldrich.com/US/en/product/sigma/p5482
L-TryptophaneSigmaT8941-25Ghttps://www.sigmaaldrich.com/US/en/product/sigma/t8941
LabSpec 6Horiba XploRAN/AAmplificateur https://www.horiba.com/gbr/scientific/products/detail/action/show/Product/labspec-6-spectroscopy-suite-software-1843/
Lock-InZurich InstrumentsN/Ahttps://www.zhinst.com/americas/en/products/shfli-lock-in-amplifier
Séparateur de faisceau dichroïque passe-longSemrockDi02-R980-25x36980 nm laser BrightLine séparateur de faisceau dichroïque plat laser-unilatéral
MATLABMathWorksVersion : R2022bhttps://www.mathworks.com/products/new_products/latest_features.html
Lames de microscopeFisherbrand12-550-003https://www.fishersci.com/shop/products/fisherbrand-selectfrost-microscope-slides-9/12550003#?keyword=12-550-003
Logiciel d’imagerie microscopiqueOlympusFluoView
MPLN 100x, OlympusOlympusMPLAPONhttps://www.olympus-ims.com/en/microscope/mplapon/#!cms[focus]=cmsContent11364
MPLN 50x, OlympusOlympusMPLAPON  ;https://www.olympus-ims.com/en/microscope/mplapon/#!cms[focus]=cmsContent11363
Condenseur d’huile NAOlympus  ;6-U130https://www.hitechinstruments.com/Product-Details/olympus-achromatic-aplanatic-high-na-condneser
Vernis à onglesWet n WildB01EO2G5O4https://www.amazon.com/dp/B01EO2G5O4/ref=cm_sw_r_api_i_E609VVDWW
HHQP38FXXDC_0
OriginOriginLabOrigin 2022b (9.95)https://www.originlab.com/index.aspx?go=PRODUCTS/Origin
ParafilmFisherScientific S37440https://www.fishersci.com/shop/products/parafilm-m-wrapping-film-3/p-2379782
PBS 1x (solution saline tamponnée au phosphate de Dulbecco)Thermofischer - Gibco14040117https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/14040117?SID=srch-hj-14040117
Pénicilline/StreptomycineThermofischer - Gibco15140122https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/15140122
PeriscopeAssembly ThorlabsRS99Comprend les unités supérieure et inférieure, & Oslash ; Poteau de 1" et fourche de serrage.
picoEmerald SystemA.P.EN/A
Boîtier blindé https://www.ape-berlin.de/en/cars-srs/ avec connecteurs BNC PomonaElectronics2902Boîtier en aluminium avec couvercle, détecteur de photodiodes BNC femelle/femelle
Si Construità la maisonN/ADYI
Entretoises de plaquettes
Grace Bio-Labs654008https://gracebio.com/product/secureseal-imaging-spacers-654008/
Spectroscopie Raman spontanéeHoriba XploRAN/Ahttps://www.horiba.com/int/products/detail/action/show/Product/xploratm-plus-1528/
Microscopie à diffusion Raman stimuléeConstruit à domicileN/A
Touch  ; Contrôleur de panneauOlympusContrôlez la direction X-Y du microscope à balayage laser
Trypan Blue 0,4 % (0,85 % NaCl)  ;Lonza17-942Ehttps://bioscience.lonza.com/lonza_bs/US/en/Culture-Media-and-Reagents/p/000000000000181876/Trypan-Blue%2C-0-4%25-Solution"
Pince à épilerKaverme - AmazonB07RNVXXV1https://www.amazon.com/Precision-Anti-Static-Electronics-Laboratory-Jewelry-Making/dp/B07RNVXXV1"
Microscopie à fluorescence à excitation à deux photons Papier de peséeN/Aà la maison
  ;VWR12578-165https://us.vwr.com/store/product/4597617/vwr-weighing-paper
Zurich LabOneQ SoftwareZurich InstrumentsContrôler l’amplificateur à verrouillage de Zurich
série de siliciumconstruit

Références

  1. Wu, G. Functional amino acids in nutrition and health. Amino Acids. 45 (3), 407-411 (2013).
  2. Wei, Z., Liu, X., Cheng, C., Yu, W., Yi, P. Metabolism of amino acids in cancer. Frontiers in Cell and Developmental Biology. 8, 603837(2020).
  3. Parthasarathy, A., et al.

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Réimpressions et autorisations

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