O presente protocolo descreve o método de análise da flora intestinal utilizando o sequenciamento do gene 16S rRNA baseado em Illumina e fornece uma estrutura para avaliar a eficácia de decocções fitoterápicas.
A fim de explorar preliminarmente os efeitos de Desmodium caudatum sobre a gastrite e flora intestinal em ratos, um modelo de gastrite crônica em ratos foi estabelecido usando o método clássico de salicilato de sódio. Dezoito ratos com FPS foram divididos em três grupos: grupo controle (Grupo C), grupo modelo (Grupo M) e grupo tratamento (Grupo T). Cortes anatomopatológicos da parede gástrica foram retirados dos ratos de cada grupo. Além disso, as concentrações de gastrina e malondialdeído no soro dos ratos de cada grupo foram determinadas por ELISA. Adicionalmente, os efeitos de D. caudatum na flora intestinal de ratos com gastrite foram explorados através de uma comparação detalhada das comunidades bacterianas intestinais nos três grupos, empregando o sequenciamento do gene 16S rRNA baseado em Illumina. Os resultados indicaram que a decocção de D. caudatum pode reduzir o conteúdo de malondialdeído e aumentar o conteúdo de gastrina. Além disso, a decocção de D. caudatum aumentou a diversidade e abundância da flora intestinal, exercendo um impacto positivo no tratamento da gastrite, regulando e restaurando a flora intestinal.
A gastrite crônica (DC), uma das doenças clínicas mais comuns, caracteriza-se por alterações inflamatórias crônicas e persistentes no epitélio da mucosa gástrica, que é frequente e repetidamente atacado por vários fatorespatogênicos1. A taxa de incidência de CG ocupa o primeiro lugar entre todos os tipos de doenças estomacais, sendo responsável por 40% a 60% da taxa de atendimento ambulatorial do Departamento de Gastroenterologia2. Além disso, a taxa de incidência geralmente aumenta com a idade, especialmente em indivíduos de meia-idade e mais velhos3. Sem dúvida, o GC reduz significativamente a qualidade de vida das pessoas, enfatizando a necessidade crítica de descoberta de novos agentes terapêuticos.
Inúmeros estudos relatam que a ocorrência e o desenvolvimento do CG estão ligados à secreção de hormônios gastrintestinais, como a gastrina (GAS)4,5. GAS, um hormônio peptídeo gastrointestinal comum no trato digestivo, estimula as células a secretar ácido gástrico, promovendo a liberação de histamina dos eosinófilos. Além disso, melhora a nutrição e o suprimento sanguíneo da mucosa gástrica, promovendo a proliferação da mucosa gástrica e das células parietais6. Portanto, a gastrina pode ser utilizada como um indicador para avaliar o nível de desenvolvimento do GC. Além disso, produtos de peroxidação lipídica desencadeados por óxidos reativos podem ativar células inflamatórias, levando ao CG. Malondialdeído (MDA), um marcador de peroxidação lipídica, é um indicador comumente usado para medir o grau de estresse oxidativo. Reflete o nível de radicais livres na mucosa gástrica até certo ponto. O nível de MDA pode indicar o ataque de ácidos graxos insaturados na mucosa gástrica local causado por radicais livres 7,8.
A microecologia intestinal consiste em milhões de microrganismos que residem no intestino do hospedeiro, desempenhando um papel vital na manutenção da saúde do hospedeiro e na regulação da imunidade do hospedeiro. Uma flora intestinal saudável, caracterizada por alta riqueza, diversidade e função estável da microbiota, atua como barreira protetora contra a invasão de microrganismos patogênicos pela participação no metabolismo. Distúrbios na flora intestinal tornam os indivíduos mais suscetíveis a doenças gastrointestinais agudas ecrônicas9,10. Nos últimos anos, a terapia da microbiota para doenças gastrintestinais progrediu rapidamente e demonstrou eficácia significativa11. Em resumo, a consideração da flora intestinal é crucial na compreensão e abordagem das doenças gastrointestinais.
Como componente indispensável do tesouro da medicina tradicional chinesa, os materiais medicinais populares têm grande importância para a prática clínica e a modernização da medicina nacional. As raízes e partes inteiras de Desmodium caudatum (Thunb.) DC. tem sido amplamente utilizado para aliviar o desconforto estomacal na área de Beichuan Qiang da cidade de Mianyang por um longo período. Alguns artigos indicam a base científica para o tratamento de doenças gastrointestinais com D. caudatum, citando seus efeitos como hemostasia, antioxidante e proteção gastrointestinal 12,13,14. No entanto, devido à falta de pesquisas aprofundadas, nenhum mecanismo farmacodinâmico clínico foi estabelecido. Este artigo tem como objetivo estudar os efeitos de D. caudatum no tratamento de gastrites com base em hormônios gastrintestinais e flora intestinal, fornecendo uma base para sua aplicação clínica racional.
D. caudatum, uma medicina popular comumente utilizada pela nacionalidade Qiang12, tem demonstrado eficácia significativa no tratamento de doenças gastrointestinais. Com o avanço das pesquisas farmacológicas modernas, o desequilíbrio da flora resultante do desequilíbrio da microecologia gastrointestinal é identificado como um fator-chave nas doenças gastrointestinais agudas ecrônicas22,23. Certos micro-organismos no trato …
The authors have nothing to disclose.
Este trabalho foi financiado pelos principais projetos de P&&D do Departamento de Ciência e Tecnologia da Província de Sichuan (2020YFS0539).
Alpha diversity analysis | Mothur 1.30.2 | ||
AxyPrep deoxyribonucleic acid (DNA) gel extraction kit | Axygen Biosciences | AP-GX-50 | |
Beta diversity analysis | Qiime 1.9.1 | ||
Cryogenic refrigerator | Forma-86C ULT freezer | ||
Desmodium caudatum | The Traditional Chinese Medicine Hospital of Beichuan Qiang Autonomous County | ||
E.Z.N.A. soil kit | Omega Bio-tek | D5625-01 | |
Illumina MiSeq Platform | Illumina Miseq PE300/NovaSeq PE250 | ||
Multiskan Spectrum | spectraMax i3 | ||
OTU clustering | Uparse 7.0.1090 | ||
OTU statistics | Usearch 7.0 | ||
PCR instrument | TransGen AP221-02 | ||
PCR instrument | ABI GeneAmp 9700 | ||
QuantiFluor-ST double-stranded DNA (dsDNA) system | Promega Corp. | ||
Sequence classification annotation | RDP Classifier 2.11 | ||
Sodium salicylate | Sichuan Xilong Chemical Co., Ltd | 54-21-7 | |
SPF rats | Chengdu Dashuo Experimental Animal Co., Ltd | ||
SPSS 18.0 | IBM |