/
/
ExCYT: Een grafische gebruikersinterface voor het stroomlijnen van de analyse van High-dimensionale Cytometry gegevens
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu. Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
1The Bloomberg~Kimmel Institute for Cancer Immunotherapy,Johns Hopkins University School of Medicine, 2The Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center,Johns Hopkins University School of Medicine, 3Department of Biomedical Engineering,Johns Hopkins University School of Medicine, 4Department of Immunology,Johns Hopkins University School of Medicine, 5Department of Pathology,Johns Hopkins University School of Medicine
Chapitres
- 00:04Titre
- 00:24t-SNE Distributed Stochastic Neighbor Embedding (SNE)
- 01:30Cluster Analysis, Filtration, and Visualization
- 03:22Results: Representative Recapitulation of Myeloid and Lymphoid Sub-Population Data
- 04:53Conclusion
ExCYT is een MATLAB gebaseerde grafische User Interface (GUI) waarmee gebruikers hun stroom cytometry om gegevens te analyseren via algemeen gebruikte analytische technieken voor high-dimensional data waaronder dimensionaliteit vermindering via t-GND, een aantal handmatige en geautomatiseerde Clustering van de methoden, heatmaps en roman high-dimensionale stroom percelen.
