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FDR 제어 기반 비표적 메타볼로임에 대한 식별 및 정량화의 통합 워크플로우
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An Integrated Workflow of Identification and Quantification on FDR Control-Based Untargeted Metabolome
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FDR 제어 기반 비표적 메타볼로임에 대한 식별 및 정량화의 통합 워크플로우

DOI:
10.3791/63625-v

•

05:35 min

•

September 20, 2022

•

, , ,
1Key Laboratory of Functional Protein Research of Guangdong Higher Education Institutes and MOE Key Laboratory of Tumor Molecular Biology, Institute of Life and Health Engineering, College of Life Science and Technology,Jinan University, 2Chi-Biotech Co. Ltd.

Chapitres

  • 00:05Introduction
  • 01:07Preparing Metabolomics Datasets
  • 02:21Metabolite Identification and Differential Analysis
  • 03:49Results: Quantitative Analysis by MetaX
  • 04:52Conclusion

Summary

Traduction automatique

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우리는 XY-Meta와 metaX를 함께 통합하는 표적화되지 않은 대사 산물 워크 플로우를 구축했습니다. 이 프로토콜에서는 XY-Meta를 사용하여 오픈 액세스 스펙트럼 참조에서 데코이 스펙트럼 라이브러리를 생성하는 방법을 표시 한 다음 FDR 제어를 수행하고 대사체 스펙트럼을 확인한 후 metaX를 사용하여 대사 산물을 정량화했습니다.

Tags

FDR ControlUntargeted MetabolomeXY-MetaTarget-decoy StrategyMetabolite IdentificationFalse Positive ReductionBiomarker DiscoveryGNPS DatabaseProteoWizardRaw Data ConversionNIST LibraryXY-Meta ProgramMetaX SoftwareQuantitative AnalysisPCA PlotPeak Annotation

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