Journal
/
Biochimie
/
Um fluxo de trabalho integrado de identificação e quantificação no metabolome não-alvo baseado em controle FDR
Journal JoVE
Biochimie
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Biochimie
An Integrated Workflow of Identification and Quantification on FDR Control-Based Untargeted Metabolome

Um fluxo de trabalho integrado de identificação e quantificação no metabolome não-alvo baseado em controle FDR

DOI:
10.3791/63625-v

•

05:35 min

•

September 20, 2022

•

, , ,
1Key Laboratory of Functional Protein Research of Guangdong Higher Education Institutes and MOE Key Laboratory of Tumor Molecular Biology, Institute of Life and Health Engineering, College of Life Science and Technology,Jinan University, 2Chi-Biotech Co. Ltd.

Chapitres

  • 00:05Introduction
  • 01:07Preparing Metabolomics Datasets
  • 02:21Metabolite Identification and Differential Analysis
  • 03:49Results: Quantitative Analysis by MetaX
  • 04:52Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

Construímos um fluxo de trabalho metabolômico não-acompanhado que integrou XY-Meta e metaX juntos. Neste protocolo, exibimos como usar o XY-Meta para gerar uma biblioteca espectral chamariz a partir da referência de espectro de acesso aberto e, em seguida, executamos o controle FDR e usamos o metaX para quantificar os metabólitos depois de identificar o espectro metabolômico.

Tags

FDR ControlUntargeted MetabolomeXY-MetaTarget-decoy StrategyMetabolite IdentificationFalse Positive ReductionBiomarker DiscoveryGNPS DatabaseProteoWizardRaw Data ConversionNIST LibraryXY-Meta ProgramMetaX SoftwareQuantitative AnalysisPCA PlotPeak Annotation

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

Um método simples para High Throughput Screening químico em Caenorhabditis Elegans

Identificação da quinase Cyclin-dependente 1 sítios de fosforilação específica por uma quinase In Vitro do ensaio

Quantificação de hipopigmentação atividade In Vitro

Quantificação da coenzima A em células e tecidos

Uma plataforma integrada de espectroscopia e espectrometria de massa para estudar a absorção, metabolismo e efeitos de drogas unicelulares

Análise de metabolômica baseada em espectrometria líquida não direcionada

Fluxo de trabalho e ferramentas para triagem de fragmentos cristalográficos no Helmholtz-Zentrum Berlin

Avaliando o efeito dos pesticidas nas larvas das abelhas solitárias

Quantificação da Distribuição de Glicogênio Subcelular em Fibras Musculares Esqueléticas usando Microscopia eletrônica de transmissão

Deciphering Molecular Mechanism of Histone Assembly by DNA Curtain Technique

Read Article