Summary

Modulação molecular por shRNAs específicos entregues por lentivírus em neurônios estressados do retículo endoplasmático

Published: April 24, 2021
doi:

Summary

No presente estudo, a expressão é derrubada de dois componentes sinalizadores a jusante da via PERK, a calcineurina citoprotetora e o CHOP pró-apoptótico, utilizando shRNAs específicos. De maneiras opostas, eles modulam a suscetibilidade dos neurônios corticais primários à atrofia da neurite após a indução do estresse do retículo endoplasmático.

Abstract

O acúmulo de proteínas desdobradas dentro do retículo endoplasmático (RE), causado por qualquer condição de estresse, desencadeia a resposta proteica desdobrada (UPR) através da ativação de sensores especializados. UPR tenta primeiro restaurar a homeostase; mas se o dano persistir, a sinalização induz a apoptose.

Há evidências crescentes de que o estresse ER sustentado e não resolvido contribui para muitas condições patológicas, incluindo doenças neurodegenerativas. Como a RPU controla o destino celular alternando entre processos citoprotetores e apoptóticos, é essencial entender os eventos que definem essa transição, bem como os elementos envolvidos em sua modulação.

Recentemente, demonstramos que o acúmulo anormal de gangliosídeos GM2 causa o esgotamento do conteúdo de ER Ca2+ , que por sua vez ativa a PERK (PKR-like-ER quinase), um dos sensores UPR. Além disso, a sinalização PERK participa da atrofia neurítica e da apoptose induzida pelo acúmulo de GM2. A este respeito, estabelecemos um sistema experimental que nos permite modular molecularmente a expressão de componentes PERK a jusante e, assim, alterar a vulnerabilidade dos neurônios para sofrer atrofia neurítica.

Realizamos knockdown da expressão de calcineurina (citoprotetora) e CHOP (pró-apoptótica) em culturas neuronais corticais de ratos. As células foram infectadas com shRNA específico entregue por lentivírus e, em seguida, tratadas com GM2 em diferentes momentos, fixadas e imunocoradas com anticorpo anti-MAP2 (proteína 2 associada a microtubos). Posteriormente, as imagens celulares foram registradas usando um microscópio de fluorescência e o crescimento total de neuritos foi avaliado usando o software de processamento de imagens de domínio público ImageJ. A inibição da expressão desses componentes de sinalização PERK claramente tornou possível acelerar ou retardar a atrofia neurítica induzida pelo estresse do RE.

Essa abordagem pode ser usada em modelos de sistema celular de estresse de RE para avaliar a vulnerabilidade dos neurônios à atrofia de neuritos.

Introduction

O estresse do retículo endoplasmático (RE) é definido como qualquer perturbação que comprometa a capacidade de dobramento de proteínas na organela. O acúmulo de proteínas desdobradas dentro do lúmen do ER ativa um sinal de cascata de transdução chamado resposta proteica desdobrada (UPR). Esta via de sinalização complexa é orquestrada por três sensores de estresse: PERK (proteína quinase RNA [PKR]-like ER quinase), IRE1 (enzima 1 que requer inositol) e ATF6 (fator de transcrição ativado 6). Todos juntos tentam restaurar a homeostase. Mas se o estresse persistir, a RPU eventualmente induz a morte celular por apoptose1.

PERK, uma proteína transmembrana de RE, sob estresse de RE, lidera a fosforilação do fator de iniciação eucariótico-2 alfa (eIF2α), reduzindo a síntese proteica global e, portanto, a carga proteica no RE2. Demonstramos que a calcineurina A/B (CNA/B), um heterodímero Ca2+ fosfatase, liga-se diretamente ao domínio citosólico da PERK, aumentando sua autofosforilação e aumentando significativamente a inibição da tradução de proteínas e a viabilidade celular 3,4. Curiosamente, o CNA/B é abundante no cérebro de mamíferos, distinguindo duas isoformas da subunidade A do CN: α e β.

Sob estresse sustentado do RE, a via de sinalização PERK é o único ramo UPR que permanece ativado, mediando assim tanto a resposta pró-sobrevivência quanto a resposta apoptótica. Na fase crônica, um dos principais eventos a jusante é a indução do fator de transcrição, CHOP (CCAAT/enhancer binding protein homóloga protein)5. O estresse crônico do RE também é cada vez mais reconhecido como um contribuinte comum para uma extensa gama de distúrbios patológicos, incluindo doenças neurodegenerativas6. É importante compreender como a RPU pode facilitar a sinalização citoprotetora em vez da morte celular 7. No entanto, atualmente pouco se sabe sobre o mecanismo exato que controla a transição entre essas duas fases da RPU.

Recentemente, descobrimos que, em neurônios cultivados, o gangliosídeo GM2 se acumula nas membranas do RE e induz a depleção de cálcio luminal. Isso, por sua vez, ativa a sinalização PERK, que medeia a atrofia neurítica e a apoptose 8. Neste estudo, o acúmulo de GM2 em neurônios cultivados é usado como um modelo de sistema celular de atrofia de neurite induzida por estresse de ER. Especificamente, duas expressões do fator PERK são manipuladas, CN-Aα e CHOP, o que alterna a transição entre eventos precoces/protetores e uma fase crônica/apoptótica. Para conseguir isso, os respectivos genes são silenciados; assim, as culturas primárias de neurônios corticais são infectadas com shRNA específico entregue por lentivírus. A análise de Western blot revela uma redução significativa dos níveis de expressão de CN-Aα e CHOP em comparação com as células de controle, que estão infectadas com lentivírus que carregam um shRNA embaralhado. Após esse tratamento, os neurônios são submetidos a diferentes tempos de incubação de GM2 exógeno, fixo e imunocorado com anticorpo anti-proteína 2 associada a microtúbulos (MAP2)9. As imagens são obtidas com um microscópio de epifluorescência. O crescimento total de neuritos é avaliado em relação ao número total de células.

Protocol

Os procedimentos animais são realizados seguindo protocolos aprovados pelo Instituto Nacional de Saúde Guia para o Cuidado e Uso de Animais de Laboratório. A aprovação para a realização do estudo é concedida pelo Comitê de Ética e Cuidado Animal (CICUAL) do INIMEC-CONICET-UNC (Resoluções nºs 014/2017 B e 006/2017 A). 1. Culturas primárias de neurônios corticais de ratos Anestesiar ratas E18 Wistar prenhes em uma câmara de CO 2 com uma mistura de 80% de CO2 …

Representative Results

Aqui, abordamos a questão de saber se o silenciamento de dois componentes PERK a jusante afeta a fase de transição da UPR em um modelo de célula de estresse ER. Para conseguir isso, silenciamos o gene CN-Aα, bem como o gene CHOP por duas sequências específicas de shRNA para cada um (Tabela 1) em cultura de células de neurônios primários por 1 dia10. A expressão é analisada por Western blotting (Figura 1 e <strong class="xf…

Discussion

Descrevemos um sistema experimental que permite a modulação molecular da transição das fases de sobrevida para UPR apoptótica em um modelo celular neuronal.

Para uma análise adequada da atrofia neurítica, é essencial a obtenção de culturas primárias de neurônios com processos numerosos, longos e altamente ramificados 9,11. Isso facilita o exame da extensão do processo dos neurônios, permitindo que as diferenças claras en…

Divulgazioni

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Agradecemos ao Dr. Gonzalo Quasollo por sua inestimável ajuda com imagens e à Dra. Andrea Pellegrini pelo suporte técnico de cultura celular.

Esta pesquisa foi apoiada por bolsas de: National Institute of Health, EUA (#RO1AG058778-01A1, Subaward Agreement No 165148/165147 entre UTHSCSA-Instituto Investigación Médica M y M Ferreyra) e da Agência Nacional de Promoção Científica e Tecnológica, Argentina (ANPCyT, PICT 2017 #0618).

Materials

Alexa Fluor 488 anti-Mouse Thermo Fisher Scientific #R37120
anti-CHOP Thermo Fisher # MA1 – 250
Anti-CN-Aα Millipore # 07-067
Anti-GM2 Matreya #1961
anti-MAP2 Sigma Aldrich # M2320
anti-β-actin Thermo Fisher # PA1 – 183
aprotinin Santa Cruz Biotechnology #3595
Axiovert 200 epifluorescence microscope Zeiss
B27 supplement Life Technologies #17504944
Dulbecco's Modified Eagle's Medium (DMEM) Life Technologies #11966025
EcoRI Promega #R6011
Fetal Calf Serum (FCS) Life Technologies #16000044
Fine-tippeds forceps  style #5 Dumont
Forcep style #3 Dumont
HEK 293 ATCC #CRL-1573
IRDye 680 CW secondary antibody LI-COR Biosciences #92632221
IRDye 680 secondary antibody LI-COR Biosciences #92632220
IRDye 800 CW secondary antibody LI-COR Biosciences #92632210
IRDye 800 CW secondary antibody LI-COR Biosciences #92632211
lentiviral envelope plasmid pMD2.G Addgene #12259
lentiviral packing plasmid psPAX2 Addgene #12260
lentiviral vector pLKO.3G Addgene #14748
Leupeptin hemisulfate Santa Cruz Biotechnology #295358
Lipofectamine LTX & Plus Reagent (plasmid transfection reagent) Life Technologies #A12621
MISSION shRNA Sigma Aldrich
Monosialoganglioside GM2 Matreya #1502
NanoDrop 2000 Thermo Scientific
Neurobasal Medium Life Technologies #21103049
Nitrocellulose membrane 0.45 µm BIO-RAD #1620115
Odyssey infrared imaging system LI-COR Bioscience
OneShot Top 10 Life Technology #C404010
Opti-MEM (Reduced serum media) Life Technologies #105802
PacI BioLabs #R0547S
penicillin-streptomycin Life Technologies #15140122
Pepstatin A Santa Cruz Biotechnology #45036
phenylmethylsulfonyl fluoride Santa Cruz Biotechnology #329-98-6
Poly-L-lysine sigma aldrich P#2636
Straight sharp small spring scissors Fine Science Tools
T4 DNA Ligase Promega #M1801
Trypsin-EDTA 0.25 % Life Technologies #25200056
Vibra-Cell Ultrasonic Liquid Processor (VCX 130) Sonics
Wizard plus SV Minipreps DNA purification system Promega #A1330

Riferimenti

  1. Schroder, M., Kaufman, R. J. The mammalian unfolded protein response. Annual Review of Biochemistry. 74, 739-789 (2005).
  2. Cui, W., Li, J., Ron, D., Sha, B. The structure of the PERK kinase domain suggests the mechanism for its activation. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography. 67, 423-428 (2011).
  3. Bollo, M., et al. Calcineurin interacts with PERK and dephosphorylates calnexin to relieve ER stress in mammals and frogs. PLoS One. 5, 11925 (2010).
  4. Chen, Y., Holstein, D. M., Aime, S., Bollo, M., Lechleiter, J. D. Calcineurin beta protects brain after injury by activating the unfolded protein response. Neurobiology of Disease. 94, 139-156 (2016).
  5. Harding, H. P., et al. An integrated stress response regulates amino acid metabolism and resistance to oxidative stress. Molecular Cell. 11, 619-633 (2003).
  6. Hetz, C., Saxena, S. ER stress and the unfolded protein response in neurodegeneration. Nature Reviews Neurology. 13, 477-491 (2017).
  7. Lin, J. H., Li, H., Zhang, Y., Ron, D., Walter, P. Divergent effects of PERK and IRE1 signaling on cell viability. PLoS One. 4, 4170 (2009).
  8. Virgolini, M. J., Feliziani, C., Cambiasso, M. J., Lopez, P. H., Bollo, M. Neurite atrophy and apoptosis mediated by PERK signaling after accumulation of GM2-ganglioside. Biochimica et Biophysica Acta – Molecular Cell Research. 1866, 225-239 (2019).
  9. Ferreira, A., Busciglio, J., Landa, C., Caceres, A. Ganglioside-enhanced neurite growth: evidence for a selective induction of high-molecular-weight MAP-2. The Journal of Neuroscience. 10, 293-302 (1990).
  10. Moore, C. B., Guthrie, E. H., Huang, M. T., Taxman, D. J. Short hairpin RNA (shRNA): design, delivery, and assessment of gene knockdown. Methods in Molecular Biology. 629, 141-158 (2010).
  11. Kaech, S., Banker, G. Culturing hippocampal neurons. Nature Protocols. 1, 2406-2415 (2006).
  12. Rusnak, F., Mertz, P. Calcineurin: form and function. Physiological Reviews. 80, 1483-1521 (2000).
  13. Hogan, P. G., Chen, L., Nardone, J., Rao, A. Transcriptional regulation by calcium, calcineurin, and NFAT. Genes & Development. 17, 2205-2232 (2003).
  14. Endo, M., Mori, M., Akira, S., Gotoh, T. C/EBP homologous protein (CHOP) is crucial for the induction of caspase-11 and the pathogenesis of lipopolysaccharide-induced inflammation. Journal of Immunology. 176, 6245-6253 (2006).

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Citazione di questo articolo
Morales, C., Bisbal, M., Bollo, M. Molecular Modulation by Lentivirus-Delivered Specific shRNAs in Endoplasmic Reticulum Stressed Neurons. J. Vis. Exp. (170), e61974, doi:10.3791/61974 (2021).

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